Таксономическое и функциональное профилирование многокомпонентного биопрепарата БАГС.

Мобилизация целлюлозолитической микробиоты из природных ресурсов является перспективным методом создания биоудобрений, поскольку позволяет отбирать бактерии с широким спектром метаболических функций. БАГС — пример такого сложного микробного консорциума со специфической микробиотой, первоначально выделенной из почвы, но впоследствии кардинально от нее дивергировавший. Совмещение традиционных микробиологических методов и современных технологий секвенирования, на примере определения целлюлозолитической активности и сетевого анализа, позволило определить фазу мацерации БАГС, сформировавшуюся после четвёртого месяца компостирования. Активное микробное сообщества БАГС, согласно анализу MAG, включало как потенциально чисто целлюлозолитические микроорганизмы (например, Steroidobacteraceae, Tepidisphaeraceae с высоким содержанием PUL или Polyangiaceae с высоким содержанием генов семейства AA), так и сопутствующую микробиоту, связанную с обменом азота и серы. Кроме того, с активной фазой были связаны микроорганизмы, не имеющие отношения ни к одной из этих функций (например, потенциальная целлюлозолитическая Chryseolinea и её предполагаемый симбионтом Gracilibacteria с неизвестной функцией). На примере БАГС мы продемонстрировали, что в сложных биоудобрениях микроорганизмы, связанные с разложением целлюлозы, могут выполнять различные функции, роль которых еще предстоит определить.

Данное исследование было поддержано РНФ 23-16-00147.

Cеквенирование ампликонных библиотек гена 16S рРНК на платформе Illumina Miseq и полных метагеномов на платформе Oxford Nanopore MinION были выполнены на базе ЦКП «Геномные технологии, протеомика и клеточная биология» ФГБНУ ВНИИСХМ.

Gladkov, G.V.; Kimeklis, A.K.; Orlova, O.V.; Lisina, T.O.; Aksenova, T.S.; Kichko, A.A.; Pinaev, A.G.; Andronov, E.E. Taxonomic and Metagenomic Survey of a Peat-Based Straw Degrading Biofertilizer. Microorganisms 2025, 13, 2830. https://doi.org/10.3390/microorganisms13122830