ГЛАВНАЯ
ИНСТИТУТ
АДМИНИСТРАЦИЯ
УЧЕНЫЙ СОВЕТ
ПОДРАЗДЕЛЕНИЯ
ЛАБОРАТОРИЯ №1
ЛАБОРАТОРИЯ №2
ЛАБОРАТОРИЯ №3
ЛАБОРАТОРИЯ №4
ЛАБОРАТОРИЯ №5
ЛАБОРАТОРИЯ №6
ЛАБОРАТОРИЯ №7
ЛАБОРАТОРИЯ №8
ЛАБОРАТОРИЯ №9
ЛАБОРАТОРИЯ №10
Научно-образовательная группа
НОВОСТИ
ВАКАНСИИ
ИСТОРИЯ
ИЗВЕСТНЫЕ МИКРОБИОЛОГИ
ОТЧЕТНОСТЬ
ДОКУМЕНТЫ
СОТРУДНИКИ
ПАРТНЕРЫ
ФОТОГАЛЕРЕЯ
ВИДЕОМАТЕРИАЛЫ
ДЛЯ ПРЕССЫ
НАУКА
ФЦП
НАУЧНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
НАУКА И УНИВЕРСИТЕТЫ
НЦМУ "Агротехнологии будущего"
ОБРАЗОВАНИЕ
НОЦ
ОБРАЗОВАТЕЛЬНАЯ ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ
КОЛЛЕКЦИИ
Коллекция культур сельскохозяйственных микроорганизмов (ВКСМ)
ЦКП
ПРОТИВОДЕЙСТВИЕ КОРРУПЦИИ
Документы
Сведения
КОНТАКТЫ

Лаборатория микробиологического мониторинга и биоремедиации почв №2

Лаборатория микробиологического мониторинга и биоремедиации почв №2

Заведующий лабораторией : Андронов Евгений Евгеньевич

Телефон: +7 (812) 466 59 79

Лаборатория  является преемником лаборатории почвенной микробиологии, которая была создана  в том же году, что и ВНИИСХМ (1930 г). Инициатором создания и первым ее руководителем являлся директор института академик С. П. Костычев, положивший начало исследованиям по так называемой «биодинамике почв». Проведенные в лаборатории изучения микробиологических процессов  почв Советского Союза  впоследствии были обобщены и продолжены учеником Костычева Н.М. Лазаревым  и выразились в создании модели функционирования биоорганоминерального комплекса почв. С 1967 года  внимание лаборатории было сосредоточено на изучении  взаимодействия  почвенных микроорганизмов и пестицидов. Под руководством зав. лабораторией Круглова Ю.В. были проведены обширные исследования влияния пестицидов на  разнообразие  почвенных микроорганизмов, биохимические процессы  круговорота углерода и азота в почве, а также на симбиоз бобовых растений и клубеньковых бактерий. Разработаны микробиологические методы индикации пестицидов  и биоремедиации загрязненных пестицидами почв. Наряду с этим, в 90-е годы 20-го столетия в лаборатории начались систематические исследования по изучению разнообразия  микрофлоры почв и влияния на  микробиом различных агротехнических мероприятий. В последние годы  в лаборатории  отрабатываются и усовершенствуются  методические приемы молекулярно-генетического анализа  метагенома почвенного микробиома, используемые для изучения таксономического разнообразия микрофлоры почв и влияния антропогенных и природных факторов на ассоциации почвенных микроорганизмов. Основным подходом является комплекс современных методов работы с почвенными ДНК и РНК, включая высокопроизводительное секвенирование, ПЦР с детекцией в реальном времени и анализ данных с использованием современныхметодов биоинформатики. В 2015 году группа молодых ученых лаборатории (Е. Першина. и Е. Иванова) совместно с коллегами из Почвенного института им. В.В. Докучаева были удостоены премии правительства России за работы в области исследования почвенного микробиома.

Сотрудники

Гранты

  1. НЦМУ "Агротехнологии Будущего", темы "Создание инструментов цифрового картирования почв посредством сравнительного исследования их микробиомного разнообразия и динамики, а также выявления метагеномных маркеров ключевых факторов плодородия", "Исследование метагеномов природных целлюлозолитических ассоциаций и создание на их основе технологий и высокоэффективных микробиологических препаратов для переработки пожнивных остатков сельскохозяйственных культур."
  2. Проект РНФ № 19-16-00081, 2019-2023. Популяционная геномика клубеньковых бактерий – ключ к расшифровке механизмов ко-эволюции прокариот и эукариот, рук. Проворов Н.А.
  3. Проект РНФ № 23-16-00147, 2023-2025. Метагеномные технологии в разработке и использовании ассоциативных микробных препаратов для разложения растительных остатков, рук. Андронов Е.Е.

