Афонин Алексей Михайлович

  • Афонин Алексей Михайлович

    Сроки обучения

    С 01.09.2016 по 01.09.2020

    Реквизиты приказа о зачислении в аспирантуру

    Приказ №14-а от 18.08.2016

    Форма обучения

    внебюджетная, очная

    Направление

    06.06.01 – Биологические науки

    Профиль направления

    03.02.03 – Микробиология

    Научный руководитель

    к.б.н., Жуков Владимир Александрович

    Тема диссертации

    Идентификация генетических факторов Rhizobium Leguminosarum, способствующих расширению круга растений-хозяев 

    (утверждена на Ученом совете 02.11.2016, протокол №4)

    Лаборатория Генетики растительно-микробных взаимодействий

    Образование

    Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра микробиологии, 2016 г.

    Специальность по диплому

    Магистр биологии

    Область научных интересов

    Микробиология, генетика

     

    Сведения о личных достижениях

       Участие в конференциях 

    1. Постер на 19-ой Международной Пущинской школе-конференции молодых ученых.
    2. Устный доклад на 20-ой Международной Пущинской школе-конференции молодых ученых. Пущино, Москва, 20-24 апреля, 2016.
    3. Постер на конференции Plant Biology Europe EPSO/FESPB 2016. Prague, Czech republic, Clarion congress centre June 26-30, 2016. P. 109.
    4. Постер на конференции 12th European Nitrogen Fixation Conference. 25-28 August 2016, Budapest, Hungary.

      Участие в конкурсах и олимпиадах 

    1. 2013 год - третье место на международной биологической универсиаде, Москва.
    2. 2014 год - второе место на всероссийском биотурнире, Пущино, Москва
    3. 2014 год - Второе место на международной биологической универсиаде, Москва.
    4. 2014 год - Лауреат ректорской стипендии СПбГУ.
    5. 2015 год - Диплом за лучший стендовый доклад (1-е место) на секции Микробиология и Вирусология. 19-ая Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых. Пущино, Москва, 20-24 апреля, 2015. (Прил. 10)
    6. 2015 год - 2е место в личном зачете на международном турнире естественных наук, Санк-Петербург
    7. 2015 год - третье место на международной биологической универсиаде (английская секция), Москва
    8. 2016 год - диплом за лучший устный доклад (2-е место) на секции Микробиология и Вирусология. 20-ая Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых. Пущино, Москва, 20-24 апреля, 2016.

      Публикации: 

    1. Афонин А.М., Новоселова Н.Н., Сулима А.С.. Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Борисов А.Ю., Тихонович И.А. Выделение и идентификация эндофитных бактерий, обладающих потенциально полезными свойствами, из тканей различных линий гороха посевного (Pisum sativum L.). Пущино, Москва, 20-24 апреля, 2015 С.159.
    2. Afonin A.M., Sulima A.S., Akhtemova G.A., Zhukov V.A., Borisov A.Yu., Tikhonovich I.A. Isolation and identification of pea endophytic bacteria possessing agronomically beneficial traits from a number of pea genetic lines. Abstract book of the international conference «Genetic integration of pro eukaryotes and eukaryotes: basic research and modern agricultural technologies» Devoted to the 85th anniversary of All-Russian Research Institute for Agricultural Microbiology (ARRIAM). St.Petersburg Scientific Centre оf Russian Academy оf Sciences, June 24-27, 2015, P.129
    3. Akhtemova G., Afonin A., Novoselova N., Zhukov V., Borisov A., Tikhonovich I. Culturable endophytic bacteria of pea (Pisum sativum L.). Book of Abstracts 8th Congress of the International Symbiosis Society. Lisbon, Portugal; 12-18 July, 2015 P.1532
    4. Akhtemova G.A., Zhernakov A.I., Afonin A.M., Loshakova K.A., Merzlyakova Ya.V., Zhukov V.A., Borisov A.Yu., Tikhonovich I.A. Structure of rhizospheric microbial communities in different substrates. Abstract book of the international conference «Genetic integration of proeukaryotes and eukaryotes:basic research and modern agricultural technologies» Devoted to the 85th anniversary of All-Russian Research Institute for Agricultural Microbiology (ARRIAM). St. Petersburg Scientific Centre оf Russian Academy оf Sciences, June 24-27, 2015, P.130.
    5. Афонин А. М., Сулима А. С., Ахтемова Г. А., Жуков В. А. Поиск генетических детерминант,определяющих симбиотический потенциал природных штаммов Rhizobium leguminosarum bv. Viceae Пущино, Москва, 20-24 апреля, 2016 С.7.
    6. Васильева Е.Н., Афонин А.М., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Борисов Ю.А., Тихонович И.А. Коллекция культивируемых бактерий гороха посевного (Pisum sativum L.) Пущино, Москва, 20-24 апреля, 2016 С.12.
    7. Хайруллина М.М., Штарк О.Ю., Федорина Я.В., Сулима А.С., Афонин А.М., Тихонович И.А. Ген гороха sym36, необходимый для развития арбускул и проникновения арбускулярно-микоризных грибов и клубеньковых бактерий в эпидермис, – предполагаемый ортолог гена vapyrin. Пущино, Москва, 20-24 апреля, 2016 С.160.
    8. A. M. Afonin, A. S. Sulima, G. A. Akhtemova, A. I. Zhernakov, V. A. Zhukov, I. A. Tikhonovich Characterization of non-nodulation suppressing strains of Rhizobium leguminosarum bv. Viceae. Abstract book of the international congress Plant Biology Europe EPSO/FESPB 2016. Prague, Czech republic, Clarion congress centre June 26-30, 2016. P. 109

