• Сотрудники
• Лаборатория №2
• Кимеклис Анастасия Кирилловна

Кимеклис Анастасия Кирилловна

• « Вернуться к списку

• 

  Младший научный сотрудник

  •   Лаборатория микробиологического мониторинга и биоремедиации почв №2

  Информация

  СПЕЦИАЛЬНОСТЬ: биоинформатика

    Scopus ID: 55516167800

    WoS ResearcherID: ABA-8233-2020

    AuthorID (РИНЦ): 702592

    ID ORCID: 0000-0003-0348-7021

    SPIN-код: 9410-7854

   

  Образование

  СПбГУ, Биолого-почвенный факультет, 2007-2011, Бакалавр

  СПбГУ, Биолого-почвенный факультет, каф. микробиологии, 2011-2013, Магистр биологии

  ФГБНУ ВНИИСХМ, 2013-2017, Аспирантура

   

  Опыт работы

  03.2010-10.2013, Техник 1 кат., ФГБНУ ВНИИСХМ

  10.2013-03.2021, Инженер-микробиолог, ФГБНУ ВНИИСХМ

  04.2021-н/вр, Младший научный сотрудник, ФГБНУ ВНИИСХМ

  04.2012-12.2014, Лаборант-исследователь, СПбГУ, каф. генетики

  04.2017-12.2021, Инженер-исследователь, СПбГУ, каф. прикладной экологии

  05.2022-н/вр, Научный сотрудник, СПбГУ, каф. прикладной экологии

   

  Область научных интересов

  Микробиология, бобово-ризобиальный симбиоз, почвенная метагеномика, разложение растительных остатков, ампликонное секвенирование

   

  Опыт руководства научными проектами и участия в них за последние 5 лет

  НЦМУ «Агротехнгологии будущего» 2020-2023, исполнитель

  РНФ № 23-16-00147 Метагеномные технологии в разработке и использовании ассоциативных микробных препаратов для разложения растительных остатков, 2023, основной исполнитель

  РНФ 23-16-20003 Экологическое и биологическое состояние залежных почв СевероЗапада России: анализ потенциала "скрытой" продовольственной корзины и продовольственных экосистемных услуг, 2023, исполнитель

  РНФ № 17-16-01030 Динамика почвенной биоты в хроносериях посттехногенных ландшафтов: анализ почвенно-экологической эффективности процессов восстановления экосистем, 2017-2021, исполнитель

  РНФ № 19-16-00081 Популяционная геномика клубеньковых бактерий – ключ к расшифровке механизмов ко-эволюции прокариот и эукариот, 2019-2022, исполнитель

  РФФИ № 18-316-00124 Роль гена nodX в реликтовой симбиотической системе "Vavilovia formosa - Rhizobium leguminosarum", 2018-2019, руководитель

  РФФИ № 19-416-890002 Микробиом залежных почв агроэкосистем Ямало-Ненецкого автономного округа: разнообразие, свойства, таксономия и динамика, 2019, исполнитель

  РФФИ № 19-54-18003 Оценка регионального вклада почв антарктических островов в глобальный баланс углерода с учетом степени стабилизации и гумификации органического вещества, 2019, исполнитель

   

   

  ENG

  Education

  SPbSU, 2007-2011 Bachelor

  SPbSU 2011-2013, department of Microbiology, Master of Biology

  ARRIAM 2013-2017 phD

   

  Affiliations

  Laboratory of microbiological monitoring and bioremediation of soils, ARRIAM

  Department of Applied Ecology, SPbSU

   

  Research interests

  Microbiology, soil metagenomics, rhizobia-legume symbiosis, amplicon sequencing, cellulose degradation.

   

   

   

