Лаборатория генетики и селекции микроорганизмов №6

Заведующая лабораторией : Румянцева Марина Львовна Телефон: +7 (812) 476 28 02 Лаборатория генетики и селекции микроорганизмов стоит у истоков научного направления, связанного с изучением молекулярно-генетических основ формирования растительно-микробного симбиоза. Основателем лаборатории является д.б.н. проф. Симаров Б.В., под руководством которого выявлено и изучено более двух десятков новых генов S. meliloti, мутации в которых приводят к получению высокоэффективных конкурентоспособных штаммов, перспективных для производства биопрепаратов; защищено 18 кандидатских диссертаций.  В настоящее время в лаборатории генетики и селекции микроорганизмов под руководством Румянцевой М.Л. проводятся оригинальные исследования по изучению генетических основ биоразнообразия клубеньковых бактерий (ризобий) в географически различных экосистемах. Коллектив лаборатории имеет богатый опыт в изучении генетического разнообразия природных популяций симбионтов люцерны, донника, клевера и козлятника. Проводится анализ геномов клубеньковых бактерий и генов, детерминирующих симбиотическую активность и стрессороустойчивость микроорганизмов (разные виды осмотического стресса). В лаборатории создана рабочая коллекция природных штаммов ризобий, выделенных из очагов разнообразия бобовых культур, относящихся к генцентрам культурных растений, расположенных на территориях Кавказа, Туркмении, Узбекистана, Казахстана (район Приаралья) и Китая.   В последние годы в лаборатории успешно развиваются исследования по изучению геномов бактериофагов, специфичных к ризобиям. Разработаны методы выделения бактериофагов из почв, методы оценки их литической активности. В лаборатории выполняются исследования по изучению молекулярно-генетических механизмов, лежащих в основе фагово-микробных взаимодействий, в том числе изучение систем антифаговой защиты бактериальной клетки. Коллективом соавторов опубликован комплекс методов и подходов для изучения клубеньковых бактерий в виде монографии "Биологическое разнообразие клубеньковых бактерий в экосистемах и агроценозах. Теоретические основы и методы", который был написан на базе накопленных теоретических и практических знаний в данной области. В лаборатории разработан уникальный метод оценки симбиотической активности ризобий в модельных условиях микровегетационных опытов. Накопленные знания используются для получения высокоэффективных стрессороустойчивых штаммов и для создания высокопродуктивных стрессороустойчивых растительно-микробных систем, перспективных для практики.  Коллектив имеет патенты на штаммы, используемые для производства биопрепарата (патенты на изобретения RU  2734944 C2, 26.10.2020 и RU 2593714 C1, 10.08.2016), на растительно-микробную систему на основе люцерны изменчивой (Патент на изобретение RU 2699526 C2, 05.09.2019). Исследования, проводимые в лаборатории, неоднократно были поддержаны грантами РФФИ (1992-2020), а также международными грантами (INTAS, INCO-COPERNICUS, BACDIVERСITY, CRDF(РФФИ-АФГИР)  в период 1997-2012). За последние годы коллектив участвовал в выполнении проектов, поддержанных РНФ (20-16-00105, 17-16-01095), проекта по созданию и развитию НЦМУ «Агротехнологии будущего» (соглашение с Минобрнауки Российской Федерации; 2020-2024 гг.), а также проекта ФНЦП № 14.607.21.0178 от 26.09.2017 г. «Создание микробиологических препаратов для расширения адаптационного потенциала сельскохозяйственных культур по питанию, устойчивости к стрессам и фитопатогенам» (2017-2020). В настоящее время коллектив является участником проекта РНФ 24-26-00274. Коллектив лаборатории проводит совместные исследования со специалистами из ФИЦ Всероссийского института генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова (ВИР), Федерального научного центра кормопроизводства и агроэкологии имени В.Р. Вильямса (ФНЦ «ВИК им. В.Р. Вильямса»), факультета агротехнологии, почвоведения и экологии СПбГАУ, Санкт-Петербургского политехнического университета Петра Великого (СПбПУ) и ФГБУ гриппа им. А.А. Смородинцева, с кафедрой генетики Университета г. Флоренция, Италия. За последние пять лет успешно защищено семь выпускных квалификационных работ бакалавров и магистров СПбГУ, СПбПУ и СПбГТИ(ТУ) и две научно-квалификационные работы аспирантов ВНИИСХМ.

Сотрудники

• 

  Румянцева Марина Львовна

  заведующая лабораторией,к.б.н.

  •  
• 

  Симаров Борис Васильевич

  Главный научный сотрудник, доктор биологических наук

  •  
• 

  Мунтян Виктория Спартаковна

  Младший научный сотрудник

  •  
• 

  Мунтян Алексей Николаевич

  Младший научный сотрудник

  •  
• 

  Чижевская Елена Петровна

  Старший научный сотрудник

  •  
• 

  Владимирова (Черкасова) Мария Евгеньевна

  Инженер-исследователь

  •  
• 

  Саксаганская Алла Сергеевна

  Младший научный сотрудник

  •  
• 

  Козлова Александра Павловна

  Инженер-исследователь

  •  
• 

  Горбунова Мария Константиновна

  Студент, техник 1 категории
• 

  Бочарова Мария Алексеевна

  Студент, техник 1 категории

Смирнова Татьяна Анатольевна – инженер-исследователь

ГРАНТЫ/КОНТРАКТЫ

• РНФ 24-26-00274 «Ризобиофаги агроценозов: специфичность вирулентности, таксономическое и геномное разнообразие» (2024-2025 гг.; руководитель – д.б.н. Симаров Б.В.)
• РНФ 20-16-00105 «Системы иммунитета азотфиксирующих клубеньковых бактерий: оценка их разнообразия и перспектив применения в агробиотехнологии» (2020-2022 гг.; руководитель – д.б.н. Симаров Б.В.)
• РНФ 17-16-01095 «Анализ закономерности геномных перестроек у вирулентных и невирулентных клубеньковых бактерий и оценка рисков их влияния на хозяйственно-ценные свойства и стрессоустойчивость растительно-микробных систем» (2017-2019 гг.; руководитель – к.б.н. Румянцева М.Л.)
• НЦМУ «Агротехнологии будущего» (Соглашения с Министерством науки и высшего образования Российской Федерации № 075-15-2020-920 от 16.11.2020 г. и № 075-15-2022-320 от 20.04.2022 г.)
• Государственный контракт Министерства образования и науки Российской Федерации (Соглашение № 14.607.21.0178, RFMEFI60717X0178)
• РФФИ (18 проектов за период с 1993 по 2020 гг.)
• РФФИ-АФГИР 09-04-92513-ИК_а/ CRDF CGP RUB1-2942-ST-09 (двухсторонний грант Россия-США)
• Государственный контракт № 16.М04.11.0013 по межгосударственной целевой программе ЕврАзЭС «Инновационные биотехнологии» на 2011-2015 годы
• Грант на сотрудничество от Министерства науки Финляндии № 1132544
• Международные проекты: INCO–COPERNICUS (INTAS, ICA2–CT–2000–10001); “BACDIVERS” (QLK3–CT–2002–02097)

