Коллекция культур полезных микроорганизмов

Коллекция культур полезных микроорганизмов Коллекция культур полезных микроорганизмов Россельхозакадемии насчитывает более 7000 штаммов

Ведомственная коллекция полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения ОСХН РАН (ВКСМ) является одной из старейших и крупнейших микробных коллекций РФ. Коллекция объединяет уникальные микробиологические ресурсы, использующиеся в биотехнологиях производства и переработки сельскохозяйственной продукции. В настоящее время коллекция насчитывает более 7000 штаммов, использующихся (или перспективных для использования) в таких областях, как защита растений, пищевая биотехнология, растениеводство, землеудобрение, животноводство.

ВКСМ зарегистрирована в базе данных WDCM и использует в своей работе международные стандарты. Основная цель коллекции – накопление, надежное сохранение и изучение генетических ресурсов сельскохозяйственных микроорганизмов РФ, направленное на создание научно-исследовательского комплекса, включающего роботизированное криохранение, единую компьютерную базу данных, а также генетическую и фенотипическую паспортизацию штаммов для обеспечения их эффективного и экологически безопасного использования в сельском хозяйстве.

Основным методом долгосрочного хранения микроорганизмов в ВКСМ является криоконсервация. Для поддержания культур в криоконсервированном состоянии используется УНУ «Станция низкотемпературного автоматизированного хранения биологических образцов при -80оС», при создании которой использовались новейшие разработки в области робототехники, компьютерных и криогенных технологий. Принципиальные преимущества хранилища заключаются в долгосрочной и максимально качественной консервации микробиологического материала за счет стабильной температуры хранения, а также в обеспечении авторизованного доступа к коммерческим штаммам с помощью компьютерных ключей. Для широкого круга пользователей организована единая интернет-база данных генетических ресурсов сельскохозяйственных микроорганизмов РФ, работающая «в реальном времени». 

 

Переход к базе данных Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения Россельхозакадемии

Сотрудники

  • Сафронова Вера Игоревна

    Сафронова Вера Игоревна

    Руководитель, кандидат биологических наук

  1. Оследкин Юрий Сергеевич, к.б.н., ведущий научный сотрудник.
  2. Попова Жанна Павловна, к.б.н., старший научный сотрудник.
  3. Сазанова Анна Львовна, к.б.н., научный сотрудник.
  4. Тихомирова Нина Юрьевна, научный сотрудник.
  5. Кузнецова Ирина Геннадьевна, инженер-исследователь.
  6. Иванова Екатерина Ивановна, аппаратчик.

Гранты

  1. Грант Санкт-Петербурга в сфере научной и научно-технической деятельности «Создание Биологического ресурсного центра полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения на базе уникального автоматизированного криохранилища», 2010 г.
  2. Грант CNR- Short Term Mobility Program 2011 «Study of the interactions between rhizosphere microorganisms and plant species growing on sandy soils» (CNR-ISPAAM, Italy), 2011 г.
  3. Государственный контракт № 16.518.11.7095 «Проведение исследований в области долгосрочной консервации и паспортизации генетических ресурсов сельскохозяйственных микроорганизмов на базе уникальной Станции низкотемпературного автоматизированного хранения биологических образцов Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения Россельхозакадемии», 2011-2012 гг.
  4. Грант РФФИ 12-04-01501-а «Изучение механизмов интеграции компонентов и фиторемедиационного потенциала устойчивой к тяжелым металлам бобово-бактериальной симбиотической системы», 2012 г.
  5. Грант Санкт-Петербурга в сфере научной и научно-технической деятельности «Генетическая, физиологическая и функциональная характеристика бактерий обитающих в почвах Санкт-Петербурга и утилизирующих фитогормон абсцизовую кислоту», 2012 г.
  6. Грант РФФИ 13-04-01655-а «Утилизация фитогормона абсцизовой кислоты симбиотрофными бактериями: новый механизм растительно-микробных взаимодействий?», 2013 – 2015 гг.
  7. Грант РФФИ 13-04-90833-мол_рф_нр «Изучение таксономического положения и симбиотических свойств клубеньковых бактерий – микросимбионтов реликтового бобового растения вавиловия прекрасная (Vavilovia formosa)», 2013 г.
  8. Грант РНФ 14-16-00137 «Изучение роли корневых экзометаболитов в экохимических механизмах адаптации симбиотических растительно-микробных систем к токсичным металлам», 2014 – 2016 гг.
  9. Соглашение № 14.604.21.0024 с Минобрнауки «Интеграция новейших достижений геномики и метагеномики в технологию производства микробных препаратов», 2014 – 2015 гг.
  10. Грант РНФ № 16-16-00080 «Изучение становления специфичности растительно-микробного взаимодействия с использованием реликтовых бобовых растений и ее связи с продуктивностью симбиоза», 2016 – 2018 гг.

