![]() |
Коллектив Лаборатории протеомики надорганизменных систем занимается изучением молекулярных механизмов, обуславливающих патогенные и функциональные свойства различных бактерий; идентификацией новых прионных и амилоидных белков прокариот и эукариот; выявлением белковых сетей и регуляторных каскадов, контролирующих видоспецифичность симбиотических отношений; разработкой полифункциональных микробиологических препаратов, ведет фундаментальные и прикладные исследования по ряду других междисциплинарных тем. Так, в последние годы в Лаборатории впервые в мировой практике идентифицированы амилоидные белки у растений [Antonets et al., PLOS Biology, 2020] и симбиотических бактерий [Kosolapova et al., Biomolecules, 2020], разработана эффективная и точная программа для предсказания в бактериальных геномах генов, кодирующих токсины Cry, имеющие важное значение для биотехнологии [Shikov et al., Toxins, 2020]. В работах Лаборатории используется широкий спектр разнообразных подходов, включающий в себя геномику, транскриптомику, протеомику и биоинформатику; генетику микроорганизмов и микробиологию; ряд молекулярно-биологических методов, в том числе, генную инженерию, количественный анализ экспрессии генов, различные методы работы с белками, а также микроскопию (конфокальную, поляризационную, электронную). Лаборатория имеет богатую историю; она была основана в 1891 г. как «Бактериологическая лаборатория при департаменте земледелия и Государственных имуществ»; у истоков ее создания и развития стояли академик АН СССР Б.Л. Исаченко, профессора А.Е. Феоктистов, С.С. Мережковский. Основные исследования, проводимые в лаборатории, были направлены на выявление и характеристику родентицидных и бактерицидных микроорганизмов. С 1897 г. и по настоящее время в лаборатории непрерывно поддерживается культура Salmonella enteritidis var. Issatschenko, называемая также «бактерией Исаченко», которая обладает строго избирательным патогенным эффектом в пределах отряда грызунов. В 1969-2011 гг. лабораторию возглавлял профессор Н.В. Кандыбин, под руководством которого были созданы и внедрены в производство биологические препараты на основе инсектицидной бактерии Bacillus thuringiensis. Основными направлениями работы Коллектива лаборатории являются:
Некоторые из недавних результатов: (A-C) Металлопротеазный домен белка YghJ бактерии Escherichia coli, играющего важную роль в инфекционных заболеваниях, вызываемых энтеротоксигенными штаммами этой бактерии, образует амилоиды, то есть белковые фибриллы с упорядоченной структурой. С результатами работы можно ознакомиться в публикации Belousov et al., PLOS One, 2018. (D) Запасные белки семян растений, являющиеся одним из основных компонентом рациона питания человека, обладают потенциально амилоидогенными свойствами. С результатами работы можно ознакомиться в публикации Antonets and Nizhnikov, IJMS, 2017. Работа выполнена при поддержке гранта Российского научного фонда №17-16-01100. (E-F) Аспарагин-глутамин обогащенный фрагмент белка Gln3 дрожжей Saccharomyces cerevisiaeвзаимодействует с другими аспарагин-глутамин-обогащенными амилоидами. С результатами работы можно ознакомиться в публикации Antonets and co-authors, Biochemistry (Moscow), 2016. |
Антонец Кирилл Сергеевич, к.б.н., ведущий научный сотрудник
Белоусов Михаил Владимирович, к.б.н., старший научный сотрудник
Гришечкина Светлана Денисовна, к.б.н., ведущий научный сотрудник
Косолапова Анастасия Олеговна, младший научный сотрудник, аспирант СПбГУ
Маловичко Юрий Викторович, младший научный сотрудник, аспирант СПбГУ
Шиков Антон Евгеньевич, младший научный сотрудник, аспирант СПбГУ
Бологова Елена Викторовна, инженер микробиолог 1 категории
Минина Галина Николаевна, инженер-микробиолог 1 категории
Федорова Татьяна Николаевна, инженер 1 категории
Меркушова Анастасия Витальевна, техник 1 категории
Фаюд Хайдар, аспирант СПбГУ
Смирнов Кирилл Вадимович, студент СПбГУ
Романенко Мария Николаевна, студентка СПбГУ