Лаборатория ризосферной микрофлоры №1

ЛАБОРАТОРИЯ РИЗОСФЕРНОЙ МИКРОФЛОРЫ БЕЛИМОВ АНДРЕЙ АЛЕКСЕЕВИЧ Заведующий лабораторией, главный научный сотрудник, д.б.н. Телефон для связи: +7 812 476 18 02 Е-мейл: belimov@rambler.ru   Лаборатория ризосферной микрофлоры создана в 2001 году на базе группы ризосферной микробиологии лаборатории биотехнологии и лаборатории почвенной микологии. С момента создания лабораторией руководил доктор биологических наук Лев Витальевич Кравченко, который являлся одним из ведущих ученых в области изучения экохимических и биологических ризосферных процессов взаимодействия микроорганизмов с растениями.   ОСНОВНЫЕ НАПРАВЛЕНИЯ ИССЛЕДРВАНИЙ   1. Экохимическая интеграция ризосферных микроорганизмов с растениями  Разработка методов получения и анализа качественного и количественного состава корневых экзометаболитов. Селекция и изучение ризосферных бактерий с высокой способностью колонизировать ризосферу, антимикробной и АЦК дезаминазой активностью, продукцией и/или трансформацией фитогормонов и других биологически активных веществ. Изучение роли корневых экзометаболитов, фитогормонов и микробных метаболитов в растительно-микробных взаимодействиях методами газовой и жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии.    2. Адаптация и функционирование растительно-микробных систем в неблагоприятных почвенных и климатических условиях Селекция и детальная характеристика устойчивых к абиотическим стрессам ризосферных и клубеньковых бактерий. Изучение механизмов устойчивости растений и антистрессовых эффектов микроорганизмов на растения в условиях загрязнения почв тяжелыми металлами, засухи, экстремальных температур, дефицита питательных элементов и повышенной кислотности почвы. Раскрытие адаптационного потенциала растительно-микробных систем для их эффективного функционирования в стрессовых условиях и использования в агробиотехнологиях. Применение комплекса микробиологических, физиологических, биохимических, физико-химических и хромато-масс-спектрометрических методов.          3. Биоконтроль фитопатогенных грибов ризосферными бактериями Изучение экологии почвенных фитопатогенных грибов в разных агроэкологических условиях. Использование микробиологических, иммунохимических и молекулярных методов для изучения развития и особенностей колонизации фитопатогенными грибами ризосферы и корней растений-хозяев. Изучение биоконтрольных функций ризосферных бактерий, таких как конкуренция за источники питания, продуцирование антибиотиков и ингибиторов, индукция системной устойчивости растений. Разработка микробиологических способов регуляции численности фитопатогенов и снижения заболеваемости сельскохозяйственных растений.          4. Генетика специализированных клеток у цианобактерий  Изучение механизмов регуляции формирования и дифференцировки гетероцист, осуществляющих аэробную фиксацию азота у цианобактерий. Исследование регуляторных генов, контролирующих разные стадии дифференцировки гетероцист и определяющих эффективность фиксации азота свободноживущими и симбиотическими цианобактериями.

Сотрудники

• 

  Белимов Андрей Алексеевич

  Заведующий лабораторией, д.б.н.

  •  
• 

  Азарова Татьяна Степановна

  Старший научный сотрудник, кандидат биологических наук

  •  
• 

  Вишневская Надежда Алексеевна

  Старший научный сотрудник, кандидат биологических наук

  •  
• 

  Гуро Полина Витальевна

  Младший научный сотрудник

  •  
• 

  Сексте Эдгар Артурович

  Научный сотрудник, кандидат биологических наук

  •  
• 

  Струнникова Ольга Кондратьевна

  Ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук

  •  
• 

  Худяков Иван Яковлевич

  Старший научный сотрудник, кандидат биологических наук

  •  
• 

  Шапошников Александр Иванович

  Ведущий научный сотрудник, кандидат биологических наук.

  •  
• 

  Шахназарова Влада Юрьевна

  Научный сотрудник, кандидат биологических наук.

  •  
• 

  Юзихин Олег Сергеевич

  Старший научный сотрудник, кандидат химических наук

  •  
• 

  Лебединский Мирослав Игоревич

  Инженер-исследователь

  •  

ТЕКУЩИЕ ПРОЕКТЫ И ГРАНТЫ

2024-2026 – «Изучить роль ассоциативных ризобактерий в модуляции фитогормона салициловой кислоты в растениях ячменя и гороха» (Государственное задание).

2024-2026 – «Роль микробных деструкторов и продуцентов абсцизовой кислоты в устойчивости сельскохозяйственных растений к биотическим и абиотическим стрессовым факторам». Грант РНФ (24-16-00166).

2020-2025 – «Изучения генетических ресурсов полезных почвенных микроорганизмов Арктических регионов России в связи с изменением климата и перспективами расширения ареала сельскохозяйственных угодий на Север». Грант РНФ (20-76-10042).

2020-2024 - Субсидия при поддержке Минобрнауки России на создание и развитие научного центра мирового уровня «Агротехнологии будущего» (075-15-2022-320 от 20.04.2022 г.).

2024-2026 - «The role of microbial destructors and producers of abscisic acid in the resistance of agricultural plants to biotic and abiotic stress factors». Grant RSF (24-16-00166).