Публикации и документы

Смотреть все

  1. Каталог культур микроорганизмов Всероссийской коллекции непатогенных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения (Под ред. Тихоновича И.А. и Сафроновой В.И.), ГНУ ВНИИСХМ Россельхозакадемии, Санкт-Петербург-Пушкин, 2010,  72 С.
  2. Dodd I.C., Zinovkina N.Y., Safronova V.I., Belimov A.A. Rhizobacterial mediation of plant hormone status. Annals of Applied Biology, 2010, 157, 361-379.
  3. Safronova V.I., Piluzza G., Bullitta S., Belimov A.A. Use of legume-microbe symbioses for phytoremediation of heavy metal polluted soils: advantages and potential problems. In: "Handbook for Phytoremediation", NOVA Science Publishers, USA, 2011, p. 443-470.
  4. Сафронова В.И., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Павлова Е.А. Определение таксономического положения штаммов-микросимбионтов копеечника (Hedysarum) и астрагала (Astragalus) путем анализа генов рибосомальных РНК. Сельскохозяйственная биология, 2011, 3, 61-64.
  5. Teijeiro R.G., Dodd I.C., Elphinstone E.D., Safronova V.I., Belimov A.A. From seed to salad: impacts of ACC deaminase-containing plant growth promoting rhizobacteria on lettuce growth and development. Acta Horticulturae, 2011, 898, 245-252.
  6. Белимов А.А., Сафронова В.И. АЦК деаминаза и растительно-микробные взаимодействия. Сельскохозяйственная биология, 2011, 3, 23-28.
  7. Stępkowski T., Żak M., Moulin L., Króliczak J., Golińska B., Narożna D., Safronova V.I., Mądrzak C.J. Bradyrhizobium canariense and Bradyrhizobium japonicum are the two dominant rhizobium species in root nodules of lupin and serradella plants growing in Europe. Systematic and Applied Microbiology, 2011, 34(5), 368-375.
  8. Safronova V., Tikhonovich I. Automated cryobank of microorganisms: Unique possibilities for long-term authorized depositing of commercial microbial strains. Microbes In Applied Research: Current Advances and Challenges. Ed.:  A. Mendez-Vilas, World Scientific Publishing Co., 2012, pp. 331-334.
  9. Baimiev A.Kh., Ivanova E.S., Ptitsyn K.G., Belimov A.A., Safronova V.I., Baimiev Al.Kh. Genetic characterization of wild leguminous nodular bacteria living in the South Urals. Mol Gen Microbiol Virusol., 2012, 1, 29-34.
  10. Сафронова В.И., Чижевская Е.П., Андронов Е.Е. Разработка методики молекулярно-генетической паспортизации штаммов сельскохозяйственных микроорганизмов с помощью AFLP-фингерпринтинга. Сельскохозяйственная биология, 2012, 6, 116-121.
  11. Safronova V.I., Piluzza G., Zinovkina N.Y., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Bullitta S. Relationships between pasture legumes, rhizobacteria and nodule bacteria in heavy metal polluted mine waste of SW Sardinia. Symbiosis, 2012, 58(1), 149-159
  12. Белимов А.А., Демчинская С.В., Сафронова В.И. Реакция гороха на инокуляцию ризосферными АЦК-утилизирующими бактериями в присутствии эндомикоризного гриба Glomus intraradices. Сельскохозяйственная биология, 2012, №3, 90-97. Импакт-фактор РИНЦ – 0,116; Включен в перечень ВАК.