  Статьи

  1. Kimeklis, A.K.; Gladkov, G.V.; Orlova, O.V.; Afonin, A.M.; Gribchenko, E.S.; Aksenova, T.S.; Kichko, A.A.; Pinaev, A.G.; Andronov, E.E. The Succession of the Cellulolytic Microbial Community from the Soil during Oat Straw Decomposition. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 6342. https://doi.org/10.3390/ijms24076342
  2. Zverev, A.O.; Gladkov, G.V.; Kimeklis, A.K.; Kichko, A.A.; Andronov, E.E.; Abakumov, E.V. Microbial Composition on Abandoned and Reclaimed Mining Sites in the Komi Republic (North Russia). Microorganisms 2023, 11, 720. https://doi.org/10.3390/microorganisms11030720
  3. Provorov NA, Andronov EE, Kimeklis AK, Onishchuk OP, Igolkina AA and Karasev ES (2022) Microevolution, speciation and macroevolution in rhizobia: Genomic mechanisms and selective patterns. Front. Plant Sci. 13:1026943. doi: 10.3389/fpls.2022.1026943 Q1
  4. Zverev, A., Kimeklis, A., Kichko, A., Gladkov G, Andronov E, Abakumov E. Microbial features of mature and abandoned soils in refractory clay deposits. BMC Microbiol 22, 237 (2022). https://doi.org/10.1186/s12866-022-02634-7
  5. Gladkov, G.V.; Kimeklis, A.K.; Afonin, A.M.; Lisina, T.O.; Orlova, O.V.; Aksenova, T.S.; Kichko, A.A.; Pinaev, A.G.; Andronov, E.E. The Structure of Stable Cellulolytic Consortia Isolated from Natural Lignocellulosic Substrates. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 10779. https://doi.org/10.3390/ijms231810779
  6. Kimeklis AK, Gladkov GV, Tembotov RH, Kichko AA, Pinaev AG, Hosid SL, Andronov EE, Abakumov EV (2022) Microbiome composition of disturbed soils from sandy-gravel mining complexes with different reclamation approaches. One Ecosystem 7: e83756. https://doi.org/10.3897/oneeco.7.e83756
  7. Gladkov G., Lisina T., Kimeklis A., Kichko A., Afonin A., Andronov E. Metagenomes of the microbial cellulolytic communities on various substrates. In Lapidus, A.; Korobeynikov, A., eds. Selected abstracts of Bioinformatics: from Algorithms to Applications 2021 Conference. BMC Bioinform. 2021, 22. DOI : 10.1186/s12859-021-04475-z
  8. Kimeklis A.K, Gladkov G.V., Zverev A.O., Kichko A.A., Andronov E.E., Ergina E.I., Kostenko I.V., Abakumov E.V. Microbiomes of different ages in Rendzic Leptosols in the Crimean Peninsula. PeerJ 9:e10871 doi:10.7717/peerj.10871
  9. Abakumov E, Zverev A, Kichko A, Kimeklis A and Andronov E. Soil microbiome of different-aged stages of self-restoration of ecosystems on the mining heaps of limestone quarry (Elizavetino, Leningrad region). Open Agriculture, vol. 6, no. 1, 2021, pp. 57-66. https://doi.org/10.1515/opag-2020-0207
  10. Evdokimova E., Gladkov G., Kuzina N., Ivanova E., Kimeklis A., Zverev A., Kichko A., Aksenova T., Pinaev A., Andronov E. The difference between cellulolytic ‘culturomes’ and microbiomes inhabiting two contrasting soil types // PLoS ONE. 2020. V. 15. N. pp. e0242060. doi.org/10.1371/journal.pone.0242060
  11. Ivanova E.A., Pershina E.V., Shapkin V.M., Kichko A.A., Aksenova T.S., Kimeklis A.K., Gladkov G.V., Zverev A.O., Vasilyeva N.A., Andronov E.E., Abakumov E.V. Shifting prokaryotic communities along a soil formation chronosequence and across soil horizons in a South Taiga ecosystem // Pedobiologia. 2020. V. 81-82. pp. 150650. doi: 10.1016/j.pedobi.2020.150650
  12. Pershina E., Ivanova E., Kimeklis A., Zverev A., Kichko A., Aksenova T., Andronov E., Abakumov E. Soil microbiomes of reclaimed and abandoned mines of the Yamal region // Polish Polar Research, 2020. V. 41. N. 1. pp. 95-114. doi: 10.24425/ppr.2020.132571
  13. Zverev A., Petrov A., Kimeklis A., Kichko A., Andronov E., Petrov A., Abakumov, E. Microbiomes of the initial soils of mining areas of Yakutsk city (Eastern Siberia, Russia)// Czech Polar Reports. 2020. V. 10 N. 1. pp. 69-82. doi: 10.5817/CPR2020-1-7
  14. Гладков Г.В., Чебыкина Е.Ю., Евдокимова Е.В., Иванова Е.А., Кимеклис А.К., Зверев А.О., Кичко А.А., Андронов Е.Е., Абакумов Е.В. Восстановление почвенного микробиома в различных почвенных горизонтах после верхового и низового лесных пожаров // Экологическая генетика. 2020. Т. 18. № 3. С. 343-356. doi: 10.17816/ecogen17641
  15. Аксенова Т.С., Кимеклис А.К.  Анализ аллельного разнообразия гена nodX у бактерий вида Rhizobium leguminosarum, симбионтов бобовых Trifolium и Vavilovia // Евразийский союз ученых. 2020. Т. 73. № 4-2. С. 18-21.
  16. Проворов Н.А., Андронов Е.Е., Кимеклис А.К., Чирак Е.Р., Карасев Е.С., Аксенова Т.С., Копать В.В.Эволюционная география клубеньковых бактерий: видообразование, направляемое растениям-хозяевами // Микробиология. 2020. Т. 89. № 1. С. 3-16. doi: 10.31857/S0026365620010127 Q4 Provorov, N.A., Andronov, E.E., Kimeklis, A.K. et al. Evolutionary Geography of Root Nodule Bacteria: Speciation Directed by the Host Plants. Microbiology 89, 1–12 (2020). https://doi.org/10.1134/S0026261720010129