ЗАКОНЧЕННЫЕ ПРОЕКТЫ И ГРАНТЫ

 ОСНОВНЫЕ ПУБЛИКАЦИИ

 

1. Алехина И.А., Белимов А.А., Карлов Д.С. Поиск арктических бобовых растений и их бактериальных симбионтов в дельте Лены и на плато Путорана. Информационно-аналитический сборник «Российские Полярные Исследования». 2023, №1, С. 16-19. http://old.aari.ru/misc/publicat/sources/51/RPR-51el_l_16-19.pdf.
2. Карлов Д.С., Большиянова О.Д., Лащинский Н.Н., Белимов А.А. Изучение взаимосвязей агрохимических показателей почв с видовым составом растений некоторых участков дельты реки Лены, Северная Якутия. Проблемы Арктики и Антарктики. 2023;69 (2):228-243. https://doi.org/10.30758/0555-2648-2023-69-2-228-243.
3. Belimov A.A., Shaposhnikov A.I., Azarova T.S., Yuzikhin O.S., Sekste E.A., Safronova V.I., Tikhonovich I.A. Aluminum-immobilizing rhizobacteria modulate root exudation and nutrient uptake and increase aluminum tolerance of pea mutant E107 (brz). Plants, 2023, 12, 2334. https://doi.org/10.3390/plants12122334.
4. Shaposhnikov A., Yuzikhin O., Syrova D., Karlov D., Sazanova A., Azarova T., Sekste E., Safronova V., Belimov A. Beneficial aluminium immobilizing microorganisms inhabiting the rhizosphere of pea. Biological Communications, 2023. 68(2): 74–85. https://doi.org/10.21638/spbu03.2023.202.
5. Boykova I., Yuzikhin O., Novikova I., Ulianich P., Eliseev I.,Shaposhnikov A., Yakimov A., Belimov A. Strain Streptomyces P-56 produces nonactin and possesses insecticidal, acaricidal, antimicrobial and plant growth-promoting traits. Microorganisms, 2023, 11, 764. https://doi.org/10.3390/ microorganisms11030764.
6. Guro P., Ulianich P., Shaposhnikov A., Yuzikhin O., Karlov D., Sazanova A., Safronova V., Belimov A. Draft genome sequence of the bacterium Cupriavidus strain D39, inhabiting the rhizosphere of pea plants (Pisum sativum L.). Microbiology Resource Announcements, 2023, 12(4): e0135422. doi: 10.1128/mra.01354-22.
7. Safronova V.; Sazanova A.; Belimov A.; Guro P.; Kuznetsova I.; Karlov D.; Chirak E.; Yuzikhin O.; Verkhozina A.; Afonin A.; Tikhonovich I. Synergy between rhizobial co-microsymbionts leads to an increase in the efficiency of plant–microbe interactions. Microorganisms, 2023, 11, 1206. https://doi.org/10.3390/ microorganisms11051206.
8. Kolesnikov L.E., Belimov A.A., Hassan B.A., Kolesnikova Yu.R., Kiselev M.V., Minakov D.S. The optimization of grain crops’ phytosanitary condition with associative rhizobacteria application. Russian Agricultural Sciences, 2023, Vol. 49, No. 2, pp. 164–171. DOI:10.3103/s1068367423020088.
9. Kolesnikov L.E., Hassan B.A., Belimov A.A., Orlova A.G., Minakov D.S., Kolesnikova Yu.R. Application of associative rhizobacteria for increasing the soft wheat productivity and reducing the diseases harmfulness. Indian Journal of Agricultural Research, 2023, AF-776, 1-7. Doi: 10.18805/IJARe.AF-766.
10. Shaposhnikov A.I., Belimov A.A., Azarova T.S. T. S. Azarova, O. K. Strunnikova, N. A. Vishnevskaya, N. I. Vorobyov, O. S. Yuzikhin & I. A. Tikhonovich. The relationship between the composition of root exudates and the efficiency of interaction of wheat plants with microorganisms. Applied Biochemistry and Microbiology, 2023, 59, 330–343. https://doi.org/10.1134/S000368382303016X.
11. Алехина И.А., Белимов А.А., Карлов Д.С. Поиск арктических бобовых растений и их бактериальных симбионтов в дельте Лены и на плато Путорана. Российские Полярные Исследования. 2023, №1, С. 16-19.
12. Belimov A.A., Sazanova A.L., Ulianich P.S., Yuzikhin O.S., Guroa P.V., Shaposhnikov A.I., Sokolova D.V., Safronova V.I. Cross-nodulation and symbiosis efficiency of rhizobia isolated from nodules of Cyamopsis tetragonoloba on Vigna unguiculata and Glycine max. Russian Journal of Plant Physiology, 2023, 70:182. DOI: 10.1134/S1021443723601878.
13. Guro P, Ulianich P, Belimov A, Sazanova A, Kuznetsova I, Vishnyakova M, Safronova V. Draft Genome Sequence of Guar (Cyamopsis tetragonoloba) Microsymbiont Rhizobium sp. Strain RCAM05973. Microbiol. Resour. Announc. 2023;12(6):e0007123. doi: 10.1128/mra.00071-23.
14. Yuzikhin O.S., Shaposhnikov A.I., Konnova T.A., Syrova D.S., Hamo H., Ermekkaliev T.S.; Shevchenko V.P., Shevchenko K.V., Gogoleva N.E., Nizhnikov A.A., Safronova V.I., Kamnev A.A., Belimov A.A., Gogolev Y.V. Isolation and Characterization of 1-Hydroxy-2,6,6-trimethyl-4-oxo-2-cyclohexene-1-acetic acid, a metabolite in bacterial transformation of abscisic acid. Biomolecules, 2022, 12, 1508. doi:10.3390/biom12101508. WoS, Scopus, РИНЦ, Q2, IF=6,064.
15. Karlov D., Sazanova A., Guro P., Kuznetsova I., Verkhozina A., Belimov A., Safronova V. Genetic diversity of rhizobial strains isolated from the relict legumes Gueldenstaedtia monophylla and verna growing in the republics of Altai and Buryatia (Russia). Biological Communications, 2022, 67(3), 141–151. doi:10.21638/spbu03.2022.301. Scopus, РИНЦ, Q3, IF=0,82.
16. Kichko, A.A., Gladkov, G.V., Ulianich, P.S., Safronova, V.I., Pinaev, A.G., Sekste, E.A., Belimov, A.A., Andronov, E.E. Water stress, cadmium, and plant genotype modulate the rhizosphere microbiome of Pisum sativum Plants, 2022, 11, 3013. https://doi.org/10.3390/plants11223013. WoS, Scopus, РИНЦ, Q1, IF=4,658.
