Першина Елизавета Владимировна

  • Першина Елизавета Владимировна

    Информация о преподавателе

    Першина Елизавета Владимировна

    Тематика самостоятельной научно-исследовательской (творческой) деятельности по направленности (профилю) подготовки аспирантов

    Е.В. Першина проводит исследования в области микробиологического мониторинга почв, исследования разнообразия ризосферных микроорганизмов с использованием метагеномных технологий.

    Преподавательская деятельность (в том числе работа со студентами)

    Является автором курса «Метагеномика микроорганизмов» для студентов 2 курса магистратуры СПбГУ, руководит написанием выпускной квалификационной работы 1 бакалавра.

    Публикации в ведущих отечественных рецензируемых научных журналах и изданиях (статьи за последние 5 лет)

    1. Першина Е.В., Андронов Е.Е., Самосоров Г.Г., Семенов А.Н. Генное досье микробиома //Наука из первых рук. 2013. Т. 49. № 1. С. 68-75.     
    2. Чирак Е.Л., Першина Е.В., Дольник А.С., Кутовая О.В., Василенко Е.С., Когут Б.М., Мерзлякова Я.В., Андронов Е.Е. Таксономическая структура микробных сообществ в почвах различных типов по данным высокопроизводительного секвенирования библиотек гена 16S-рРНК //Сельскохозяйственная биология. 2013. № 3. С. 100-109. 
    3. Першина Е.В., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Лошакова К.А., Андронов Е.Е. Концепция таксономического пространства и интегральная оценка сдвигов в структуре микробныхсообществ по данным анализа библиотек гена 16S-рРНК //Сельскохозяйственная биология. 2013. № 4. С. 76-87.
    4. Думова В.А., Першина Е.В., Мерзлякова Я.В., Круглов Ю.В., Андронов Е.Е. Основные тенденции в формировании почвенного микробного сообщества в условиях стационарного полевого опыта по данным высокопроизводительного секвенирования библиотек гена 16S-рРНК //Сельскохозяйственная биология. 2013. № 5. С. 85-92.     
    5. Андронов Е.Е., Петрова С.Н., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Рахимгалиева С.Ж., Ахмеденов К.М., Горобец А.В., Сергалиев Н.Х. Изучение структуры микробного сообщества почв разной степени засоления с использованием t-RFLP и ПЦР с детекцией в реальном времени //Почвоведение. 2012. № 2. С. 173.          
    6. Дольник А.С., Тамазян Г.С., Першина Е.В., Вяткина К.В., Порозов Ю.Б., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е. Концепция универсальной таксономической системы бактерий: эволюционное пространство гена 16S-рРНК V. 1.0 //Сельскохозяйственная биология. 2012. № 5. С. 112-120.     
    7. Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования //Экологическая генетика. 2012. Т. 10. № 2. С. 32-40.
    8. М.Ю. Скопина, Е.В. Першина, А.В. Пиневич. Разнообразие малочисленности: феномен редкой биосферы // Микробиология. В печати.
    9. Першина Е.В., Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Ахтемова Г.А., Думова В.А., Проворов Н.А. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов днк для изучения динамики почвенных микробных сообществ в условиях воздействия ксенобиотиков //Сельскохозяйственная биология. 2011. № 3. С. 81-87.
    10. Андронов Е.Е., Иванова Е.А., Першина Е.В., Орлова О.В., Круглов Ю.В., Белимов А.А., Тихонович И.А. Анализ показателей почвенного микробиома в процессах, связанных с почвообразованием, трансформацией органического вещества и тонкой регуляции вегетационных процессов // Бюллетень Почвенного института им. В.В. Докучаева. 2015. № 80. С. 83-94.

    Публикации в зарубежных рецензируемых научных журналах и изданиях (статьи за последние 5 лет)

     

    1. Pershina E., Valkonen J., Kurki P., Ivanova E., Chirak E., Korvigo I., Provorov N., Andronov E. Comparative Analysis of Prokaryotic Communities Associated with Organic and Conventional Farming Systems // PLoS ONE. DOI: 10.1371/journal.pone.0145072
    2. Pershina E., Andronov E., Pinaev A., Provorov N. Recent advances and perspectives in metagenomic studies of soil microbial communities. In: Malik A., Grohmann E., Alves M. (Eds) Management of the microbial resources in the environment. Berlin: Springer, 2013. P. 141-166.
    3. Pershina E.V., Dolnik A.S., Tamazyan G.S., Vyatkina K.V., Porozov Y.B., Pinaev A.G., Karimov S.O., Provorov N.A., Andronov E.E. The Evolutionary Space Model to be Used for the Metagenomic Analysis of Molecular and Adaptive Evolution in the Bacterial Communities. In: Pontarotti P. (Ed) Evolutionary Biology: Genome Evolution, Speciation, Coevolution and Origin of Life. Switzerland: Springer International Publishing, 2014. P. 339-355.
    4. Skopina M., , Pershina E., Andronov E,  Vasileva A., Averina S., Gavrilova O., Ivanikova N., Pinevich A. Diversity of Lake Ladoga (Russia) bacterial plankton inferred from 16S rRNA gene pyrosequencing: An emphasis on picocyanobacteria // Journal of Great Lakes Research. 2014. http://dx.doi.org/10.1016/j.jglr.2014.11.030

     

    Апробация результатов научно-исследовательской (творческой) деятельности на национальных и международных конференциях

    Активно представляет результаты на ведущих отечественных и международных конференциях. За 2013-2015 гг. принимала участие в следующих конференциях: VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, 15-20 июня 2014 г., Ростов-на-Дону, Россия, диплом I степени за лучший пленарный доклад; 17th EBM (Evolutionary Biology Meeting), 17-20 сентября 2013 г., Марсель, Франция, премия (публикации в сборнике) за пленарный доклад; VII Московский международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития», 19-22 марта 2013 г., Москва, Россия, устный доклад; Научно-практическая конференция «Дни экологического просвещения в Санкт-Петербурге», 28.09 – 01.10.2015, Санкт-Петербург, Россия (устный доклад); Ecology of soil Microorganisms 2015; 29.11. - 3.12. 2015 г., Прага, Чехия (постерный доклад).

    Награды

    Премия правительства РФ в области науки и техники для молодых ученых за разработку молекулярно генетического подхода к микробиологической  оценке  здоровья и  ресурсного  потенциала почв России

Подписаться на рассылку ВНИИСХМ

Что будем искать?