![]() |
Коллектив Лаборатории протеомики надорганизменных систем занимается изучением молекулярных механизмов, обуславливающих патогенные и функциональные свойства различных бактерий; идентификацией новых прионных и амилоидных белков прокариот и эукариот; выявлением белковых сетей и регуляторных каскадов, контролирующих видоспецифичность симбиотических отношений; разработкой полифункциональных микробиологических препаратов, ведет фундаментальные и прикладные исследования по ряду других междисциплинарных тем. Так, в последние годы в Лаборатории впервые в мировой практике идентифицированы амилоидные белки у растений [Antonets et al., PLOS Biology, 2020] и симбиотических бактерий [Kosolapova et al., Biomolecules, 2020], разработана эффективная и точная программа для предсказания в бактериальных геномах генов, кодирующих токсины Cry, имеющие важное значение для биотехнологии [Shikov et al., Toxins, 2020]. В работах Лаборатории используется широкий спектр разнообразных подходов, включающий в себя геномику, транскриптомику, протеомику и биоинформатику; генетику микроорганизмов и микробиологию; ряд молекулярно-биологических методов, в том числе, генную инженерию, количественный анализ экспрессии генов, различные методы работы с белками, а также микроскопию (конфокальную, поляризационную, электронную). Лаборатория имеет богатую историю; она была основана в 1891 г. как «Бактериологическая лаборатория при департаменте земледелия и Государственных имуществ»; у истоков ее создания и развития стояли академик АН СССР Б.Л. Исаченко, профессора А.Е. Феоктистов, С.С. Мережковский. Основные исследования, проводимые в лаборатории, были направлены на выявление и характеристику родентицидных и бактерицидных микроорганизмов. С 1897 г. и по настоящее время в лаборатории непрерывно поддерживается культура Salmonella enteritidis var. Issatschenko, называемая также «бактерией Исаченко», которая обладает строго избирательным патогенным эффектом в пределах отряда грызунов. В 1969-2011 гг. лабораторию возглавлял профессор Н.В. Кандыбин, под руководством которого были созданы и внедрены в производство биологические препараты на основе инсектицидной бактерии Bacillus thuringiensis. Основными направлениями работы Коллектива лаборатории являются:
Некоторые из недавних результатов: (A-C) Металлопротеазный домен белка YghJ бактерии Escherichia coli, играющего важную роль в инфекционных заболеваниях, вызываемых энтеротоксигенными штаммами этой бактерии, образует амилоиды, то есть белковые фибриллы с упорядоченной структурой. С результатами работы можно ознакомиться в публикации Belousov et al., PLOS One, 2018. (D) Запасные белки семян растений, являющиеся одним из основных компонентом рациона питания человека, обладают потенциально амилоидогенными свойствами. С результатами работы можно ознакомиться в публикации Antonets and Nizhnikov, IJMS, 2017. Работа выполнена при поддержке гранта Российского научного фонда №17-16-01100. (E-F) Аспарагин-глутамин обогащенный фрагмент белка Gln3 дрожжей Saccharomyces cerevisiaeвзаимодействует с другими аспарагин-глутамин-обогащенными амилоидами. С результатами работы можно ознакомиться в публикации Antonets and co-authors, Biochemistry (Moscow), 2016. |
Доктор биологических наук, профессор РАН, заведующий лабораторией №7 профессор СПбГУ