17. Brazhnikova Y.V., Shaposhnikov A.I., Sazanova A.L., Belimov A.A., Mukasheva T.D., Ignatova L.V. Phosphate mobilization by culturable fungi and their capacity to increase soil p availability and promote barley growth. Current Microbiology, 2022, 79(8), 240. doi: 10.1007/s00284-022-02926-1. PMID: 35792979. WoS, Scopus, РИНЦ, Q3, IF=2.408.
18. Belimov A.A., Shaposhnikov A.I., Azarova T.S., Syrova D.S., Kitaeva A.B., Ulyanich P.S., Yuzikhin O.S., Sekste E.A., Safronova V.I., Vishnyakova M.A., Tsyganov V.E., Tikhonovich I.A. Rhizobacteria mitigate the negative effect of aluminum on pea growth by immobilizing the toxicant and modulating root exudation. Plants, 2022, 11(18), 2416, doi:10.3390/plants11182416. WoS, Scopus, РИНЦ, Q1, IF=4,658.
19. Sazanova A., Safronova V., Belimov A., Gogolev Y., Chirak E., Karlov D., Kuznetsova I., Kuzmina L., Tikhonovich I. Complete genome sequence of Rhizobium strain RCAM05350 from Shulgan-Tash karst cave. Microbiology Resource Announcements. 2022, 11(10), e0056922. doi: 10.1128/mra.00569-22. WoS, Scopus, РИНЦ, Q3, IF=0,89.
20. Belimov A.A., Ulianich P.S., Syrova D.S., Shaposhnikov A.I., Safronova V.I., Dodd I.C. Modulation of tomato root architecture and root hair traits by Pseudomonas brassicacearum and Variovorax paradoxus containing 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase. Biologia Plantarum, 2022, 66. 228-239. Doi:10.32615/bp.2022.025. WoS, Scopus, РИНЦ, Q2, IF= 122.
21. Сырова Д.С., Шапошников А.И., Юзихин О.С., Белимов А.А. Деструкция и трансформация фитогормонов микроорганизмами. Прикладная биохимия и микробиология, 2022, T. 58, № 1, 3-22. DOI: 10.31857/S0555109922010093.
22. Ульянич П.С., Белимов А.А., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Юзихин О.С., Лактионов Ю.В., Карлов Д.С., Вишнякова М.А.,Сафронова В.И. Эффективность азотфиксирующего симбиоза гуара (Cyamopsis tetragonoloba) со штаммами Bradyrhizobium retamae RCAM05275 и Ensifer aridi RCAM05276 в вегетационном опыте. Сельскохозяйственная биология, 2022, т. 57, №3, с. 555-565. doi: 10.15389/agrobiology.2022.3.555rus. Scopus, РИНЦ, Q4, IF=0,17.
23. Ермеккалиев Т.С., Гоголева Н.Е., Гоголев Ю.В., Коннова Т.А., Шевченко В.П., Нагаев И.Ю., Шапошников А.И., Шевченко К.В., Белимов А.А., Сырова Д.С., Юзихин О.С., Мясоедов Н.Ф. Метаболизм абсцизовой кислоты, содержащей атомы дейтерия в циклогексеновой части молекулы, под действием ризосферных бактерий. Химико-фармацевтический журнал, 2021 Т. 55, №7, С. 60-64. https://doi.org/10.30906/0023-1134-2021-55-7-60-64.
24. Jin K., Li H., Li X., Li H., Dodd I.C., Belimov A.A., Davies W.J., Shen J. Rhizosphere bacteria containing ACC deaminase decrease root ethylene emission and improve maize root growth with localized nutrient supply. Food and Energy Security, 2021, 10, 2, 275-284. https://doi.org/10.1002/fes3.278.
25. Yuzikhin O.S., Gogoleva N.E., Shaposhnikov A.I., Konnova T.A., Osipova E.V., Syrova D.S., Ermakova E.S., Shevchenko V.P., Nagaev I.Yu., Shevchenko K.V., Myasoedov N.F., Safronova V.I., Shavarda A.L., Nizhnikov A.A., Belimov A.A., Gogolev Yu.V. Rhizosphere bacterium Rhodococcus sp. P1Y metabolizes abscisic acid to form dehydrovomifoliol // Biomolecules. 2021. V. 11. Article 345. DOI: 10.3390/biom11030345.
26. Karlov D., Sazanova A., Kuznetsova I., Tikhomirova N., Popova Z., Osledkin Y., Demidov N., Belimov A., Safronova V. Rhizobial isolates in active layer samples of permafrost soil of Spitsbergen, Arctic // Biological communications. 2021. V. 66. № 1. P. 73–82. DOI: 10.21638/spbu03.2021.109.
27. Khudyakov I., Gladkov G., Elhai J. Inactivation of three RG(S/T)GR pentapeptide-containing negative regulators of HetR results in lethal differentiation of Anabaena PCC 7120. Life (Basel), 2020, V. 4; 10(12):326. DOI: 10.3390/life10120326.
28. Zhou Y., Xu X., Wei Y., Cheng Y., Guo Y., Khudyakov I., Liu F., He P., Song Z., Li Z., Gao Y., Ang E.L., Zhao H., Zhang Y., Zhao S. A widespread pathway for substitution of adenine by diaminopurine in phage genomes. Science 2021, 372, (6541):512-516. DOI: 10.1126/science.abe4882.
29. Kolesnikov L.E., Belimov A.A., Kudryavtseva E.Y., Hassan B.A., Kolesnikova Yu.R. Identification of the effectiveness of associative rhizobacteria in spring wheat cultivation // Agronomy Research. 2021. V. 19. № 3, 1530–1544. DOI: 10.15159/AR.21.145.
30. Safronova V, Sazanova A, Kuznetsova I, Belimov A, Guro P, Karlov D, Yuzikhin O, Chirak E, Verkhozina A, Afonin A, Andronov E, Tikhonovich I. Increasing the legume–rhizobia symbiotic efficiency due to the synergy between commercial strains and strains isolated from relict symbiotic systems // Agronomy. V. 11. № 7. Article 1398. DOI: 10.3390/agronomy11071398.
31. Teijeiro G.R., Belimov A.A., Dodd, I.C. Microbial inoculum development for amelioration of crop drought stress: a case study of Variovorax paradoxus 5C-2. New Biotechnology, 2020, 56, 103-113. https://doi.org/10.1016/j.nbt.2019.12.006.
32. Kargapolova K.Yu., Burygin G.L., Tkachenko O.V., Evseeva N.V., Pukhalskiy Y.V. Belimov A.A. Effectiveness of inoculation of in vitro‑grown potato microplants with rhizosphere bacteria of the genus Azospirillum. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 2020, 141, 351–359. https://doi.org/10.1007/s11240-020-01791-9