ПУБЛИКАЦИИ ЗА 2019–2024 

1. Vladimirova, M.E.; Roumiantseva, M.L.; Saksaganskaia, A.S.; Muntyan, V.S.; Gaponov, S.P.; Mengoni, A. Hot Spots of Site-Specific Integration into the Sinorhizobium meliloti Chromosome. Int. J. Mol. Sci. 2024, 25, 10421. https://doi.org/10.3390/ijms251910421
2. Kozlova, A.P.; Muntyan, V.S.; Vladimirova, M.E.; Saksaganskaia, A.S.; Kabilov, M.R.; Gorbunova, M.K.; Gorshkov, A.N.; Grudinin, M.P.; Simarov, B.V.; Roumiantseva, M.L. Soil Giant Phage: Genome and Biological Characteristics of Sinorhizobium Jumbo Phage. Int. J. Mol. Sci. 2024, 25, 7388. https://doi.org/10.3390/ijms25137388
3. Pishchik, V.N.; Chizhevskaya, E.P.; Kichko, A.A.; Aksenova, T.S.; Andronov, E.E.; Chebotar, V.K.; Filippova, P.S.; Shelenga, T.V.; Belousova, M.H.; Chikida, N.N. Metabolome and Mycobiome of Aegilops tauschii Subspecies Differing in Susceptibility to Brown Rust and Powdery Mildew Are Diverse. Plants 2024, 13, 2343. https://doi.org/10.3390/plants13172343
4. Pishchik, V.N.; Chizhevskaya, E.P.; Chebotar, V.K.; Mirskaya, G.V.; Khomyakov, Y.V.; Vertebny, V.E.; Kononchuk, P.Y.; Kudryavtcev, D.V.; Bortsova, O.A.; Lapenko, N.G.; et al. PGPB Isolated from Drought-Tolerant Plants Help Wheat Plants to Overcome Osmotic Stress. Plants 2024, 13, 3381. https://doi.org/10.3390/plants13233381
5. Chebotar, V.K.; Gancheva, M.S.; Chizhevskaya, E.P.; Erofeeva, A.V.; Khiutti, A.V.; Lazarev, A.M.; Zhang, X.; Xue, J.; Yang, C.; Tikhonovich, I.A. Endophyte Bacillus vallismortis BL01 to Control Fungal and Bacterial Phytopathogens of Tomato (Solanum lycopersicum L.) Plants. Horticulturae 2024, 10, 1095. https://doi.org/10.3390/horticulturae10101095
6. Chebotar VK, Gancheva MS, Chizhevskaya EP, Keleinikova OV, Baganova ME, Zaplatkin AN, Husainov KA. Whole-genome sequence of Kosakonia cowanii strain W006, isolated from seeds of Triticum aestivum L. Microbiol Resour Announc. 2024. 13(4):e0118123. https://doi.org/10.1128/mra.01181-23
7. Chebotar, V.K.; Zaplatkin, A.N.; Chizhevskaya, E.P.; Gancheva, M.S.; Voshol, G.P.; Malfanova, N.V.; Baganova, M.E.; Khomyakov, Y.V.; Pishchik, V.N. Phytohormone Production by the Endophyte Bacillus safensis TS3 Increases Plant Yield and Alleviates Salt Stress. Plants 2024, 13, 75. https://doi.org/10.3390/plants13010075
8. Chebotar VK, Gancheva MS, Keleinikova OV, Baganova ME, Zaplatkin AN, Pishchik VN, Chizhevskaya EP. Whole-genome sequence of Bacillus paralicheniformis strain R243 isolated from rice (Oryza sativa L.) roots. Microbiol Resour Announc. 2024. 13(11):e0087924. https://doi.org/10.1128/mra.00879-24
9. Chebotar VK, Myskova AV, Khudyaeva M, Keleinikova OV, Baganova ME, Zaplatkin AN, Pishchik VN, Chizhevskaya EP. Draft genome sequence of endophyte Bacillus amyloliquefaciens strain Apn01R, isolated from the roots of Alhagi pseudalhagi (Bieb.) Fisch. Microbiol Resour Announc. 2024. e0107424. https://doi.org/10.1128/mra.01074-24
10. Chebotar VK, Myskova AV, Khudyaeva M, Keleinikova OV, Baganova ME, Zaplatkin AN, Pishchik VN, Chizhevskaya EP. Draft genome sequence and analysis of endophyte Bacillus amyloliquefaciens strain Can02R isolated from the roots of Chenopodium album L. Microbiol Resour Announc. 2024. e0107524. https://doi.org/10.1128/mra.01075-24
11. Kozlova, A.P.; Saksaganskaia, A.S.; Afonin, A.M.; Muntyan, V.S.; Vladimirova, M.E.; Dzyubenko, E.A.; Roumiantseva, M.L. A Temperate Sinorhizobium Phage, AP-16-3, Closely Related to Phage 16-3: Mosaic Genome and Prophage Analysis. Viruses 2023, 15, 1701. https://doi.org/10.3390/v15081701
12. Vladimirova M.E., Pernak E.V., Muntyan V.S., Saksaganskaia A.S., Kozlova A.P., Afonin A.M., Yurkov A.P., Zhukov V.A., Roumiantseva M.L. Chloroplast Genome of Medicago lupulina L. var. vulgaris Koch: Structure, Sequences Introduced as a Result of HGT and Viral Nature // Russian Journal of Plant Physiology. 2023. V. 70. Iss. 8. Article 193. https://doi.org/10.1134/S1021443723602331
13. Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Afonin A.M., Muntyan A.N., Roumiantseva M.L. Analysis of salt-sensitive and salt-tolerant Sinorhizobium meliloti strains using DNA microarray, phenotype microarray and genome mining techniques // Proceedings of 23rd International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2023. 2023. V. 23. Iss. 6.1. P. 129-136. https://doi.org/10.5593/sgem2023/6.1/s25.15
14. Pernak E.V., Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Afonin A.M., Roumiantseva M.L. Analysis of CRISPR cassette elements in native isolates of Sinorhizobium meliloti isolated in the Central Asian origin of plant diversity // Proceedings of 23rd International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2023. 2023. V. 23. Iss. 6.1. P. 113-120. https://doi.org/10.5593/sgem2023/6.1/s25.13
15. Kamova A., Stepanova T., Orlova A., Stepanova G., Rumyantseva M. Methods of increasing the productivity of various varieties and hybrids of variegated alfalfa in the conditions of arable farming biologization BIO Web Conf., 66 (2023) 11001 https://doi.org/10.1051/bioconf/20236611001
16. Chizhevskaya E.P., Lapenko N.G., Chebotar V.K. Antibacterial and antifungal activity of Chenopodium album L. // Russian Journal of Plant Physiology. 2023. V. 70. Iss. 8. Article 194. https://doi.org/10.1134/S1021443723602525
17. Chebotar, V.K.; Chizhevskaya, E.P.; Andronov, E.E.; Vorobyov, N.I.; Keleinikova, O.V.; Baganova, M.E.; Konovalov, S.N.; Filippova, P.S.; Pishchik, V.N. Assessment of the Rhizosphere Bacterial Community under Maize Growth Using Various Agricultural Technologies with Biomodified Mineral Fertilizers. Agronomy 2023, 13, 1855. https://doi.org/10.3390/agronomy13071855
18. Chebotar V.K., Chizhevskaya E.P., Khonina O.V., Kostitsin R.D., Kurmanbayev A.A., Mukhambetov B., Pishchik V.N., Baganova M.E., Lapenko N.G. Biotechnological potential of galophytes and their microbiomes for agriculture in Russia and Kazakhstan // Russian Journal of Plant Physiology, 2023, V. 70. Iss.8. Article 183. https://doi.org/10.1134/S1021443723602513
19. Chebotar, V. K., Gancheva, M. S., Chizhevskaya, E. P., Keleinikova, O. V., Baganova, M. E., Zaplatkin, A. N., & Husainov, K. A. (2023). Whole-genome sequence of Paenibacillus amylolyticus strain W018, isolated from Triticum aestivum L. seeds, obtained using nanopore sequencing. Microbiology resource announcements, 12(10), e0068723. https://doi.org/10.1128/MRA.00687-23
20. Chebotar, V.K.; Gancheva, M.S.; Chizhevskaya, E.P.; Baganova, M.E.; Keleinikova, O.V.; Husainov, K.A.; Pishchik, V.N. Genome Sequence of the Plant-Growth-Promoting Endophyte Curtobacterium flaccumfaciens Strain W004. Data 2023, 8, 187. https://doi.org/10.3390/data8120187
21. Чеботарь В.К., Заплаткин А.Н., Балакина С.В., Гаджиев Н.М., Лебедева В.А., Хютти А.В., Чижевская Е.П., Филиппова П.С., Келейникова О.В., Баганова М.Е., Пищик В.Н. Урожайность и поражаемость картофеля ризоктониозом и фитофторозом под влиянием эндофитных бактерий Bacillus thuringiensis W65 и Bacillus amyloliquefaciens P20 // Сельскохозяйственная биология. 2023. Т. 58. № 3. С. 429-446. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2023.3.429rus
22. Zverev, A. O., Kurchak, O. N., Orlova, O. V., Onishchuk, O. P., Kichko, A. A., Eregin, A. V., Naliukhin, A. N., Pinaev, A. G., & Andronov, E. E. (2023). Dynamic of the Soil Microbiota in Short-Term Crop Rotation. Life (Basel, Switzerland), 13(2), 400. https://doi.org/10.3390/life13020400
