Транскриптомные маркеры ответа гороха посевного (Pisum sativum L.) на инокуляцию полезными микроорганизмами

« Вернуться к списку

Горох посевной образует симбиозы с различными почвенными микроорганизмами – клубеньковыми бактериями, грибами арбускулярной микоризы и рост-стимулирующими бактериями. Несмотря на различия этих симбиозов, в их развитии задействовано некоторое количество общих регуляторных и структурных генов. Остаётся открытым вопрос о том, отличается ли экспрессия генов растения при одиночной и множественной инокуляции (наблюдается ли влияние различных симбиозов друг на друга и каково оно – взаимное подавление либо синергетический эффект). Для ответа на данный вопрос был поставлен масштабный вегетационный эксперимент, в котором был секвенирован транскриптом корней двух сортов гороха, инокулированных различными комбинациями микроорганизмов (клубеньковые бактерии, грибы арбускулярной микоризы и рост-стимулирующие бактерии). В предлагаемом исследовании планируется осуществить анализ дифференциальной экспрессии генов с применением современных подходов биоинформатики, охарактеризовать ответ растений гороха на множественную и одиночную инокуляцию, а также выявить молекулярные маркеры эффективного развития симбиозов, пригодные для использования в селекционном процессе. Данные РНК-секвенирования по протоколу МАСЕ уже получены и ждут студента, готового заняться их обработкой и владеющего базовыми навыками работы в R. С результатами аналогичной, хотя и менее масштабной, работы можно ознакомиться здесь: Kuzmina et al., 2025.

Руководитель: к.б.н. Жуков Владимир Александрович