33. Зверев А.О., Першина Е.В., Шапкин В.М., Кичко А.К., Митрофанова О.П., Кобылянский В.Д., Юзихин О.С., Белимов А.А., Андронов Е.Е. Молекулярный анализ микробных сообществ ризосфер злаков, выращенных на контрастных почвах. Микробиология, 2020, 89, № 2, 235–246. DOI: 10.31857/S
34. Петрова С.Н., Андронов Е.Е., Белимов А.А., Береговая Ю.В., Денщиков В.А., Минаков Д.Л. Изменение структуры прокариотного сообщества в ризосфере рапса ярового (Brassica napus) в зависимости от внесения бактерий, утилизирующих 1-аминоциклопропан-1-карбоксилат. Микробиология, 2020, 89, № 1, 121–128. DOI: 10.31857/S0026365620010115.
35. Belimov A.A., Shaposhnikov A.I., Azarova T.S., Makarova N.M., Safronova V.I., Litvinskiy V.A., Nosikov V.V., Zavalin A.A., Tikhonovich I.A. Microbial Consortium of PGPR, rhizobia and arbuscular mycorrhizal fungus makes pea mutant SGECd^t comparable with Indian mustard in cadmium tolerance and accumulation. Plants, 2020, 9, 975. doi:10.3390/plants9080975.
36. Belimov A.A., Shaposhnikov A.I., Syrova D.S., Kichko A.A., Guro P.V., Yuzikhin O.S., Azarova T.S., Sazanova A.L., Sekste E.A., Litvinskiy V.A., Nosikov V.V., Zavalin A.A., Andronov E.E., Safronova V.I. The role of symbiotic microorganisms, nutrient uptake and rhizosphere bacterial community in response of pea (Pisum sativum) genotypes to elevated Al concentrations in soil. Plants, 2020, 9(12), 1801. Doi:10.3390/plants9121801.
37. Belimov A.A., Dodd I.C., Safronova V.I., Dietz K.-J. Leaf nutrient homeostasis and maintenance of photosynthesis integrity contribute to better adaptation of the pea mutant SGECd^t to toxic cadmium. Biologia Plantarum, 2020, 64: 447-453. DOI: 10.32615/bp.2020.061.
38. Tsyganov V.E., Tsyganova A.V., Gorshkov A.P., Seliverstova E.V., Kim V.E., Chizhevskaya E.P., Belimov A.A., Serova T.A., Ivanova K.A., Kulaeva O.A., Kusakin P.G., Kitaeva A.B., Tikhonovich I.A. Efficacy of a plant-microbe system: Pisum sativum (L.) cadmium-tolerant mutant and rhizobium leguminosarum strains, expressing pea metallothionein genes PsMT1 and PsMT2, for cadmium phytoremediation. Frontiers in Microbiology, 2020, 11:15. doi: 10.3389/fmicb.2020.00015.
39. Safronova VI, Guro PV, Sazanova AL, Kuznetsova IG, Belimov AA, Yakubov VV, Chirak ER, Afonin AМ, Gogolev YV, Andronov EE, Tikhonovich IA. Rhizobial microsymbionts of Kamchatka Oxytropis species possess genes of the type III and VI secretion systems, which can affect the development of symbiosis. Molecular Plant Microbe Interactions, 2020, 33, №10, 1232-1241. doi: 10.1094/MPMI-05-20-0114-R.
40. Belimov A.A., Zinovkina N.Y., Safronova V.I., Litvinsky V.A., Nosikov V.V., Zavalin A.A., Tikhonovich I.A. Rhizobial ACC deaminase contributes to efficient symbiosis with pea (Pisum sativum) under single and combined cadmium and water deficit stress. Environmental and Experimental Botany, 2019, 167, 103859, https://doi.org/10.1016/j.envexpbot.2019.103859.
41. Gogoleva N., Nikolaichik Y., Ismailov T., Gorshkov V.Y., Safronova V.I., Belimov A., Gogolev Y. Complete genome sequence of the abscisic acid-utilizing strain Novosphingobium P6W. 3 Biotech, 2019, 9:94, DOI:10.1007/s13205-019-1625-8.
42. Gogoleva N.E., Nikolaichik Y., Ismailov T., Khlopko Yu.A., Dmitrieva S.A., Konnova T.A., Ermekkaliev T.S., Safronova V.I., Belimov A.A., Gogolev Yu.V. Complete genome sequence of the abscisic acid-metabolizing rhizobacterium Rhodococcus strain P1Y. Microbiology Resource Announcements, 2019, 8(15) e01591-18, DOI: 10.1128/MRA.01591-18.
43. Syrova D.S., Shaposhnikov A.I., Makarova N.M., Gagkaeva T.Y., Khrapalova I.A., Emelyanov V.V., Gogolev Y.V., Gannibal Ph.B., Belimov A.A. The ability of some species of phytopathogenic fungi to produce abscisic acid. Mycology and Phytopathology, 2019, 53, №5, 301–310. DOI: 1134/S0026364819050064.
44. Safronova V., Belimov A., Sazanova A., Chirak E., Kuznetsova I., Andronov E. Pinaev A., Tsyganova A., Seliverstova E., Kitaeva A., Tsyganov V. and Tikhonovich I. Two broad host range rhizobial strains isolated from relict legumes have various complementary effects on symbiotic parameters of co-inoculated plants. Frontiers in Microbiology 10:514. doi: 10.3389/fmicb.2019.00514.
45. Sazanova A.L., Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Karlov D.S., Belimov A.A., Andronov E.E., Chirak E.R., Popova J.P., Verkhozina A.V., Willems A., Tikhonovich I.A. Bosea caraganae nov. a new species of slow-growing rhizobia isolated from root nodules of the relict species Caragana jubata (Pall.) Poir. originating from Mongolia. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2019, 69(9), 2687-2695. doi: 10.1099/ijsem.0.003509.
46. Карлов Д.С., Сазанова А.Л., Кузнецова И.Г., Сафронова В.И., Тихомирова Н.Ю., Попова Ж.П., Оследкин Ю.С., Верхозина А.В., Белимов А.А. Генетическое разнообразие микросимбионтов термопсиса ланцетного (Thermopsis lanceolata), произрастающего в Монголии. Экологическая генетика. 2019. Т. 17. № 1. С. 43-51.