     

    Результаты освоения ОП

    Блок 1- «Дисциплины»

    - Базовая часть:

    «История и философия науки» (144/4)  - хорошо (29.05.2017)                    

    «Иностранный язык» 

      Английский язык (72/2) - зачет (25.05.2017)

     

    - Вариативная часть:

      Дисциплины (модули), направленные на подготовку к сдаче кандидатского экзамена

     «Педагогика и психология высшей школы» (108/3) - отлично (24.12.2016)

    «Современная экономическая теория» (72/2) - хорошо (04.06.2018)   

    «Информационные технологии в науке и образовании» (72/2) - хорошо (17.12.2016)

    «Использование методов системного анализа в научных исследованиях» (72/2)- хорошо (07.06.2018)                                      

    «Генетика микроорганизмов» (108/3) - зачет (28.12.2017)                                          

    «Симбиоз и симбиогенез» (108/3)                                           

    «Микробиология» (108/3)

                                         

     Дисциплины (модули) по выбору:

     «Метагеномика растительно-микробных систем» (108/3)                                         

    «Биотехнология агроценозов» (108/3)   

     

    Блок 2- «Практики»

    «Педагогическая  практика» (216/6)

    «Научно-исследовательская практика» (108/3)

     

    Блок 3- «Научные исследования»

    «Научно-исследовательская работа» (7020/195)

     

    Блок 4- «Государственная итоговая аттестация»

    «Государственная итоговая аттестация» (324/9)            

     

    Кандидатские экзамены

    История и философия науки  (144/4)  - хорошо (29.05.2017)                                      

    Английский язык (108/3) - отлично (22.12.2017)

    Микробиология  (108/3)

                                                              

    Список статей

         1. Alzheimer’s disease: as it was in the beginning //Reviews in the Neurosciences.

           Kozlov S., Afonin A., Evsyukov, I., & Bondarenko, A. – 2017. – Т. 28. – №. 8. – С. 825-843.

    2. ИДЕНТИФИКАЦИЯ И ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕННОГО СЕМЕЙСТВА, КОДИРУЮЩЕГО NCR-ПЕПТИДЫ ГОРОХА ПОСЕВНОГО (PISUM SATIVUM L.)
    Клюкова М.С., Афонин А.М., Жуков В.А., Тихонович И.А.
    В книге: Биология - наука XXI века. Сборник тезисов. 2017. С. 103.

    3. ГЕН ГОРОХА ПОСЕВНОГО SYM31 УПРАВЛЯЕТ ДИФФЕРЕНЦИРОВКОЙ БАКТЕРИЙ ВНУТРИ СИМБИОТИЧЕСКИХ КЛУБЕНЬКОВ
    Сулима А.С., Афонин А.М., Жернаков А.И., Жуков В.А., Тихонович И.А.
    В книге: Биология - наука XXI века. Сборник тезисов. 2017. С. 121.

    4. РАЗНООБРАЗИЕ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ ЭНДОФИТНЫХ БАКТЕРИЙ ГОРОХА ПОСЕВНОГО (PISUM SATIVUM L)
    Васильева Е.Н., Афонин А.М., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Борисов А.Ю., Тихонович И.А.
    В книге: ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ БИОЛОГИЯ РАСТЕНИЙ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ И ПРИКЛАДНЫЕ АСПЕКТЫ. Годичное собрание Общества физиологов растений России, Научная конференция и школа молодых ученых: Сборник материалов докладов. Федеральное агентство научных организаций, Российская академия наук, Общество физиологов растений России, Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН, Крымский федеральный университет им. В.И. Вернадского, Центр содействия научной, образовательной и просветительской деятельности «Соцветие». 2017. С. 12.