  13. Малков Н.В., Зиновкина Н.Ю., Сафронова В.И., Белимов А.А. Повышение устойчивости бобово-ризобиального симбиоза к кадмию с помощью ризосферных бактерий, содержащих АЦК деаминазу. Достижения науки и техники АПК, 2012, 9, 53-57.
  14. Belimov A.A, Dodd I.C., Safronova V.I., Dumova V.A., Shaposhnikov A.I., Ladatko A.G., Davies W.J. Abscisic acid metabolizing rhizobacteria decrease ABA concentrations in planta and alter plant growth. Plant Physiology and Biochemistry, 2014, 74, 84-91.
  15. Safronova V.I. Kimeklis A.K., Chizhevskaya E.P., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Tikhonovich I.A. Genetic diversity of rhizobia isolated from nodules of the relic species Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Antonie van Leeuwenhoek, 2014, 105, 389-399.
  16. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Chizhevskaya E.P., Pukhaev A.R., Popov K.P.,  Willems A, Tikhonovich I.A. Bosea vaviloviae sp. nov. a new species of slow-growing rhizobia isolated from nodules of the relict species Vavilovia formosa (Stev.) Fed., Antonie van Leeuwenhoek, 2015, 107, 911–920.
  17. Belimov A.A., Dodd I.C., Safronova V.I., Malkov N.V., Davies W.J., Tikhonovich I.A. The cadmium-tolerant pea (Pisum sativum L.) mutant SGECdt is more sensitive to mercury: assessing plant water relations. J Exp Bot., 2015, 66, 2359-2369.
  18. Сафронова В.И., Сазанова А.Л., Кузнецова И.Г., Попова Ж.П., Гришечкина С.Д., Ермолова В.П., Андронов Е.Е. Полногеномное секвенирование и сравнительный анализ генов "домашнего хозяйства" и вирулентности у коммерческих штаммов Bacillus thuringiensis с энтомоцидным действием. Сельскохозяйственная биология, 2015, 50 (3), 332-338.
  19. Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Пинаев А.Г., Верхозина А.В., Тихомирова Н.Ю., Оследкин Ю.С., Белимов А.А. Генетическое разнообразие микросимбионтов байкальских видов чины (Lathyrus), горошка (Vicia), остролодочника (Oxytropis) и астрагала (Astragalus). Сельскохозяйственная биология, 2015, 50 (3), 345-352.
  20. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Akopian J.A., Willems A., Tikhonovich I.A. Extra slow-growing Tardiphaga strains isolated from nodules of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Arch. Microbiol. 2015, 197 (7), 889-898.
  21. Belimov A.A., Puhalsky I.V., Safronova V.I., Shaposhnikov A.I., Vishnyakova M.A., Semenova E.V., Zinovkina N.Y., Makarova N.M., Wenzel W., Tikhonovich I.A. Role of plant genotype and soil conditions in symbiotic plant-microbe interactions for adaptation of plants to cadmium polluted soils. Water, Air and Soil Pollution, 2015, 226:264.
  22. КимеклисА.К., СафроноваВ.И., КузнецоваИ.Г., Сазанова А.Л., Белимов А.А., Пинаев А.Г., Чижевская Е.П., Пухаев А.Р., Попов К.П., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Филогенетический анализ штаммов рода Rhizobium, выделенных из клубеньков Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Сельскохозяйственная биология, 2015, 50 (5), 655-664.

Подписаться на рассылку ВНИИСХМ

Что будем искать?