47. Шапошников А.И., Вишневская Н.А., Шахназарова В.Ю., Белимов А.А., Струнникова О.К. Роль корневых экссудатов ячменя как источника питания во взаимоотношениях между Fusarium culmorum и Pseudomonas fluorescens // Микология и фитопатология. 2019. Т. 53. №5. С. 311-318. DOI: 1134/S0026364819050052.
48. Kimeklis A.K., Chirak E.R., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Safronova V.I., Belimov A.A., Onishchuk O.P., Kurchak O.N., Aksenova Т.S., Pinaev A.G., Andronov E.E., Provorov N.A. Rhizobia Isolated from the relict legume Vavilovia formosa represent a genetically specific group within Rhizobium leguminosarum biovar viciae. Genes, 2019, 10, https://doi.org/10.3390/genes10120990.
49. Chirak E.R., Kimeklis A.K., Karasev E.S., Kopat V.V., Safronova V.I., Belimov A.A., Aksenova T.S., Kabilov M.R., Provorov N.A., Andronov E.E. Search for ancestral features in genomes of Rhizobium leguminosarum Viciae strains isolated from the relict legume Vavilovia formosa. Genes, 2019, 10, 990. https://doi.org/10.3390/genes10120990.
50. Elhai J., Khudyakov I. Ancient association of cyanobacterial multicellularity with the regulator HetR and an RGSGR pentapeptide‐containing protein (PatX). Molecular Microbiology, 2018, 110, №6, 931-954.
51. Belimov A.A., Malkov N.V., Puhalsky J.V., Tsyganov V.E., Bodyagina K.B., Safronova V.I., Dietz K.-J., Tikhonovich I.A. The crucial role of roots in increased Cd-tolerance and Cd-accumulation in the pea (Pisum sativum) mutant SGECd^t. Biologia Plantarum, 2018, 62(3), 543-550.
52. Шевченко В.П., Нагаев И.Ю., Шапошников А.И., Шевченко К.В., Белимов А.А., Баташева С.Н., Гоголева Н.Е., Гоголев Ю.В., Мясоедов Н.Ф. Синтез и тестирование абсцизовой кислоты с преимущественным замещением атомов протона на атомы трития в циклогексеновую часть молекулы. Доклады РАН, 2018, Т. 483, № 3, 268-271.
53. Кимеклис А.К., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Белимов А.А., Онищук О.П., Курчак О.Н., Аксёнова Т.С., Пинаев А.Г., Мусаев А.М., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Дивергентная эволюция симбиотических бактерий: ризобии реликтового бобового Vavilovia formosa формируют обособленную группу в пределах вида R hizobium leguminosarum v iciae . Генетика. 2018. Т. 54. № 7. С. 851-855.
54. Raheem A., Shaposhnikov A., Belimov A.A., Dodd I.C., Ali B. Auxin production by rhizobacteria was associated with improved yield of wheat (Triticum aestivum ) under drought stress. Archives of Agronomy and Soil Science , 2018 , 64 , 4, 574-587.
55. Safronova V.I., Sazanova A.L., Kuznetsova I.G., Belimov A.A., Andronov E.E., Chirak E.R., Popova J.P., Tikhonovich I.A., Verkhozina A.V., Willems A. Phyllobacterium zundukense nov., a novel species of rhizobia isolated from root nodules of the legume species Oxytropis triphylla(pall.) Pers. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2018, 1644-1651.
56. Safronova V.I., Belimov A.A., Sazanova A.L., Chirak E.R., Kuznetsova I.G., Andronov E.E., Puhalsky J.V., Tikhonovich I.A., Verkhozina A.V. Taxonomically different co-microsymbionts of a relict legume, Oxytropis popoviana, have complementary sets of symbiotic genes and together increase the efficiency of plant nodulation. Molecular Plant-Microbe Interactions. 2018, 31(8), 833-841.
57. Mironicheva A., Gogoleva N., Nikolaichik Y., Khlopko Y., Safronova V.I., Ermekkaliev T., Belimov A.A., Gogolev Y. Genetic and physiological characteristics of the abscisic acid metabolizing rhizobacteria. FEBS Open Bio. 2018, 8, S1, 471.
58. Ismailov T., Gogoleva N., Mironichewa A., Balkin A., Belimov A.A., Kovtunov Y., Gogolev Y. Transcriptome analysis of the abscisic acid metabolizing rhizobacteria. FEBS Open Bio . 2018, 8, S 1, 471.
59. Шапошников А.И., Струнникова О.К., Макарова Н.М., Вишневская Н.А., Шахназарова В.Ю., Белимов А.А. Влияние корневой экссудации сахаров на развитие фузариоза у растений пшеницы и ячменя. Биомика, 2018, Т. 10. № 1. С. 020-023.
60. Воробьев Н.И., Пухальский Я.В., Свиридова О.В., Пищик В.Н., Белимов А.А. Программа вычисления фрактального индекса экссудации растениями сахаров, органических кислот и аминокислот. Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ RUS 2018614119 11.12.2017.
61. Белимов А.А., Колесников Л.Е., Донес П.М. Повышение урожайности яровой мягкой пшеницы и снижения вредоносности возбудителей болезней с помощью ассоциативных ризобактерий. Известия СПбГАУ, 2018, №3(52), 26-33.
62. Павлова О.Ю., Литвинович А.В., Лаврищев А.В., Шевченко Е.Е., Салаев И.В., Белимов А.А. Изучение почвенных растворов, вымываемых из мелиорируемых дерново-подзолистых почв. Агрохимия, 2018, №1 2 , 69 – 76 .
63. Береговая Ю.В., Тычинская И.Л., Петрова С.Н., Парахин Н.В., Пухальский Я.В., Макарова Н.М., Шапошников А.И., Белимов А.А. Сортовая специфичность эффектов ризобактерий на азотфиксирующий симбиоз и минеральное питание сои в условиях агроценоза. Сельскохозяйственная биология, 2018, 53, 5, 977-993.
64. Leppyanen I.V., Shakhnazarova V.Y., Shtark O.Y., Vishnevskaya N.A., Tikhonovich I.A., Dolgikh E . Receptor-like kinase LYK9 in Pisum sativumL. is the CERK1-like receptor that controls both plant immunity and AM symbiosis development. International Journal of Molecular Sciences, 201 8, 19, 8 .