Публикации

  1. Zverev A.O., Gladkov, G.V., Kimeklis A.K., Kichko A.A., Andronov E.E., Abakumov E.V. Microbial Composition on Abandoned and Reclaimed Mining Sites in the Komi Republic (North Russia) // Microorganisms. 2023. Vol. 11. No 3. P. 720 DOI 10.3390/microorganisms11030720
  2. Kimeklis A.K., Gladkov G.V., Orlova O.V., Afonin A.M., Gribchenko E.S., Aksenova T.S., Kichko A.A., Pinaev A.G., Andronov E.E. The Succession of the Cellulolytic Microbial Community from the Soil during Oat Straw Decomposition // Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 6342. DOI 10.3390/ijms24076342
  3. Zverev A.O., Kurchak O.N., Orlova O.V. Onishchuk O.P., Kichko A.A., Eregin A.V., Naliukhin A.N, Pinaev A.G., Andronov E.E. Dynamic of the Soil Microbiota in Short-Term Crop Rotation // Life. 2023. 13. 400. DOI 10.3390/life13020400
  4. Gladkov G.V., Kimeklis A.K., Afonin A.M., Lisina T.O., Orlova O.V., Aksenova T.S., Kichko A.A., Pinaev A.G., Andronov E.E. The Structure of Stable Cellulolytic Consortia Isolated from Natural Lignocellulosic Substrates // International Journal of Molecular Sciences. 2022. Vol. 23. No 18. P. 10779. DOI 10.3390/ijms231810779
  5. Zverev A.O., Kimeklis A.K, Kichko A.A., Gladkov G.V., Andronov E.E., Abakumov E.V. Microbial Features of Mature and Abandoned Soils in Refractory Clay Deposits // BMC Microbiology. 2022. Vol. 22. No 1. P. 237. DOI 10.1186/s12866-022-02634-7
  6. Ivanova E., Vasilyeva N., Vladimirov A., Ksenofontova N., Abakumov E., Zverev A., Andronov E., Kostenko I. The shifts in the structure of the prokaryotic community of mountain-grassland soil under the influence of artificial larch plantations // PLoS ONE. 2022. Vol. 17. No 2. P. 0263135. DOI 10.1371/journal.pone.0263135
  7. Kimeklis A.K., Gladkov G.V., Tembotov R.H., Kichko A.A., Pinaev A.G., Hosid S.L., Andronov E.E., Abakumov E.V. // One Ecosystem. 2022. Vol. 7. P. 83756. DOI 10.3897/oneeco.7.e83756
  8. Kichko A.A., Gladkov G.V., Ulianich P.S., Safronova V.I., Pinaev A.G., Sekste E.A., Belimov A.A., Andronov E.E. Water Deficit, Cadmium and Plant Genotype Modulate Rhizosphere Microbiome of Pisum sativum L // Plants. 2022. Vol. 11. No 22. P. 3013. DOI 10.3390/plants11223013
  9. Korvigo I.A., Igolkina A.A., Kichko A.A., Aksenova T.S., Andronov E.E. Be aware of the allele-specific bias and compositional effects in multi-template PCR // PeerJ. 2022. Vol. 10. P. 13888. DOI 10.7717/peerj.13888
  10. Provorov N.A., Andronov E.E., Kimeklis A.K., Onishchuk O.P., Igolkina A.A., Karasev E.S. Microevolution, speciation and macroevolution in rhizobia: Genomic mechanisms and selective patterns // Frontiers in Plant Science. 2022. Vol. 13. P. 1026943. DOI 10.3389/fpls.2022.1026943
  11. Abakumov E.V., Zverev A.O., Kichko A.A., Kimeklis A.K., Andronov E.E. Soil microbiome of different-aged stages of self-restoration of ecosystems on the mining heaps of limestone quarry (Elizavetino, Leningrad region). Open Agriculture. Vol. 6. No. 1. 2021. P. 57-66.DOI 10.1515/opag-2020-0207
  12. Zverev AO, Kichko AA, Pinaev AG, Provorov NA, Andronov EE. Diversity Indices of Plant Communities and Their Rhizosphere Microbiomes: An Attempt to Find the Connection // Microorganisms. 2021. Vol. 9. No 11. DOI 10.3390/microorganisms9112339
  13. Kimeklis A.K, Gladkov G.V., Zverev A.O., Kichko A.A., Andronov E.E., Ergina E.I., Kostenko I.V., Abakumov E.V. Microbiomes of different ages in Rendzic Leptosols in the Crimean Peninsula. PeerJ 9:e10871 DOI 10.7717/peerj.10871
  14. Provorov, N. Genetic individuality and interspecies altruism: modelling symbiogenesis using different types of symbiotic bacteria // Biological Communications. 2021. Vol. 66. No 1. P. 66-72. DOI 10.21638/spbu03.2021.108
  15. Young JPW, Moeskjær S, Afonin A, Rahi P, Maluk M, James EK, Cavassim MIA, Rashid MH-o, Aserse AA, Perry BJ, Wang ET, Velázquez E, Andronov EE, Tampakaki A, Flores Félix JD, Rivas González R, Youseif SH, Lepetit M, Boivin S, Jorrin B, Kenicer GJ, Peix Á, Hynes MF, Ramírez-Bahena MH, Gulati A, Tian C-F. Defining the Rhizobium leguminosarum Species Complex // Genes. 2021. Vol. 12. No 1. P. 1-26. DOI 10.3390/genes12010111

Подписаться на рассылку ВНИИСХМ

Что будем искать?