Для многих мутантных линий гороха с нарушениями развития клубеньков пока не известны гены, затронутые мутациями. В лаборатории недавно получены данные РНК-секвенирования растений поколения F2 для генетического картирования симбиотических генов Sym23 и Sym24 при помощи модифицированной методики Mapping-by-sequencing (методика детально описана в Zhernakov et al., 2019). Также получены данные РНК-секвенирования клубеньков мутантных растений. В ходе работы необходимо будет провести детальный биоинформатический анализ имеющихся данных для идентификации генов-кандидатов и подробного описания профилей экспрессии генов в клубеньках мутантов по сравнению с клубеньками исходной линии «дикого типа». В результате будут получены новые фундаментальные знания о генетической системе гороха, контролирующей развитие и функционирование азотфиксирующих клубеньков.
В рамках этой работы возможно выполнение дальнейших задач по генетической трансформации мутантных линий гороха конструкциями с генами-кандидатами для комплементации мутаций. Дальнейшее развитие направлений работы будет зависеть от функций выявленных генов.
Руководитель работы: к.б.н. Кулаева Ольга Алексеевна.