65. Strunnikova O., Vishnevskaya N., Shakhnazarova V., Lentsman N. Development of two strains of Fusarium culmorumwith a different aggressiveness in the soil and on the roots of barley of two genotypes. European Journal of Plant Pathology, 2018,. 151, 579-592.
66. Шапошников А.И. Влияние состава коревых экзометаболитов на растительно-микробные взаимодействия в ризосфере. Актуальная биотехнология , 2018, 3(26), 477-481.
67. Kuzmicheva Y.V., Shaposhnikov A.I., Petrova S.N., Makarova N.M., Tychinskaya I.L., Puhalsky J.V., Parahin N.V., Tikhonovich I.A., Belimov A.A. Variety specific relationships between effects of rhizobacteria on root exudation, growth and nutrient uptake of soybean. Plant and Soil , 2017, 419, 83-96.
68. Копать В.В., Чирак Е.Р., Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Кабилов М.Р., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Эволюция генов fixNOQP, кодирующих цитохромоксидазу с высоким сродством к кислороду, у ризобий и родственных им бактерий. Генетика , 2017, 53, 795–804.
69. Safronova V., Belimov A., Sazanova A., Kuznetsova I., Popova J., Andronov E., Verkhozina A., Tikhonovich I. Does the Miocene-Pliocene relict legume Oxytropis triphyllaform nitrogen-fixing nodules with a combination of bacterial strains? International Journal of Environmental Studies , 2017, 74:5, 706-714.
70. Safronova V., Belimov A., Andronov E., Popova J., Tikhomirova N., Orlova O., Verkhozina A., Chimitov D., Tikhonovich I. Method for obtaining root nodules of the Baikal relict legumes in laboratory pot experiments. International Journal of Environmental Studies , 2017, 74:5, 700-705 .
71. Пухальский Ян.В., Вишнякова М.А., Лоскутов С.И., Семенова Е.В., Сексте Э.А., Шапошников А.И., Сафронова В.И., Белимов А.А., Тихонович И.А. Сорта гороха посевного ( Pisum sativum) с низкой аккумуляцией тяжелых металлов из загрязненной почвы. Сельскохозяйственная биология . 2017, 52, №3, 597-606.
72. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Belimov A.A., Andronov E.E., Chirak E.R., Osledkin Y.S., Onishchuk O.P., Kurchak O.N., Shaposhnikov A.I., Tikhonovich I.A., Willems A. Microvirga ossetica sp. nov., a species of rhizobia isolated from root nodules of the legume species Vicia alpestris Steven. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 2017 , 67. № 1 , 94-100.
73. Kichigina N.E., Pukhalsky Ya.V., Shaposhnikov A.I., Azarova T.S., Makarova N.M., Loskutov S.I., Safronova V.I., Tikhonovich I.A., Vishniyakova M.A., Semenova E.V., Kosareva I.A., Belimov A.A. Aluminum exclusion from root zone and maintenance of nutrient uptake are principal mechanisms of al tolerance in Pisum sativum Physiology and Molecular Biology of Plants . 2017, 23, 4, 851–863.
74. Raheem A., Shaposhnikov A., Belimov A.A., Dodd I.C., Ali B. Auxin production by rhizobacteria was associated with improved yield of wheat ( Triticum aestivum) under drought stress. Archives of Agronomy and Soil Science. 2018, 64, 4, 574-587.
75. Strunnikova O., Vishnevskaya N., Shakhnazarova V., Lentsman N. Development of two strains of Fusarium culmorumwith a different aggressiveness in the soil and on the roots of barley of two genotypes. European J ournal of Plant Pathol jgy, 2017, 151, 3, 579–592 .
76. Leppyanen I., Shakhnazarova V ., Shtark O ., Vishnevskaya N ., Tikhonovich I ., Dolgikh E . Receptor-like kinase LYK9 in Pisum sativum is the CERK1-like receptor that controls both plant immunity and AM symbiosis development // International Journal of Molecular Science, 2018, 19, 8.
77. Леппянен И . В ., Шахназарова В . Ю ., Вишневская Н . А ., Долгих Е . А ., Струнникова О . К . Изучение механизмов взаимоотношений гороха Pisum sativum и двух штаммов Fusarium culmorumразной агрессивностью. Микология и фитопатология . 2017. 4: 241-248 .
78. Wang Q., Dodd I.C., Belimov A.A., Jiang F. Rhizosphere bacteria containing 1-aminocyclopropane-1- carboxylate deaminase increase growth and photosynthesis of pea plants under salt stress by limiting Na⁺ Functional Plant Biology. 2016, 43, 161–172.
79. Belimov A.A., Malkov N.V., Puhalsky J.V., Safronova V.I., Tikhonovich I.A. High specificity in response of pea mutant SGECd^tto toxic metals: growth and element composition. Environmental and Experimental Botany . 2016, 128, 91-98.
80. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Belimov A.A., Andronov E.E., Chirak E.R., Osledkin Y.S., Onishchuk O.P., Kurchak O.N., Shaposhnikov A.I., Willems A., Tikhonovich I.A. Microvirga ossetica  nov. a new species of rhizobia isolated from root nodules of the legume species Vicia alpestrisSteven originated from North Ossetia region in the Caucasus. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2016, 67(1), 94-100.
81. Шапошников А . И ., Моргунов А ., Акин Б ., Макарова Н . М ., Белимов А . А ., Тихонович И . А . Сравнительные характеристики корневых систем и корневой экссудации синтетического , примитивного и современного сортов пшеницы // Сельскохозяйственная Биология. 2016, 51, №1, 58-78.
82. Воробьев Н.И., Пухальский Я.В., Свиридова О.В., Пищик В.Н., Белимов А.А., Толмачев С.Ю. Влияние вращающихся магнитных полей на спин-конформацию сигнальных молекул и на микробно-растительные взаимодействия c участием этих молекул. Вестник защиты растений, 2016, 89, №3, 39-41.