    5. РАЗНООБРАЗИЕ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ ЭНДОФИТНЫХ БАКТЕРИЙ ГОРОХА ПОСЕВНОГО PISUM SATIVUM L
    Васильева Е.Н., Афонин А.М., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Борисов А.Ю., Тихонович И.А.
    В книге: Биология - наука XXI века. Сборник тезисов. 2017. С. 12.

    6. TRANSCRIPTOMIC STUDIES IN NON-MODEL PLANTS: CASE OF PISUM SATIVUM L. AND MEDICAGO LUPULINA L
    Kulaeva O.A., Afonin A.M., Zhernakov A.I., Tikhonovich I.A., Zhukov V.A.
    Вкниге: Applications of RNA-Seq and Omics Strategies - From Microorganisms to Human Health. Croatia, 2017. С. 227-243.

    7. ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ ГОРОХА ПОСЕВНОГО ПРИ ДЕЙСТВИИ ХЛОРИДА КАДМИЯ
    Кулаева О.А., Жернаков А.И., Афонин А.М., Жуков В.А., Цыганов В.Е., Тихонович И.А.
    В книге: Биология - наука XXI века. Сборник тезисов. 2017. С. 258.

    8. ХАРАКТЕРИСТИКА СИМБИОТИЧЕСКИХ МУТАНТОВ ГОРОХА ПОСЕВНОГО (PISUM SATIVUM L.) С НАРУШЕНИЯМИ ПРОЦЕССА КОЛОНИЗАЦИИ КОРНЕЙ АРБУСКУЛЯРНО-МИКОРИЗНЫМИ ГРИБАМИ И КЛУБЕНЬКОВЫМИ БАКТЕРИЯМИ
    Хайруллина М.М., Штарк О.Ю., Китаева А.Б., Жернаков А.И., Кулаева О.А., Клюкова М.С., Афонин А.М., Ахтемова Г.А., Сулима А.С., Тиходеев О.Н., Тихонович И.А., Жуков В.А.
    В сборнике: ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ БИОЛОГИЯ РАСТЕНИЙ: ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ И ПРИКЛАДНЫЕ АСПЕКТЫ. Годичное собрание Общества физиологов растений России, Научная конференция и школа молодых ученых: Сборник материалов докладов. Федеральное агентство научных организаций, Российская академия наук, Общество физиологов растений России, Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева РАН, Крымский федеральный университет им. В.И. Вернадского, Центр содействия научной, образовательной и просветительской деятельности «Соцветие». 2017. С. 339.

    9. ИЗУЧЕНИЕ СОВМЕСТНЫХ ТРАНСКРИПТОМНЫХ ПРОФИЛЕЙ В СИМБИОТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЕ ГОРОХ ПОСЕВНОЙ(PISUM SATIVUM L.) - RHIZOBIUM LEGUMINOSARUM
    Афонин А.М., Сулима А.С., Жернаков А.И., Жуков В.А., Борисов А.Ю., Тихонович И.А.
    В книге: Биология - наука XXI века. Сборник тезисов. 2017. С. 5.

    10. ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНОВ, КОДИРУЮЩИХ АНТИМИКРОБНЫЕ ПЕПТИДЫ, У ГОРОХА ПОСЕВНОГО (P. SATIVUM L.)
    Кулаева О.А., Афонин А.М., Клюкова М.С., Жернаков А.И., Тихонович И.А., Жуков В.А.
    Acta Naturae (русскоязычная версия). 2017. Т. 9. №  S. С. 33.

    11. PEA MARKER DATABASE (PMD) – A NEW ONLINE DATABASE COMBINING KNOWN PEA (PISUM SATIVUM L.) GENE-BASED MARKERS
    Kulaeva O.A., Zhernakov A.I., Afonin A.M., Boikov S.S., Sulima A.S., Tikhonovich I.A., Zhukov V.A.
    PLoS ONE. 2017.
    Т. 12. № 10. С. e0186713.

    12. SELECTION SIGNATURES IN THE FIRST EXON OF PARALOGOUS RECEPTOR KINASE GENES FROM THE SYM2 REGION OF THE PISUM SATIVUM L. GENOME
    Sulima A.S., Zhukov V.A., Afonin A.A., Zhernakov A.I., Tikhonovich I.A., Lutova L.A.
    Frontiers in Plant Science.
    2017. Т. 8. № NOV. С. 1957.

    13. DRAFT GENOME OF THE STRAIN RCAM1026 RHIZOBIUM LEGUMINOSARUM BV. VICIAE
    Afonin A., Sulima A., Zhernakov A., Zhukov V.
    Genomics Data. 2017.
    Т. 11. С. 85-86.

    Список рефератов

     

    Профессиональные навыки

    29.05.17 хорошо

Подписаться на рассылку ВНИИСХМ

Что будем искать?