Разработка тест-системы для определения эффективности инокуляции гороха клубеньковыми бактериями в полевых условиях

« Вернуться к списку

Применение для гороха биопрепаратов, содержащих штаммы клубеньковых бактерий, осложняется тем фактом, что в почве присутствуют штаммы, также способные к установлению симбиоза с горохом, но менее эффективно фиксирующие азот, чем производственные штаммы из препарата. Конкуренция между аборигенными и вносимыми штаммами может приводить к тому, что клубеньки образуются именно неэффективными штаммами, вследствие чего положительный эффект от применения препарата может отсутствовать. Необходимо создать простую и удобную тест-систему, позволяющую отслеживать, какая доля клубеньков на корнях растений образована штаммом из биопрепарата, а какая – аборигенными штаммами. На основании имеющихся данных о секвенированном геноме одного из производственных штаммов необходимо подобрать уникальные последовательности и на их основе создать маркеры для анализа с использованием qPCR. Этот анализ позволит определить процент клубеньков, образованных аборигенной микрофлорой и производственным штаммом, на материале засушенных корней гороха из полевых экспериментов. В работе также необходимо будет проанализировать полученные ранее данные о метагеномах клубеньков из различных полевых экспериментов, которые можно будет сопоставить с результатами анализа разрабатываемой тест-системы. Данная система будет в дальнейшем использоваться при отборе исходного материала для селекции новых сортов гороха, которые специфично взаимодействуют со штаммами из биопрепарата.

Руководитель: к.б.н. Жуков Владимир Александрович, к.б.н. Сулима Антон Сергеевич