23. Онищук О.П., Курчак О.Н., Кимеклис А.К., Аксенова Т.С., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Биоразнообразие симбиозов, образуемых клубеньковыми бактериями Rhizobium leguminosarum c бобовыми растениями галегоидного комплекса // Сельскохозяйственная биология. 2023. Т. 58. № 1. С. 87-99. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2023.1.87rus
24. Roumiantseva M.L., Vladimirova M.E., Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Kozlova A.P., Afonin A.M., Baturina O.A., Simarov B.V. Ensifer meliloti L6-AK89, an Effective Inoculant of Medicago lupulina Varieties: Phenotypic and Deep-Genome Screening // Agronomy. 2022. V. 12. Iss. 4. 766. https://doi.org/10.3390/agronomy12040766
25. Muntyan V.S., Roumiantseva M.L. Molecular Phylogenetic Analysis of Salt-Tolerance-Related Genes in Root-Nodule Bacteria Species Sinorhizobium meliloti // Agronomy. 2022. V. 12. Iss. 8. 1968. https://doi.org/10.3390/agronomy12081968
26. Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Afonin A.M., Muntyan A.N., Baturina O.A., Dzuybenko E.A., Saksaganskaya A.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L., Kabilov M.R. Complete Genome of Sinorhizobium meliloti AK76, a Symbiont of Wild Diploid Medicago lupulina from the Mugodgary Mountain Region // Microbiology Resource Announcements. 2022. V. 11. Iss. 3. e0108821. https://doi.org/10.1128/mra.01088-21
27. Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Muntyan A.N., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Abundance of phage-related sequences on non-symbiotic plasmids of Sinorhizobium meliloti from centers of legume plants diversity // 22nd International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2022. 2022. V. 22. Iss. 6.1. P. 49-56. https://doi.org/10.5593/sgem2022/6.1/s25.06
28. Muntyan V.S., Saksaganskaia A.S., Muntyan A.N., Vladimirova M.E., Roumiantseva M.L. Stress and immunity of nodule bacteria Sinorhizobium meliloti: localization, polymorphism and phylogeny of genetic determinants // 22nd International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2022. 2022. V. 22. Iss. 6.1. P. 121-128. https://doi.org/10.5593/sgem2022/6.1/s25.15
29. Козлова А.П., Джегер Г.С., Болотникова О.И., Румянцева М.Л. Изучение взаимоотношений между ризобиофагами и бактериями Sinorhizobium meliloti в целях совершенствования биопрепаратов // «Биотехнологии и безопасность в техносфере»: сборник материалов II Национальной научной конференции студентов и молодых ученых, 2–3 марта 2022 г. В 2 ч. Ч. 1. С 18-20.
30. Chebotar V.K., Chizhevskaya E.P., Vorobyov N.I., Bobkova V.V., Pomyaksheva L.V., Khomyakov Y.V., Konovalov S.N. The Quality and Productivity of Strawberry (Fragaria × ananassa Duch.) Improved by the Inoculation of PGPR Bacillus velezensis BS89 in Field Experiments // Agronomy. 2022. V. 12. Iss. 11. 2600. https://doi.org/10.3390/agronomy12112600
31. Chebotar V.K., Chizhevskaya E.P., Baganova M.E., Keleinikova O.V., Yuzikhin O.S., Zaplatkin A.N., Khonina O.V., Kostitsin R.D., Lapenko N.G. Endophytes from Halotolerant Plants Aimed to Overcome Salinity and Draught // Plants. 2022. V. 11. Iss. 21. 2992. https://doi.org/10.3390/plants11212992
32. Chebotar V.K., Gancheva M.S., Chizhevskaya E.P., Keleinikova O.V., Baganova M.E., Zaplatkin A.N., Pishchik V.N. Draft Genome Sequence of Bacillus vallismortis Strain BL01, Isolated from Artemisia lerchiana Web. Roots // Microbiology Resource Announcements. 2022. V. 11. Iss. 11. e0064722. https://doi.org/10.1128/mra.00647-22
33. Mirskaya G.V., Khomyakov Y.V., Rushina N.A., Vertebny V.E., Chizhevskaya E.P., Chebotar V.K., Chesnokov Y.V., Pishchik V.N. Plant Development of Early-Maturing Spring Wheat (Triticum aestivum L.) under Inoculation with Bacillus sp. V2026 // Plants (Basel). 2022. V. 11. Iss. 14. 1817. https://doi.org/10.3390/plants11141817
34. Chebotar V.K., Gancheva M.S., Voshol G.P., Malfanova N.V., Karasev E.S., Chizhevskaya E.P., Zaplatkin A.N., Khiutti A.V., Lazarev A.M., Gadjiev N.M., Lebedeva V.A., Balakina S.V. Draft Genome Sequence of the Tomato Stem Endophyte Bacillus safensis TS3 // Microbiology Resource Announcements. 2022. V. 11. Iss. 11. e0081622. https://doi.org/10.1128/mra.00816-22
35. Sviridova O.V., Vorobyov N.I., Andronov E.E., Kurchak O.N., Chizhevskaya E.P., Pukhalskiy Ya.V., Pishchik V.N., Loskutov S.I., Sitnov V.Yu. Optimum ratio of complex biological product and fertilize (NPK) and the contribution of fungi and bacteria to the general decomposition and mulching of coniferous wood waste // Agronomy Research. 2022. V. 20. No. 4. P. 827–841. https://doi.org/10.15159/ar.22.059
36. Muntyan V.S., Afonin A.M., Vladimirova M.E., Saksaganskaya A.S., Gribchenko E.S., Baturina O., Roumiantseva M.L. Complete genome sequence of Sinorhizobium meliloti S35m, a salt-tolerant isolate from alfalfa rhizosphere in soil native to the Caucasus region // Microbiology Resource Announcements. 2021. V. 10. Iss. 11. e01417-20. https://doi.org/10.1128/MRA.01417-20
37. Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Muntyan A.N., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Allelic polymorphism of symbiotically essential genes of Sinorhizobium meliloti native to legume plants origin at the Caucasus // 21th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2021. 2021. V. 21. Iss. 6.1. P. 55-62. https://doi.org/10.5593/sgem2021/6.1/s25.08
38. Saksaganskaia A.S., Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Roumiantseva M.L. Sinorhizobium meliloti harboured distinct alleles of nod genes showed different symbiotic activity on Medicago lupulina and Medicago varia // 21th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2021. 2021. V. 21. Iss. 6.1. P. 257-262. https://doi.org/10.5593/sgem2021/6.1/s25.33
39. Onishchuk O., Kurchak O., Chizhevskaya E., Simarov B., Provorov N. Supply of acetyl-CoA to N2-fixing bacteroids: Insights from the mutational and proteomic analyses of Sinorhizobium meliloti // Biological Communications. 2021. V. 66. Iss. 2. P. 124-128. https://doi.org/10.21638/spbu03.2021.203
40. Pishchik V., Mirskaya G., Chizhevskaya E., Chebotar V., Chakrabarty D. Nickel stress-tolerance in plant-bacterial associations // PeerJ. 2021. V.9. e12230. https://doi.org/10.7717/peerj.12230
41. Chebotar V.K., Voshol G.P., Malfanova N.V., Chizhevskaya E.P., Zaplatkin A.N., Komarova O.V., Baganova M.E., Lazarev A.M., Balakina S.V. Draft genome sequence of plant growth-promoting Bacillus velezensis BS89 // Microbiol Resour Announc. 2021. V. 10. Iss. 1. e01294-20. https://doi.org/10.1128/MRA.01294-20
42. Chebotar V.K., Zaplatkin A.N., Komarova O.V., Baganova M.E., Chizhevskaya E.P., Polukhin N.I., Balakina S.V. Endophytic bacteria for development of microbiological preparations for increasing productivity and protection of new potato varieties // Research on Crops. 2021. V. 22. Special Issue. P. 104-107. https://doi.org/10.31830/2348-7542.2021.025
43. Zavalin A., Chebotar V., Alferov, A., Chernova, L., Shcherbakova, E., & Chizhevskaya, E. Nitrogen use by plants and nitrogen flows after application of standard and biomodified nitrogen fertilizers on barley // Biological Communications. 2021. V. 66. Iss. 4. P. 283–289. https://doi.org/10.21638/spbu03.2021.401
44. Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Kozlova A.P., Grudinin M.P., Roumiantseva M.L. CRISPR/Cas in genomes of Sinorhizobium meliloti // 20th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2020. 2020. V. 20. Iss. 6.1. P. 215-222. https://doi.org/10.5593/sgem2020/6.1/s25.028
45. Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Grudinin M.P., Roumiantseva M.L. Comparative genomics of the sinorhizobial PhiLM21-like intact prophages on complete chromosomes // 20th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2020. 2020. V. 20. Iss. 6.1. P. 207-214. https://doi.org/10.5593/sgem2020/6.1/s25.027
46. Saksaganskaia A.S., Vladimirova M.E., Afonin A.M., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Cryptic plasmids essential for Sinorhizobium meliloti fitness // 20th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2020. 2020. V. 20. Iss. 6.1. P. 223-230. https://doi.org/10.5593/sgem2020/6.1/s25.029
47. Muntyan V.S., Antonova E.V., Muntyan A.N., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Phylogenetic analysis of vertically and horizontally acquired genes responsible for salt tolerance of nitrogen-fixing alpha-proteobacteria // 20th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2020. 2020. V. 20. Iss. 6.1. P. 287-294. https://doi.org/10.5593/sgem2020/6.1/s25.038
48. Vladimirova M.E., Afonin A.M., Muntyan V.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. "Evaluation of Sinorhizobium meliloti Genomic Islands Inserted into the tRNA-Thr," 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics (CSGB), Novosibirsk, Russia, 2020, pp. 118-121, https://doi.org/10.1109/CSGB51356.2020.9214720
49. Muntyan V.S., Kozlova A.P., Afonin A.M., Muntyan A.N., Dzyubenko E.A., Kabilov M.R., Antonova E.V., Roumiantseva M.L. "Comparative Genomic Analysis of Moderate Bacteriophages of Alfalfa Root Nodule Bacteria," 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics (CSGB), Novosibirsk, Russia, 2020, pp. 72-75, https://doi.org/10.1109/CSGB51356.2020.9214723
50. Tsyganov V.E., Tsyganova A.V., Gorshkov A.P., Seliverstova E.V., Kim V.E., Chizhevskaya E.P., Belimov A.A., Serova T.A., Ivanova K.A., Kulaeva O.A., Kusakin P.G., Kitaeva A.B., and Tikhonovich I.A. Efficacy of a Plant-Microbe System: Pisum sativum (L.) Cadmium-Tolerant Mutant and Rhizobium leguminosarum Strains, Expressing Pea Metallothionein Genes PsMT1 and PsMT2, for Cadmium Phytoremediation // Frontiers in Microbiology. 2020. V. 11. Article 15. https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.00015
51. Аксенова Т.С., Чирак Е.Р., Онищук О.П., Курчак О.Н., Афонин А.М., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Выявление анцестральных характеристик генома у Rhizobium leguminosarum bv. trifolii. Сельскохозяйственная биология. 2020. Т. 55. № 3. С. 489-498. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2020.3.489rus [Aksenova T.S., Chirak E.R., Onishchuk O.P., Kurchak O.N., Afonin A.M., Pinaev A.G., Andronov E.E., Provorov N.A. Identification of the ancestral characteristics in the genome of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii. Sel’skokhozyaistvennaya biologiya [Agricultural Biology]. 2020. V. 55. № 3, P. 489-498. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2020.3.489eng]
52. Muntyan V.S., Baturina O.A., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Laktionov Y.V., Saksaganskaya A.S., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. // Draft genome sequence of Sinorhizobium meliloti AK555 // Microbiol Resour Announc. 2019. V. 8. Iss. 2. e01567-18. https://doi.org/10.1128/MRA.01567-18
53. Baturina O.A., Muntyan V.S., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Simarov B.V., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. // Draft genome sequence of Sinorhizobium meliloti strain CXM1-105 // Microbiol Resour Announc. 2019. V. 8. Iss. 2. e01621-18. https://doi.org/10.1128/MRA.01621-18
54. Baturina O.A., Muntyan V.S., Cherkasova M.E., Saksaganskaya A.S., Dzuybenko N.I., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. // Draft genome sequence of Sinorhizobium meliloti strain AK170 // Microbiol Resour Announc. 2019. V. 8. Iss. 1. e01571-18. https://doi.org/10.1128/MRA.01571-18
55. Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Саксаганская А.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Sinorhizobium meliloti: хромосомные типы и геномные острова // Экологическая генетика. 2019. Т. 17. № 3. С. 23-38. https://doi.org/10.17816/ecogen17323-38 [Cherkasova M.E., Muntyan V.S., Saksaganskaia A.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. // Sinorhizobium meliloti: chromosomal types and genomic islands // Ecol. gen. 2019. V. 17. Iss. 3. P.23-38. https://doi.org/10.17816/ecogen17323-38]
56. Muntyan, V. S.; Olekhnovitch, R. O.; Wackerow-Kouzova, N. D.; Prokhorova, V. A.; Kozlova, A. P. Bacteriophages of Sinorhizobium meliloti native to alfalfa origin of diversity at the Caucasus // 19th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2019. V. 6.1. P. 567-574. https://doi.org/10.5593/sgem2019/6.1/S25.073
57. Румянцева М.Л. Клубеньковые бактерии: перспективы мониторинга симбиотических свойств и стрессоустойчивости с использованием генетических маркеров (обзор) // Сельскохозяйственная биология. 2019. Т. 54. №5. С. 847-862. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2019.5.847rus [Roumiantseva M.L. Root nodule bacteria: perspectives of monitoring symbiotic properties by applying genetic markers (review) // Sel’skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology], 2019, Vol. 54, № 5, p. 847-862. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2019.5.847eng]
58. Румянцева М.Л., Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Степанова Г.В., Саксаганская А.С., Кожемяков А.П., Орлова А.Г., Becker A., Симаров Б.В. Высокоэффективные штаммы клубеньковых бактерий люцерны (Medicago varia L.): молекулярно-генетическая характеристика и использование в сопряженной селекции // Сельскохозяйственная биология. – 2019. Т. 54. № 6. – С. 1306-1323. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2019.6.1306rus [Roumiantseva M.L., Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Stepanova G.V., Saksaganskaya A.S., Kozhemyakov A.P., Orlova A.G., Becker A., Simarov B.V. Highly effective root nodule inoculants of alfalfa (Medicago varia L.): molecular-genetic analysis and practical usage in cultivar creation // Sel'skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology], 2019, Vol. 54, № 6, p. 1306-1323. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2019.6.1306eng]
59. Карасев Е.С., Андронов Е.Е., Аксенова Т.С., Чижевская Е.П., Тупикин А.Е., Проворов Н.А. Эволюции ризобий козлятника (Neorhizobium galegae): анализ полиморфизма генов фиксации азота и развития клубеньков // Генетика. 2019. Т. 55. № 2. С. 234-238. https://doi.org/10.1134/S0016675819020085 [Karasev E.S., Andronov E.E., Aksenova T.S., Chizhevskaya E.P., Provorov N.A., Tupikin A.E. Evolution of goat’s rue rhizobia (Neorhizobium galegae): analysis of polymorphism of the nitrogen fixation and nodule formation genes // Russian Journal of Genetics. 2019. V. 55. № 2. P. 263-266. https://doi.org/10.1134/S1022795419020078].

