Масштабное исследование phiLM21-подобных профагов клубеньковых бактерий.

Сотрудники лаборатории генетики и селекции микроорганизмов ФГБНУ ВНИИСХМ под руководством Румянцевой М.Л. опубликовали в высокорейтинговом журнале International Journal of Molecular Sciences результаты масштабного исследования phiLM21-подобных профагов клубеньковых бактерий. Изучение профагов, сайт-специфически интегрированных в гены тРНК, показало, что до 65% их метавирома кодирует гипотетические белки — «генетическую тёмную материю». Анализ открытых рамок считывания (ОРС) разного происхождения, а также распределение ОРС с предсказанными и с неизвестными функциями, наглядно представлен в статье. Расшифровка этой сложной генетической информации имеет фундаментальное значение для понимания эволюции бактериально-фаговых взаимодействий и открывает новые перспективы для использования фагов в биоинженерии.

Исследование выполнено при поддержке Минобрнауки России в рамках соглашения № 075-15-2025-472 от «29» мая 2025 г о предоставлении гранта в форме субсидии из федерального бюджета на реализацию проекта: «Расширение фонда и развитие геномных исследований в коллекции микроорганизмов Сетевая биоресурсная коллекция в области генетических технологий для сельского хозяйства (ВКСМ)».

Vladimirova ME, Roumiantseva ML, Saksaganskaia AS, Kozlova AP, Muntyan VS, Gaponov SP. Dark Matter Carried by Sinorhizobium meliloti phiLM21-like Prophages. Int J Mol Sci. 2025 Sep 6;26(17):8704. https://doi.org/10.3390/ijms26178704. PMID: 40943619; PMCID: PMC12429752.