Лаборатория геномики надорганизменных систем

Заведующий лабораторией : Нижников Антон Александрович

Телефон: +7 (812) 476 16 02

Лаборатория создана для выполнения научных исследований в рамках проекта «Мобилизация генетических ресурсов микроорганизмов на базе Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов  сельскохозяйственного  назначения (ВКСМ) при ФГБНУ ВНИИСХМ с использованием сетевого принципа организации», реализуемому в соответствии с условиями Соглашения № 075-15-2021-1055 от 28.09.2021 г. о предоставлении гранта в форме субсидии из федерального бюджета научным организациям и образовательным организациям высшего образования на реализацию отдельных мероприятий Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019 – 2027 годы.

Целью работы Лаборатории является изучение биологического разнообразия хозяйственно-ценных микроорганизмов с применением методов молекулярной генетики и геномики.

• Поиск, изоляция и культивирование штаммов хозяйственного ценных микроорганизмов

• Депонирование отобранных штаммов в Сетевую биоресурсную коллекцию в области генетических технологий для сельского хозяйства ФГБНУ ВНИИСХМ

• Полногеномное секвенирование хозяйственно-ценных микроорганизмов

• Функциональная аннотация геномных локусов, определяющих полезные свойства микроорганизмов

Сотрудники

• 

  Нижников Антон Александрович

  Доктор биологических наук, профессор РАН, заведующий лабораторией №7 профессор СПбГУ

  •  
  •  
• 

  Антонец Кирилл Сергеевич

  Ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук

  •  
  •  
• 

  Белоусов Михаил Владимирович

  Старший научный сотрудник, кандидат биологических наук

  •  
  •  
• 

  Фаюд Хайдар

  Младший научный сотрудник, аспирант СПбГУ

  •  
  •  
• 

  Романенко Мария Николаевна

  Младший научный сотрудник, аспирантка СПбГУ

  •  
  •  
• 

  Шиков Антон Евгеньевич

  Младший научный сотрудник, аспирант СПбГУ

  •  
  •  

Публикации

1. Shikov AE, Belousova ME, Belousov MV, Nizhnikov AA, Antonets KS. Salmonella-Based Biorodenticides: Past Applications and Current Contradictions. Int J Mol Sci. 2022 Nov 23;23(23):14595. doi: 10.3390/ijms232314595.
2. Kosolapova AO, Belousov MV, Sulatsky MI, Tsyganova AV, Sulatskaya AI, Bobylev AG, Shtark OY, Tsyganov VE, Volkov KV, Zhukov VA, Tikhonovich IA, Nizhnikov AA. RopB protein of Rhizobium leguminosarum bv. viciae adopts amyloid state during symbiotic interactions with pea (Pisum sativum L.). Front Plant Sci. 2022 Oct 24;13:1014699. doi: 10.3389/fpls.2022.1014699.

3. Merkushova A.V., Shikov A.E., Nizhnikov A.A., Antonets K.S. For Someone, You Are the Whole World: Host-Specificity of Salmonella enterica // Int. J. Mol. Sci., 2023, V.24, e13670. https://doi.org/10.3390/ijms241813670 (Impact Factor 5.6, Q1)

4. Shikov A.E., Merkushova A.V., Savina I.A., Nizhnikov A.A., Antonets K.S. The man, the plant, and the insect: shooting host specificity determinants in Serratia marcescens pangenome // Frontiers in Microbiology, 2023, V.14, e1211999. https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1211999

5. Romanenko M.N., Nesterenko M.A., Shikov A.E., Nizhnikov A.A., Antonets K.S. Draft Genome Sequence Data of Lysinibacillus sphaericus Strain 1795 with Insecticidal Properties // Data, 2023, V.8, 167. https://doi.org/10.3390/data8110167

Текущие гранты

1. Проект «Мобилизация генетических ресурсов микроорганизмов на базе Ведомственной коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения (ВКСМ) при ФГБНУ ВНИИСХМ с использованием сетевого принципа организации», реализуемый в соответствии с условиями Соглашения № 075-15-2021-1055 от 28.09.2021 г. о предоставлении гранта в форме субсидии из федерального бюджета научным организациям и образовательным организациям высшего образования на реализацию отдельных мероприятий Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019 – 2027 годы.

Документы

• Приказ о создании лаборатории Смотреть Скачать (1.213 Мб)

Смотреть все