 

ГЛАВЫ В МОНОГРАФИЯХ

1. Roumiantseva, M. L., Vladimirova, M. E., Saksaganskaia, A. S., Muntyan, V. S., Kozlova, A. P., Afonin, A. M., Baturina, O. A., & Simarov, B. V. (2024). Detailed Genome Screening of a Highly Efficient Diploid Alfalfa Symbiont Ensifer meliloti L6-AK89. Research Advances and Challenges in Agricultural Sciences Vol. 6, 49–104. https://doi.org/10.9734/bpi/racas/v6/3170G
2. Muntyan, V. S., & Roumiantseva, M. L. (2024). Phylogenetic Analysis of Genes Responsible for the Primary and Secondary Response of Sinorhizobium meliloti Towards Salinity Stress. Research Advances and Challenges in Agricultural Sciences Vol. 6, 18–48. https://doi.org/10.9734/bpi/racas/v6/3162G

 

УЧАСТИЕ В НАУЧНЫХ МЕРОПРИЯТИЯХ В 2019–2024

 

IV Конгресс молодых ученых, 27-29 ноября 2024 г., Федеральная территория «Сириус»:

• Козлова А.П., Румянцева М.Л. Устное сообщение по разрабатываемой тематике в рамках проекта НЦМУ «Агротехнологии будущего»

 

Международная конференция "Бактериофаги: от фундаментальных исследований к применению", 21-23 сентября 2024 г., г. Новосибирск:

• Козлова А.П., Горбунова М.К., Саксаганская А.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Почвенные бактериофаги клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti

 

IV Международная научная конференция «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» PLAMIC2024, 15-22 сентября 2024, г. Байкальск:

• Чижевская Е.П., Чеботарь В.К., Худяева М.В., Кичко А.А., Лапенко Н.Г., Костицын Р.Д., Хонина О.В., Тихонович И.А. Специфичность эндофитных микробиомов засухоустойчивых растений полупустынной степи Ставропольского края
• Худяева М.В., Чеботарь В.К., Баганова М.Е., Келейникова О.В., Ерофеева А.В., Юзихин О.С., Чижевская Е.П., Костицын Р.Д., Хонина О.В., Лапенко Н.Г., Тихонович И.А. Сельскохозяйственный потенциал эндофитных бактерий засухоустойчивых растений
• Чеботарь В.К., Худяева М.В., Пищик В.Н., Чижевская Е.П., Баганова М.Е., Келейникова О.В., Фесенко И.А., Мамаева А.С., Тихонович И.А. Микробиомы засухоустойчивых растений для создания полифункциональных комплексных микробиологических препаратов для растениеводства

 

III Международная конференция «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (3rd International conference «Preservation and enhancement of genetic resources of microorganisms»), приуроченная к 300-летию Санкт-Петербургского государственного университета, 08-10 июля 2024 г., г. Санкт-Петербург:

• Баганова М.Е., Чеботарь В.К., Заплаткин А.Н., Ганчева М.С., Пищик В.Н., Келейникова О.В., Чижевская Е.П. Биологически активные минеральные удобрения, содержащие полезные штаммы эндофитных бактерий для повышения коэффициента их использования
• Худяева М.В., Чеботарь В.К., Баганова М.Е., Келейникова О.В., Ерофеева А.В., Юзихин О.С., Чижевская Е.П., Тихонович И.А. Эндофитные бактерии засухоустойчивых растений для контроля биотических и абиотических стрессов
• Келейникова О.В., Чеботарь В.К., Баганова М.Е., Заплаткин А.Н., Пищик В.Н., Чижевская Е.П. Микробиологический препарат на основе эндофита Bacillus amyloliquifaciens V417 для защиты сельскохозяйственных культур от болезней

 

VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы, 14-19 июня 2024 г., г. Саратов:

• Румянцева М.Л., Владимирова М.Е., Мунтян В.С. Молекулярно‑генетические, экологические и эволюционные аспекты формирования акцессорной части пангенома клубеньковых бактерий
• Апрелкова А.П., Мунтян В.С., Владимирова М.Е., Мунтян А.Н., Румянцева М.Л. Антифаговые системы защиты клубеньковых бактерий Sinorhizobium spp.
• Горбунова М.К., Козлова А.П., Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Разнообразие и биологические свойства ризобиофагов
• Андронов Е.Е., Иголкина А.А., Зверев А.О., Чижевская Е.П., Проворов Н.А. Согласование разнообразий в растительно‑микробных системах
• Худяева М.В., Чеботарь В.К., Чижевская Е.П., Келейникова О.В., Баганова М.Е., Ерофеева А.В., Костицын Р.Д., Хонина О.В., Лапенко Н.Г., Тихонович И.А. Эндофитные бактерий засухоустойчивых растений — антагонисты фитопатогенных грибов и бактерий

 

48th FEBS Congress, 29 June – 3 July 2024, Milano, Italy:

• Roumiantseva M., Saksaganskaia A., Kozlova A., Vladimirova M., Gorbunova M., Aprelkova A., Muntyan A., Muntyan V., Simarov B. Phage-related sequences and antiphage defense systems in Sinorhizobium meliloti

 

Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием "Биотех-2024", 16-19 апреля 2024 г., г. Санкт-Петербург:

• Горбунова М.К., Козлова А.П., Румянцева М.Л. Биологические свойства ризобиофага из почв Северо-Западного региона РФ
• Апрелкова А.П., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Антифаговые системы защиты клубеньковых бактерий Sinorhizobium spp.
•  

V Всероссийский конгресс по защите растений, 16-19 апреля 2024 г., г. Санкт-Петербург:

• Пищик В.Н., Темнова О.В., Чижевская Е.П., Ерофеева А.В., Кудрявцев Д.В., Борцова О.А., Тырышкин Л.Г., Чикида Н.Н., Чеботарь В.К. Эпифитные бактерии зерновок эгилопсов - потенциал для биологической защиты зерновых культур от корневых гнилей и листовых болезней

 

IV Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «РАЗВИТИЕ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ, БИОТЕХНОЛОГИИ И БИОИНФОРМАТИКИ НА СОВРЕМЕННОМ ЭТАПЕ», 25-27 октября 2023 г., г. Иркутск:

• Горбунова М.К., Козлова А.П., Румянцева М.Л. Трансдуктанты джамбо-фага S. meliloti

 

III Всероссийская научно-практическая конференция для студентов, аспирантов и молодых ученых «Политех наукам о жизни», 24-27 октября 2023 г., г. Санкт-Петербург:

• Горбунова М.К., Козлова А.П., Румянцева М.Л. Ризобиофаги клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti Северо-Западного региона РФ
• Апрелкова А.П., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Спектр видоспецифичных антивирусных систем в геномах высокоэффективных штаммов Sinorhizobium meliloti

 

Всероссийская научная Школа-конференция молодых ученых и студентов «Генетические технологии в исследованиях природных соединений», 3–7 октября 2023 г., г. Владивосток:

• Чеботарь В.К., Чижевская Е.П., Ганчева М.С. Поиск агрономически ценных штаммов эндофитных бактерий на основании анализа их геномов

 

4-ый Российский Микробиологический Конгресс, 24–29 сентября 2023 г., г. Томск:

• Козлова А.П., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Биологические и геномные характеристики джамбо фага Sinorhizobium meliloti

 

X Съезд Общества физиологов растений России (ОФР) «Биология растений в эпоху глобальных изменений климата», 18-23 сентября 2023 г., г. Уфа:

• Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Анализ региона симбиотических генов на pSymA Sinorhizobium meliloti – симбионтов хозяйственно-ценных бобовых культур

 

II Всероссийская школа-конференция «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов», 26-27 июня 2023 г., г. Санкт-Петербург:

• Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Анализ сайт-специфической интеграции фаговой ДНК, на примере штаммов Sinorhizobium meliloti, из центра итрагрессивной гибридизации люцерны
• Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Генетический анализ штаммов Sinorhizobium meliloti, контрастно различавшихся по солеустойчивости
• Пернак Е.В., Козлова А.П., Саксаганская А.С., Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Анализ CRISPR-Cas систем у природных изолятов Sinorhizobium meliloti, выделенных в среднеазиатском генцентре культурных растений
• Чеботарь В.К., Чижевская Е.П., Келейникова О.В., Баганова М.Е., Заплаткин А.Н., Костицын Р.Д., Хонина О.В., Лапенко Н.Г. Эндофиты галофитных растений как кандидаты для создания антистрессовых микробиологических препаратов

 

Всероссийская конференция «Генетические ресурсы растений для генетических технологий», 26–27 июня 2023 г., г. Санкт-Петербург:

• Чикида Н.Н., Шеленга Т.В., Белоусова М.Х., Филиппова П.С., Чижевская Е.П., Чеботарь В.К., Пищик В.Н. Использование метаболомного профиля устойчивых и неустойчивых к листовым болезням образцов вида Aegilops tauschii Coss. как модель для понимания механизмов ингибирования патогенеза у генотипов D-генома

 

XI Международная научно-практическая конференция «Защита растений от вредных организмов», 19-23 июня 2023 г., г. Краснодар:

• Чеботарь В.К., Чижевская Е.П., Келейникова О.В., Баганова М.Е., Заплаткин А.Н., Ерофеева А.В., Костицын Р.Д., Хонина О.В., Лапенко Н.Г. Эндофитные бактерии галофитных растений как перспективный ресурс для создания полифункциональных микробиологических препаратов для растениеводства на засушливых и засоленных почвах

 

III международная конференция «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» (PLAMIC2022), 3-8 октября 2022 г., г. Санкт-Петербург:

• Vladimirova M.E., Roumiantseva M.L. Site specific integration of phage-related sequences in Sinorhizobium meliloti chromosome
• Козлова А.П., Мунтян В.С., Владимирова М.Е., Румянцева М.Л. Анализ почвенных бактериофагов Sinorhizobium meliloti [Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Rumyantseva M.L. Analysis of soil bacteriophages Sinorhizobium meliloti]
• Мунтян В.С., Мунтян А.Н., Румянцева М.Л. Молекулярно-филогенетический анализ генов первичной реакции клубеньковых бактерий вида Sinorhizobium meliloti на солевой стресс [Muntyan V.S., Muntyan A.N., Rumyantseva M.L. Molecular phylogenetic analysis of genes of Sinorhizobium meliloti responsible for primary salt stress adaptation]
• Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Внутривидовое разнообразие и филогения гена nodA клубеньковых бактерий люцерны из первичного генцентра бобовых растений [Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Roumiantseva M.L. Intraspecific diversity and phylogeny of the nodA gene of alfalfa nodule bacteria from the legume plants primary gene center]
• Чеботарь В.К., Ганчева М.С., Чижевская Е.П., Пищик В.Н., Заплаткин А.Н., Келейникова О.В., Баганова М.Е. Эндофитные бактерии – перспективный ресурс для создания новых микробиологических препаратов для защиты и питания растений [Chebotar V.K., Gancheva M.S., Chizhevskaya E.P., Pischik V.N., Zaplatkin A.N., Keleynikova O.V., Baganova M.E. Endophytic bacteria are a promising resource for the development of new microbiological preparations for the protection and nutrition of plants]

 

VI Всероссийская школа-конференция с международным участием для молодых ученых «Молекулярно-генетические и клеточные аспекты растительно-микробных взаимодействий», 5 октября 2022 г., г. Санкт-Петербург:

• Козлова А.П., Мунтян В.С., Владимирова М.Е., Румянцева М.Л. Анализ почвенных бактериофагов Sinorhizobium meliloti [Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Rumyantseva M.L. Analysis of soil bacteriophages Sinorhizobium meliloti]

 

IUMS Congress (IUMS2022, онлайн), 20-22 July 2022: 

• Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Saksaganskaya A.S., Roumiantseva M.L. Phages of root nodule bacteria native to Primary Gene Center of Cultivated Plants at the Caucus

 

The Biochemistry Global Summit (25th IUBMB Congress, the 46th FEBS Congress and the 15th PABMB Congress), 9-14 July 2022, Lisbon, Portugal:

• Kozlova A., Vladimirova M., Muntyan V., Pernak E., Roumiantseva M. Sequences related to Rhizobium phage 16-3 in genomes of geographically distant Sinorhizobium meliloti strains, root nodule symbionts of alfalfa

 

13th International Multiconference on “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology” – BGRS/SB-2022, 04–08 of July 2022, Novosibirsk, Russia (13-я Международная мультиконференция «Биоинформатика Геномной Регуляции и Структурной/Системной Биологии» – BGRS/SB-2022, 4-8 июля 2022 г., г. Новосибирске, Россия):

• Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Roumiantseva M.L. Search and analysis of prophages related to phage AP-16-3 in genomes of Sinorhizobium spp.

 

Первая Всероссийская школа-конференция «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов», 22-23 июня 2022 г., г. Санкт-Петербург:

• Козлова А.П., Мунтян В.С., Владимирова М.Е., Румянцева М.Л. Бактериофаги клубеньковых бактерий из Переднеазиатского генцентра культурных растений
• Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Мунтян А.Н., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Встречаемость последовательностей фагового происхождения на несимбиотических плазмидах Sinorhizobium meliloti
• Ганчева М.С., Чижевская Е.П., Пищик В.Н., Келейникова О.В., Баганова М.Е., Заплаткин А.Н., Чеботарь В.К. Сборка генома эндофитной бактерии Bacillus vallismortis штамма BL01

 

III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", 19-24 июня 2022 г., г. Новосибирск:

• Козлова А.П., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Джамбо-фаг Sinorhizobium meliloti

 

V Всероссийская школа-конференция с международным участием для молодых ученых «Молекулярно-генетические и клеточные аспекты растительно-микробных взаимодействий», 6-8 октября 2021 г., г. Санкт-Петербург:

• Владимирова М.Е., Румянцева М.Л. Анализ локализации области терминации репликации у Sinorhizobium meliloti
• Саксаганская А.С., Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Симбиотрофные показатели растительно-микробных систем на основе хозяйственно-ценных видов люцерн и штаммов Sinorhizobium meliloti, содержавших разные аллели генов вирулентности
• Козлова А.П., Мунтян В.С., Владимирова М.Е. Поиск и анализ последовательностей, сходных с Rhizobium phage 16-3 в геномах Sinorhizobium meliloti

 

The 14th European Nitrogen Fixation Conference (ENFC 2021), 22nd September – 22nd October 2021, Aarhus University, Denmark:

• Muntyan V., Roumiantseva M. Molecular phylogenetic approach to analyze evolutionary pathways of salt tolerance-related genes in root-nodulated Sinorhizobium meliloti
• Vladimirova M., Roumiantseva M. Phage related sequences a site specifically integrated into isoacceptor tRNA genes of Sinorhizobium meliloti

 

45th FEBS Congress (virtual), 3-8 July 2021, Ljubljana, Slovenia:

• Vladimirova M., Muntyan V., Afonin A., Saksaganskaya A., Antonova E., Simarov B., Roumiantseva M. Prophages and phage related sequences in chromosomes of Sinorhizobium meliloti isolates native to Aral Sea region
• Saksaganskaia A., Muntyan V., Muntyan A., Afonin A., Simarov B., Roumiantseva M. Are cryptic plasmids of Sinorhizobium meliloti attractive within phage infection?
• Kozlova A., Muntyan V., Muntyan A., Afonin A., Dzyubenko E., Roumiantseva M. Recombinant form of Sinorhizobium phage AP16 isolated from mountain region of Caucasus
• Bakaev M., Vladimirova M., Kozlova A., Muntyan V., Afonin A., Grudinin M., Roumiantseva M. Abundant of CRISPR/Cas elements in genomes of nitrogen-fixing bacteria from the genus Sinorhizobium

 

VII Молодёжная школа-конференция по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН, 12-15 октября 2020 г., г. Санкт-Петербург:

• Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Геномные острова Sinorhizobium meliloti, встроенные в тРНК-Thr(ggt) [Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Roumiantseva M.L. Genomic islands of Sinorhizobium meliloti site-specifically integrated into the tRNA-Thr(ggt)]
• Козлова А.П., Мунтян В.С., Дзюбенко Е.А., Афонин А.М., Румянцева М.Л. Новая рекомбинантная форма ризофага 16-3 из почв Кавказа [Kozlova A.P., Muntyan V.S., Dzyubenko E.A., Afonin A.M., Roumiantseva M.L. New recombinant form of rhizophage 16-3 from soil of Caucasus]
• Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Криптические плазмиды Sinorhizobium meliloti — природные рекомбинантные репликоны [Saksaganskaya A.S., Muntyan V.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Cryptic plasmids of Sinorhizobium meliloti are natural recombinant replicons]

 

II Международная научная конференция «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» (PLAMIC2020), 5-9 октября 2020 г., г. Саратов:

• Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Саксаганская А.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Филогения геномных островов у близкородственных видов рода Sinorhizobium sp. [Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Saksaganskaya A.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Phylogenetic analysis of genomic islands in closely-related species belonging to Sinorhizobium sp.]
• Мунтян В.С., Мунтян А.Н., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Филогенетический анализ вертикально и горизонтально наследуемых генов, ответственных за солеустойчивость азотфиксирующих альфа-протеобактерий [Muntyan V.S., Muntyan A.N., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Phylogenetic analysis of vertically and horizontally acquired genes responsible for salt tolerance in nitrogen-fixing alphaproteobacteria]
• Карасев Е.С., Андронов Е.Е., Чижевская Е.П., Проворов Н.А. Сравнительный анализ нуклеотидного полиморфизма хромосомных и симбиотических генов у симбионтов козлятника восточного и лекарственного из популяции Северного Кавказа [Karasev E.P., Andronov E.E., Chizevskaya E.P., Provorov N.A. Comparative analysis of nucleotide polymorphism of chromosomal and symbiotic genes in symbionts of eastern and medical goat’s rue from a population of the North Caucasus]

 

BGRS/SB-2020: 12th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology”, 06-10 July 2020, Novosibirsk, Russia / 12 международная мультиконференция "Биоинформатика регуляции и структуры генома/Системная биология", 6-10 июля 2020 г., г. Новосибирск:

• Vladimirova M.E., Afonin A.M., Muntyan V.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Evaluation of Sinorhizobium meliloti genomic islands inserted into the tRNA – Thr
• Muntyan V.S., Muntyan A.N., Antonova E.V., Kozlova A.P., Dzyubenko E.A., Roumiantseva M.L., Afonin A.M., Kabilov M.R. Comparative genomic analysis of moderate bacteriophages of alfalfa root nodule bacteria
• Kozlova A.P., Muntyan V.S., Afonin A.M., Antonova E.V., Muntyan A.N., Kabilov M.R., Dzyubenko E.A., Roumiantseva M.L. Comparative genomic analysis of moderate bacteriophages of alfalfa root nodule bacteria
• Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Afonin A.M., Roumiantseva M.L. Cryptic plasmids of alfalfa root nodule bacteria – structural and functional diversity

 

VI Всероссийский молодежный научный форум "OPENSCIENCE 2019", 13-15 ноября 2019 г., г. Гатчина:

• Козлова А.П., Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Афонин А.М., Румянцева М.Л. Ризобиофаг бактерий Sinorhizobium meliloti, выделенный в переднеазиатском центре разнообразия люцерны

 

21st International Congress on Nitrogen Fixation, Oct. 10-15, 2019, Wuhan, China:

• Roumiantseva M.L., Cherkasova M.E., Muntyan V.S. Phage related sequences abounded in sinorhizobia chromosomes and their evolutionary role
• Muntyan V.S., Muntyan A.N., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Phylogenetic analysis of vertically and horizontally acquired genes responsible for salt tolerance of nitrogen-fixing alpha-proteobacteria

 

VIII научно-практическая конференция с международным участием «Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции», 26–29 сентября 2019 г., г. Ростов-на-Дону:

• Черкасова М.Е., Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. hsd-гены как маркеры-поиска хозяйственно-ценных штаммов Sinorhizobium meliloti
• Саксаганская А.С., Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Румянцева М.Л. Молекулярно-генетические подходы анализа высокоэффективных штаммов Sinorhizobium meliloti

 

2-ой Российский Микробиологический Конгресс, 23-27 сентября 2019 г., г. Саранск:

• Козлова А.П., Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Афонин А.М., Румянцева М.Л. Бактериофаги Sinorhizobium meliloti, выделенные в центре разнообразия люцерн

 

VII международная научно-практическая конференция «Биотехнология: наука и практика», 16–20 Сентября 2019 г., г. Севастополь:

• Черкасова М.Е., Мунтян В.С, Саксаганская А.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Геномные острова симбиотических азотфиксирующий бактерий рода Sinorhizobium
• Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Лактионов Ю.В., Румянцева М.Л., Симаров Б.В. Нуклеотидный анализ генов синтеза Nod-фактора штамма Sinorhizobium meliloti АК555 – высокоэффективного симбионта люцерны

 

44th FEBS Congress, 6-11 July 2019, Krakow, Poland:

• Roumiantseva M., Cherkasova M., Muntyan V. Accessory elements of rhizobia chromosome: site-specific integration, structural and functional diversity
• Muntyan V., Afonin A., Cherkasova M., Muntyan A., Saksaganskaya A., Roumiantseva M. The genome architecture of the strain Ensifer meliloti AK89, a highly effective symbiont of Medicago lupulina
• Cherkasova M., Muntyan V., Saksaganskaia A., Simarov B., Roumiantseva M. S. medicae genomes screened for genomic islands
• Saksaganskaia A., Kozlova A., Muntyan V., Cherkasova M., Roumiantseva M. Genome structure of highly effective strain Sinorhizobium meliloti AK555

 

VIII Конгресс молодых ученых / Биотехнологии и низкотемпературные системы / Биотехнологии и живые системы:

• Прохорова В.А., Козлова А.П., Пастухова Н.Д. Выделение ризобиофагов и определение их литической активности

 

Международный конгресс «VII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы», 18-22 июня 2019 г., г. Санкт-Петербург:

• Румянцева М.Л., Черкасова М.Е., Мунтян В.С. Геномные острова бактерий: функциональная значимость и структурный полиморфизм
• Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Румянцева М.Л., Симаров Б.В. Геном модельного штамма Sinorhizobium meliloti СХМ1-105
• Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Лактионов Ю.В., Румянцева М.Л., Симаров Б.В. Геном высокоэффективного штамма Sinorhizobium meliloti АК555
• Чижевская Е.П., Онищук О.П., Курчак О.Н., Андронов Е.Е., Симаров Б.В. Анализ гена биосинтеза меланина у природных штаммов клубеньковых бактерий люцерны различного географического происхождения
• Курчак О.Н., Онищук О.П., Чижевская Е.П., Симаров Б.В. Выявление генов, вовлеченных в контроль симбиотической эффективности штаммов Sinorhizobium meliloti

 

III Школа-конференции молодых ученых «Молекулярно-генетические и клеточные аспекты растительно-микробных взаимодействий», 17 июня 2019 г., Санкт-Петербург:

• Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Румянцева М.Л., Симаров Б.В. Геном модельного штамма Sinorhizobium meliloti СХМ1-105
• Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Лактионов Ю.В., Румянцева М.Л., Симаров Б.В. Геном высокоэффективного штамма Sinorhizobium meliloti АК555

Документы

• Федоров С.Н., Симаров Б.В. Получение мутантов клубеньковых бактерий Rhizobium meliloti с измененными симбиотическими свойствами при воздействии ультрафиолетовых лучей Смотреть Скачать (5.693 Мб)
• Федоров С.Н. Получение мутантов клубеньковых бактерий люцерны с измененными симбиотическими свойствами под действием УФ-излучения Смотреть Скачать (10.72 Мб)

Смотреть все