83. Шапошников А.И., Пухальский Я.В., Кравченко Л.В., Белимов А.А. Роль корневой экссудации в трофических взаимодействиях растений с ризосферными микроорганизмами. СПб.: Информ-Навигатор, 2016, 104 с.
84. Вишнякова М.А., Семенова Е.В., Косарева И.А., Кравчук Н.Д., Лоскутов С.И., Пухальский Я.В., Шапошников А.И., Сазанова А.Л., Белимов А.А.. Метод экспресс- оценки алюмотолерантности у гороха посевного ( Pisumsativum L .). Сельскохозяйственная биология, 2015, 50(3), 353-360.
85. Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Пинаев А.Г., Верхозина А.В., Тихомирова Н.Ю., Оследкин Ю.С., Белимов А.А. Изучение генетического разнообразия микросимбионтов Байкальских видов чины ( Lathyrus), горошка ( Vicia ), остролодочника ( Oxytropis ) и астрагала ( Astragalus ). Сельскохозяйственная Биология, 2015, 50(3), 345-352.
86. Belimov A., Dodd I., Safronova V., Shaposhnikov A., Azarova T., Makarova N., Davies W., Tikhonovich I. Rhizobacteria that produce auxins and contain 1-amino-cyclopropane-1-carboxylic acid deaminase decrease amino acid concentrations in the rhizosphere and improve growth and yield of well-watered and water-limited potato ( Solanum tuberosum). Annals of Applied Biology, 2015, 167(1), 11-25.
87. Belimov A., Puhalsky I., Safronova V., ShaposhnikovA., Vishnyakova M., Semenova E., Zinovkina N., Makarova N., Wenzel W., Tikhonovich I. Role of plant genotype and soil conditions in symbiotic plant-microbe interactions for adaptation of plants to cadmium-polluted soils. Water Air and Soil Pollution, 2015, 226: 264.
88. Belimov A., Dodd I., Safronova V., Malkov N., Davies W., Tikhonovich I. The cadmium-tolerant pea ( Pisum sativum ) mutant SGECd^tis more sensitive to mercury: assessing plant water relations. Journal of Experimental Botany, 2015, 66(8), 2359-2369.
89. Safronova V., Kuznetsova I., Sazanova A.,·Kimeklis A., Belimov A., Andronov E., Pinaev A., Pukhaev A., Popov K.,·Akopian J., Willems A., Tikhonovich I. Extra ‑ slow ‑ growing Tardiphaga strains isolated from nodules of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Archives of Microbiology, 2015, 197(7), 889-898.
90. Strunnikova O.K., Vishnevskaya N.A., Ruchiy A.S., Shakhnazarova V.Yu., Vorobyov N.I., Chebotar V.K. The influence of soils with different textures on development, colonization capacity and interactions between Fusarium culmorumand Pseudomonas fluorescens in soil and on barley roots. Plant and Soil , 2015, 389, 131 - 144.
91. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Белимов А.А., Пинаев А.Г., Чижевская Е.П., Пухаев А.Р., Попов К.П., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Филогенетический анализ штаммов рода Rhizobium, выделенных из клубеньков Vavilovia formosa (stev.) Fed . Сельскохозяйственная Биология, 2015, 50(5), 655-664.
92. Кузмичева Ю.В., Шапошников А.И., Азарова Т.С., Петрова С.Н., Наумкина Т.С., Борисов А.Ю., Белимов А.А., Кравченко Л.В., Парахин Н.В., Тихонович И.А. Состав корневых экзометаболитов высокосимбиотрофного сорта гороха Триумф и его родительских форм. Физиология растений, 2014, 61, №1, 121-128.
93. Belimov A.A, Dodd I.C., Safronova V.I., Dumova V.A., Shaposhnikov A.I., Ladatko A.G., Davies W.J. Abscisic acid metabolizing rhizobacteria decrease ABA concentrations in plantaand alter plant growth. Plant Physiology and Biochemistry, 2014, 74, 84-91.
94. Safronova V.I. Kimeklis A.K., Chizhevskaya E.P., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Tikhonovich I.A. Genetic diversity of rhizobia isolated from nodules of the relic species Vavilovia formosa(Stev.) Fed. Antonie van Leeuwenhoek, 2014, 105, 389–399.
95. Strunnikova O.K., Vishnevskaya N.A., Ruchiy A.S., Shakhnazarova V.Y. Vorobyov N.I., Chebotar V.K. The influence of soils with different textures on development, olonization capacity and interactions between Fusarium culmorumand Pseudomonas fluorescens in soil and on barley roots . Plant and Soil, 2014, DOI 10.1007/s11104-014-2351-y.
96. Струнникова О.К., Шахназарова В.Ю., Вишневская Н.А., Ручий А.С., Чижевская Е.П. Особенности колонизации ячменя почвообитающим грибом Fusarium culmorum.Микология и фитопатология , 2013, 47, 3, 196–203.
97. Щербаков А.В., Брагина А.В., Кузьмина Е.Ю., Берг К., Мунтян А.Н., Макарова Н.М., Мальфанова Н.В., Кардинале М., Берг Г., Чеботарь В.К., Тихонович И.А. Эндофитные бактерии сфагновых мхов как перспективные объекты сельскохозяйственной микробиологии. Микробиология , 2013 , 82 , №3 , 312-322.
98. Dodd I.C., Belimov A.A, Elphinstone E.D., Chen L., Teijeiro R.G., Kemp C., Fielding H., Wright H. Exploiting rhizobacteria that mediate plant hormone status. Aspects of Applied Biology 120 , 2013, 29-34.
99. Jiang F., Chen L., Belimov A.A., Shaposhnikov A.I., Gong F ., Meng X., Hartung W., Jeschke D.W., Davies W.J., Dodd I.C. Multiple impacts of the plant growth promoting rhizobacterium Variovorax paradoxus5C-2 on nutrient and ABA relations of Pisum sativum. Journal of Experimental Botany, 2012, 63, 6421-6430.
100. I., Piluzza G., Zinovkina N.Y., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Bullitta S. Relationships between pasture legumes, rhizobacteria an nodule bacteria in heavy metal polluted mine waste of SW Sardinia. Symbiosis, 2012, DOI 10.1007/k13199-012-0207-x.
