• Сотрудники
• Лаборатория №6
• Владимирова (Черкасова) Мария Евгеньевна

Владимирова (Черкасова) Мария Евгеньевна

• « Вернуться к списку

• 

  Инженер-исследователь

  •   Лаборатория генетики и селекции микроорганизмов №6

  Информация

    WoS ResearcherID: C-9626-2017

    Scopus AuthorID: 57216992194

    ORCID: 0000-0003-1873-9674

    SPIN-код: 5341-5736

    AuthorID: 820960

   

  Образование

  2008-2012

  Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ), Санкт-Петербург, Россия

  Биолого-почвенный факультет, каф. биохимии

  Бакалавр биологии

   

  2012-2014

  Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ), Санкт-Петербург, Россия

  Биологический факультет, каф. биохимии

  Магистр биологии

   

  2014-2018

  Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии" (ФГБНУ ВНИИСХМ), Санкт-Петербург, Пушкин, Россия

  Аспирантура (на базе лаб. генетики и селекции микроорганизмов)

  Диплом об окончании аспирантуры №107824 3914917, Специальность 06.06.01 Биологические науки, квалификация «Исследователь. Преподаватель-исследователь»

   

  Опыт работы

  с января 2012 г. по настоящее время – лаб. генетики и селекции микроорганизмов, ФГБНУ ВНИИСХМ

   

  Повышение квалификации

  2023 г. – курс «Биоинформатический анализ геномных данных» (СПбГУ)

   

  Участие в научных проектах

  • Тема № FGEW-2024-0007 Госзадания (2024-2026 гг.)
  • НЦМУ «Агротехнологии будущего» (2020-2024 гг.);
  • РНФ 20-16-00105 Системы иммунитета азотфиксирующих клубеньковых бактерий: оценка их разнообразия и перспектив применения в агробиотехнологии (2020-2022 гг.; исполнитель);
  • РНФ 17-16-01095 (Анализ закономерности геномных перестроек у вирулентных и невирулентных клубеньковых бактерий и оценка рисков их влияния на хозяйственно-ценные свойства и стрессоустойчивость растительно-микробных систем (2017-2019 гг.; исполнитель));
  • РФФИ 18-04-01278а (Геномные острова как природный потенциальный банк генов, обуславливающий генотипическое разнообразие бактерий: на примере азотфиксирующих симбиотических видов клубеньковых бактерий (2018-2020 гг.; исполнитель));
  • РФФИ 17-04-02011а (Анализ функционально различных групп генов клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti и растений-хозяев, перспективных для формирования высокопродуктивных симбиотических азотфиксирующих систем широкого адаптивного потенциала (2017-2019 гг.; исполнитель));
  • РФФИ 15-04-09295а (Мозаичность хромосомных островов клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti как индикатор генетического мониторинга хозяйственно-ценных азотфиксирующих симбионтов люцерны в агроценозах, усложненных неблагоприятными почвенно-климатическими и техногенными факторами (2015-2017 гг.; исполнитель));
  • РФФИ 14-04-01441а (Молекулярно-генетический и функциональный анализ Tn5-маркированных генов клубеньковых бактерий Sinorhizobium meliloti, ответственных за формирование высокоэффективных симбиотических систем с хозяйственно-ценными видами люцерны в различных эколого-климатических условиях (2014-2016 гг.; исполнитель)).

   

  Образовательная деятельность:

  Руководитель выпускной квалификационной работы бакалавра каф. Молекулярной биотехнологии, факультета Химической и биотехнологии СПбГТИ(ТУ) Доросевича П.А.

   

  Избранные публикации:

  • Vladimirova, M.E.; Roumiantseva, M.L.; Saksaganskaia, A.S.; Muntyan, V.S.; Gaponov, S.P.; Mengoni, A. Hot Spots of Site-Specific Integration into the Sinorhizobium meliloti Chromosome. Int. J. Mol. Sci. 2024, 25, 10421. https://doi.org/10.3390/ijms251910421
  • Kozlova, A.P.; Muntyan, V.S.; Vladimirova, M.E.; Saksaganskaia, A.S.; Kabilov, M.R.; Gorbunova, M.K.; Gorshkov, A.N.; Grudinin, M.P.; Simarov, B.V.; Roumiantseva, M.L. Soil Giant Phage: Genome and Biological Characteristics of Sinorhizobium Jumbo Phage. Int. J. Mol. Sci. 2024, 25, 7388. https://doi.org/10.3390/ijms25137388
  • Kozlova, A.P.; Saksaganskaia, A.S.; Afonin, A.M.; Muntyan, V.S.; Vladimirova, M.E.; Dzyubenko, E.A.; Roumiantseva, M.L. A Temperate Sinorhizobium Phage, AP-16-3, Closely Related to Phage 16-3: Mosaic Genome and Prophage Analysis. Viruses 2023, 15, 1701. https://doi.org/10.3390/v15081701
  • Vladimirova M.E., Pernak E.V., Muntyan V.S., Saksaganskaia A.S., Kozlova A.P., Afonin A.M., Yurkov A.P., Zhukov V.A., Roumiantseva M.L. Chloroplast Genome of Medicago lupulina L. var. vulgaris Koch: Structure, Sequences Introduced as a Result of HGT and Viral Nature // Russian Journal of Plant Physiology. 2023. V. 70. Iss. 8. Article 193. https://doi.org/10.1134/S1021443723602331
  • Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Afonin A.M., Muntyan A.N., Roumiantseva M.L. Analysis of salt-sensitive and salt-tolerant Sinorhizobium meliloti strains using DNA microarray, phenotype microarray and genome mining techniques // Proceedings of 23rd International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2023. 2023. V. 23. Iss. 6.1. P. 129-136. https://doi.org/10.5593/sgem2023/6.1/s25.15
  • Pernak E.V., Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Afonin A.M., Roumiantseva M.L. Analysis of CRISPR cassette elements in native isolates of Sinorhizobium meliloti isolated in the Central Asian origin of plant diversity // Proceedings of 23rd International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2023. 2023. V. 23. Iss. 6.1. P. 113-120. https://doi.org/10.5593/sgem2023/6.1/s25.13
  • Roumiantseva M.L., Vladimirova M.E., Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Kozlova A.P., Afonin A.M., Baturina O.A., Simarov B.V. Ensifer meliloti L6-AK89, an Effective Inoculant of Medicago lupulina Varieties: Phenotypic and Deep-Genome Screening // Agronomy. 2022. V. 12. Iss. 4. 766. https://doi.org/10.3390/agronomy12040766
  • Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Afonin A.M., Muntyan A.N., Baturina O.A., Dzuybenko E.A., Saksaganskaya A.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L., Kabilov M.R. Complete Genome of Sinorhizobium meliloti AK76, a Symbiont of Wild Diploid Medicago lupulina from the Mugodgary Mountain Region // Microbiol Resour Announc. 2022. V. 11. Iss. 3. e0108821. https://doi.org/10.1128/mra.01088-21
  • Muntyan V.S., Saksaganskaia A.S., Muntyan A.N., Vladimirova M.E., Roumiantseva M.L. Stress and immunity of nodule bacteria Sinorhizobium meliloti: localization, polymorphism and phylogeny of genetic determinants // 22nd International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2022. 2022. V. 22. Iss. 6.1. P. 121-128. https://doi.org/10.5593/sgem2022/6.1/s25.15
  • Saksaganskaia A.S., Vladimirova M.E.,Muntyan V.S., Roumiantseva M.L. Sinorhizobium meliloti harboured distinct alleles of nod genes showed different symbiotic activity on Medicago lupulina and Medicago varia // 21th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2021. 2021. V. 21. Iss. 6.1. P. 257-262. https://doi.org/10.5593/sgem2021/6.1/s25.33
  • Muntyan V.S., Afonin A.M., Vladimirova M.E., Saksaganskaya A.S., Gribchenko E.S., Baturina O., Roumiantseva M.L. Complete genome sequence of Sinorhizobium meliloti S35m, a salt-tolerant isolate from alfalfa rhizosphere in soil native to the Caucasus region // Microbiol Resour Announc. 2021. V. 10. Iss. 11. e01417-20. https://doi.org/10.1128/MRA.01417-20
  • Vladimirova M., Muntyan V., Afonin A., Saksaganskaya A., Antonova E., Simarov B., Roumiantseva M. Prophages and phage related sequences in chromosomes of Sinorhizobium meliloti isolates native to Aral Sea region // FEBS Open Bio 11 (Suppl. 1) (2021) P. 108-109. https://doi.org/10.1002/2211-5463.13205
  • Vladimirova M., Roumiantseva M. Phage related sequences a site specifically integrated into isoacceptor tRNA genes of Sinorhizobium meliloti // ENFC 2021 (Abstract Booklet) Aarhus University, September–October 2021, P. 151.
  • Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Kozlova A.P., Grudinin M.P., Roumiantseva M.L. CRISPR/Cas in genomes of Sinorhizobium meliloti // 20th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2020. 2020. V. 20. Iss. 6.1. P. 215-222. https://doi.org/10.5593/sgem2020/6.1/s25.028
  • Kozlova A.P., Muntyan V.S., Vladimirova M.E., Grudinin M.P., Roumiantseva M.L. Comparative genomics of the sinorhizobial PhiLM21-like intact prophages on complete chromosomes // 20th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2020. 2020. V. 20. Iss. 6.1. P. 207-214. https://doi.org/10.5593/sgem2020/6.1/s25.027
  • Saksaganskaia A.S., Vladimirova M.E., Afonin A.M., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Cryptic plasmids essential for Sinorhizobium meliloti fitness // 20th International Multidisciplinary Scientific GeoConference SGEM 2020. 2020. V. 20. Iss. 6.1. P. 223-230. https://doi.org/10.5593/sgem2020/6.1/s25.029
  • Черкасова М.Е., Мунтян В.С., Саксаганская А.С., Симаров Б.В., Румянцева М.Л. Sinorhizobium meliloti: хромосомные типы и геномные острова // Экологическая генетика. 2019. Т. 17. № 3. С. 23-38. https://doi.org/10.17816/ecogen17323-38 [Cherkasova M.E., Muntyan V.S., Saksaganskaia A.S., Simarov B.V., Roumiantseva M.L. Sinorhizobium meliloti: chromosomal types and genomic islands // Ecological Genetics. 2019. Vol 17, No 3. P. 23-38 https://doi.org/10.17816/ecogen17323-38]
  • Румянцева М.Л., Владимирова М.Е., Мунтян В.С., Степанова Г.В., Саксаганская А.С., Кожемяков А.П., Орлова А.Г., Becker A., Симаров Б.В. Высокоэффективные штаммы клубеньковых бактерий люцерны (Medicago varia L.): молекулярно-генетическая характеристика и использование в сопряженной селекции // Сельскохозяйственная биология. – 2019. Т. 54. № 6. – С. 1306-1323. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2019.6.1306rus [Roumiantseva M.L., Vladimirova M.E., Muntyan V.S., Stepanova G.V., Saksaganskaya A.S., Kozhemyakov A.P., Orlova A.G., Becker A., Simarov B.V. Highly effective root nodule inoculants of alfalfa (Medicago varia L.): molecular-genetic analysis and practical usage in cultivar creation // Sel'skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology], 2019, Vol. 54, № 6, p. 1306-1323. https://doi.org/10.15389/agrobiology.2019.6.1306eng]
  • Baturina O.A., Muntyan V.S., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Simarov B.V., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. // Draft genome sequence of Sinorhizobium meliloti strain CXM1-105 // Microbiol Resour Announc. 2019. V. 8. Iss. 2. e01621-18. https://doi.org/10.1128/MRA.01621-18
  • Muntyan V.S., Baturina O.A., Afonin A.M., Cherkasova M.E., Laktionov Y.V., Saksaganskaya A.S., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. // Draft genome sequence of Sinorhizobium meliloti AK555 // Microbiol Resour Announc. 2019. V. 8. Iss. 2. e01567-18. https://doi.org/10.1128/MRA.01567-18
  • Baturina O.A., Muntyan V.S., Cherkasova M.E., Saksaganskaya A.S., Dzuybenko N.I., Kabilov M.R., Roumiantseva M.L. // Draft genome sequence of Sinorhizobium meliloti strain AK170 // Microbiol Resour Announc. 2019. V. 8. Iss. 1. e01571-18. https://doi.org/10.1128/MRA.01571-18
  • Румянцева М.Л., Мунтян В.С., Черкасова М.Е., Саксаганская А.С., Андронов Е.Е., Симаров Б.В. Геномные острова штамма Sinorhizobium meliloti Rm1021 – азотфиксирующего симбионта люцерны // Генетика. 2018. Т. 54. № 7. С. 745-756. https://doi.org/10.1134/S0016675818070135 [Roumiantseva M.L., Muntyan V.S., Cherkasova M.E., Saksaganskaya A.S., Andronov E.E., Simarov B.V. Genomic islands in Sinorhizobium meliloti Rm1021, nitrogen-fixing symbiont of alfalfa // Russian Journal of Genetics. 2018. V. 54. Iss. 7. P. 759-769. https://doi.org/10.1134/S102279541807013X]
  • Румянцева М.Л., Саксаганская А.С., Мунтян В.С., Черкасова М.Е., Симаров Б.В. Структурный полиморфизм генов вирулентности и солеустойчивости Sinorhizobium meliloti // Генетика. 2018. Т. 54. № 5. С. 524-534. https://doi.org/10.7868/S001667581805003X [Roumiantseva M.L., Saksaganskaia A.S., Muntyan V.S., Cherkasova M.E., Simarov B.V. Structural polymorphism of Sinorhizobium meliloti genes related to virulence and salt tolerance // Russian Journal of Genetics. 2018. V. 54. Iss. 5. P. 525-535. https://doi.org/10.1134/S1022795418050083]