101. Chen L., Dodd I.C., Theobald J.C., Belimov A.A., Davies W.J. The rhizobacterium Variovorax paradoxus5C-2, containing ACC deaminase, promotes growth and development of Arabidopsis thalianavia an ethylene-dependent pathway. Journal of Experimental Botany. 2012. V . 64, P. 1565-1573.
102. Баймиев Ан.Х., Иванова Е.С., Птицын К.Г., Белимов А.А., Сафронова В.И., Баймиев Ал.Х. Генетическая характеристика клубеньковых бактерий дикорастущих бобовых Южного Урала. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2012, 1, 29-34.
103. Белимов А.А. Взаимодействия ассоциативных бактерий с растениями: роль биотических и абиотических факторов. PalmariumAcad. Publ. 2012, 228 p., ISBN-13: 978-3-8473-9692-5.
104. Белимов А.А., Демчинская С.В., Сафронова В.И. Реакция гороха на инокуляцию ризосферными АЦК-утилизирующими бактериями в присутствии эндомикоризного гриба Glomus intraradices. Сельскохозяйственная Биология, 2012, №3, 90-97.
105. Шахназарова В. Ю., Феоктистова А. С., Чижевская Е. П., Вишневская Н.А., Струнникова О.К. Оптимизация способа выделения ДНК для идентификации и количественного определения Fusariumculmorumв корнях ячменя и пшеницы методом ПЦР. Микология и фитопатология, 2012, 46 , 4, 287–292.
106. Худяков И.Я. Генетика развития и симбиотический потенциал цианобактерий. Экологическая генетика, 2012. том X, выпуск 4, С. 14-28.
107. Шапошников А.И., Азарова Т.С., Кравченко Л.В., А.А. Бажанова, Д.П. Бажанов, О.Г. Бабак, Н.А. Некрашевич, А.В. Кильчевский. Корневые выделения генотипов томата ( SolanumlycopersicumL .), отличающихся отзывчивостью на бактеризацию // Молекулярная и прикладная генетика. 2012. Т . 14. С . 63-68.
108. Малков Н.В., Зиновкина Н.Ю., Сафронова В.И., Белимов А.А. Повышение устойчивости бобово-ризобиального симбиоза к кадмию с помощью ризосферных бактерий, содержащих АЦК деаминазу. Достижения науки и техники АПК . 2012, 9, 53-57.
109. Egamberdieva D., Kucharova Z., Davranov K, Berg G., Makarova N., Azarova T., Chebotar V., Tikhonovich I., Kamilova F., Validov S., Lugtenberg B. Bacteria able to control foot and root rot and to promote growth of cucumber in salinated soil. Biology and Fertility of Soils. 2011, 47, 197-205.
110. Safronova V.I., Piluzza G., Bullitta S., Belimov A.A. Use of legume-microbe symbioses for phytoremediation of heavy metal polluted soils: advantages and potential problems (Review). In: Handbook for Phytoremediation, Golubev I.A. (Ed.), NOVA Sci. , USA, 2011, p. 443-469.
111. Белимов А.А., Сафронова В.И. АЦК деаминаза и растительно-микробные взаимодействия (обзор) . Сельскохозяйственная биология. 2011, №3, 23-28.
112. Белимов А.А., Тихонович И.А. Микробиологические аспекты устойчивости и аккумуляции тяжелых металлов у растений (обзор) . Сельскохозяйственная биология. 2011, №3, 10-15.
113. Белимов А.А., Тихонович И.А. Роль микроорганизмов в устойчивости к тяжелым металлам и их аккумуляции растениями. Сборник трудов совещания «Проблемы техногенного воздействия на сферу агропромышленного производства: теория и практика», ред. Р.М. Алексахин, Обнинск, ВНИИСХРАЭ, 2011, 89-99.
114. Кравченко Л.В., Шапошников А.И., Макарова Н.М., Азарова Т.С., Львова К.А., Костюк И.И., Ляпунова О.А., Тихонович И.А. Состав корневых экзометаболитов мягкой пшеницы и томата, влияющих на растительно-микробные взаимодействия в ризосфере. Физиология растений, 2011, 58, 5: 1-6.
115. Сафронова В.И., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Павлова Е.А. Определение таксономического положения микросимбионтов копеечника ( Hedysarum) и астрагала ( Astragalus) на основе анализа генов рибосомальных РНК. Сельскохозяйственная биология, 2011, №3, 61-64.
116. Тихонович И.А., Кравченко Л.В., Шапошников А.И. Корневые выделения как важный фактор формирования наномолекулярных структур ризосферы // Доклады РАСХН, 2011, 1: 25-27.
117. Чеботарь В.К., Петров В.Б., Шапошников А.И., Кравченко Л.В. Биохимические критерии оценки агрономически значимых свойст бацилл, используемых при создании микробиологических препаратов. Сельскохозяйственная биология, 2011, №3: 119–122.
118. Шапошников А.И., Белимов А.А., Кравченко Л.В., Виванко Д.М. Взаимодействие ризосферных бактерий с растениями: механизмы образования и факторы эффективности ассоциативных симбиозов (обзор) . Сельскохозяйственная биология, 2011, №3, 16-22.
119. Шапошников А.И., Львова К.А., Бодягина К.Б., Журавлева Е.В., Сафронова В.И., Белимов А.А. Повышение устойчивости картофеля к недостатку влаги и экстремальным температурам с помощью ассоциативных ризобактерий. Труды межд. конф. «Системы высокоурожайного земледелия и биотехнологии как основа инновационной модернизации АПК в условиях климатических изменений», 16-17 марта 2011 г., Уфа, С. 162-170.
120. Струнникова О.К. Изучение почвенной стадии развития Fusarium culmorumдля разработки мер защиты ячменя от гнили. Сельскохозяйственная биология, 2011, 3, 98–101.
121. Струнникова О.К., Феоктистова А. С., Вишневская Н. А., Чеботарь В. К. Роль конкуренции между Pseudomonas fluorescens 2137GUSи Fusarium culmorumза колонизацию корней ячменя. Микология и фитопатология, 2011, 45, 4, 362–369.