  17. Кимеклис А.К., Дмитракова Я.А., Першина Е.А., Иванова Е.А., Зверев А.О., Гладков Г.В., Кичко А.А., Андронов Е.Е., Абакумов Е.В. Анализ микробиомов рекультивированных почв кингисеппского месторождения фосфоритов. Сельскохозяйственная биология, 2020, том 55, № 1, с. 137-152. doi: 10.15389/agrobiology.2020.1.137rus
  18. Gladkov GV, Kimeklis AK, Zverev AO, Pershina EV, Ivanova EA, Kichko AA, Andronov EE, Abakumov EV. Soil microbiome of the postmining areas in polar ecosystems in surroundings of Nadym, Western Siberia, Russia. Open Agriculture. 2019. 4(1):684-696 DOI: 10.1515/opag-2019-0070
  19. Kimeklis, A.K.; Chirak, E.R.; Kuznetsova, I.G.; Sazanova, A.L.; Safronova, V.I.; Belimov, A.A.; Onishchuk, O.P.; Kurchak, O.N.; Aksenova, T.S.; Pinaev, A.G.; Andronov, E.E.; Provorov, N.A. Rhizobia Isolated from the Relict Legume Vavilovia formosa Represent a Genetically Specific Group within Rhizobium leguminosarum biovar viciae. Genes 2019, 10, 991. doi: 10.3390/genes10120991
  20. Chirak, E.R.; Kimeklis, A.K.; Karasev, E.S.; Kopat, V.V.; Safronova, V.I.; Belimov, A.A.; Aksenova, T.S.; Kabilov, M.R.; Provorov, N.A.; Andronov, E.E. Search for Ancestral Features in Genomes of Rhizobium leguminosarum bv. viciae Strains Isolated from the Relict Legume Vavilovia formosa. Genes 2019, 10, 990.
  21. Shatskaya, N. V., Bogdanova, V. S., Kosterin, O. E., Vasiliev, G. V., Kimeklis, A. K., Andronov, E. E., and Provorov, N. A. 2019. Plastid and mitochondrial genomes of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. and phylogeny of related legume genera. Vavilov Journal of Genetics and Breeding 23(8):972–980. https://doi.org/10.18699/VJ19.574
  22. Kimeklis A.K., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Safronova V.I., Belimov A.A., Onishchuk O.P., Kurchak O.N., Aksenova T.S., Pinaev A.G., Andronov E.E., Provorov N.A., Musaev A.M. Divergent Evolution of Symbiotic Bacteria: Rhizobia of the Relic Legume Vavilovia formosa Form an Isolated Group within Rhizobium leguminosarum bv. viciae. Russian Journal of Genetics. 2018. Т. 54. № 7. С. 866-870. [Кимеклис А.К., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Белимов А.А., Онищук О.П., Курчак О.Н., Аксёнова Т.С., Пинаев А.Г., Мусаев А.М., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Дивергентная эволюция симбиотических бактерий: ризобии реликтового бобового Vaviloviaformosa формируют обособленную группу в пределах вида Rhizobium leguminosarum bv. viciae. Генетика. 2018. Т. 54. № 7. С. 851-855.] doi:10.1134/S0016675818070068 IF 0,559
  23. Kopat V.V., Chirak E.R., Kimeklis A.K., Safronova V.I., Belimov A.A., Kabilov M.R., Andronov E.E., Provorov N.A. Evolution of fixNOQP genes encoding cytochrome oxidase with high affinity to oxygen in rhizobia and related bacteria. Russian Journal of Genetics. 2017. Т. 53. № 7. С. 766-774. [Копать В.В., Чирак Е.Р., Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Кабилов М.Р., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Эволюция генов fixNOQP, кодирующих цитохромоксидазу с высоким сродством к кислороду, у ризобий и родственных им бактерий. Генетика. 2017. Т. 53. № 7. С. 795-804.] doi: 10.7868/S0016675817070062 IF 0,559
  24. Chirak E.R., Kopat’ V.V., Kimeklis A.K., Safronova V.I., Belimov A.A., Chirak E.L., Andronov E.E., Provorov N.A., Tupikin A.E. Structural and functional organization of the plasmid regulons of Rhizobium leguminosarum symbiotic genes. // Microbiology (Mikrobiologiya). 2016. Т. 85. № 6. С. 708-716. [Чирак Е.Р., Копать В.В., Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Чирак Е.Л., Тупикин А.Е., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Структурно-функциональная организация плазмидных регионов симбиотических генов у Rhizobium leguminosarum. Микробиология. 2016. Т. 85. № 6. С. 693-702.] doi: 10.7868/S0026365616060070
  25. Kimeklis A.K., Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Belimov A.A., Pinaev A.G., Chizhevskaya E.P., Pukhaev A.R., Popov K.P., Andronov E.E., Provorov N.A. Phylogenetic analysis of rhizobium strains, isolated from nodules of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Sel’skokhozyaistvennaya biologiya, 2015, V. 50(5), pp. 655-664 [Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Белимов А.А., Пинаев А.Г., Чижевская Е.П., Пухаев А.Р., Попов К.П., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Филогенетический анализ штаммов рода Rhizobium, выделенных из клубеньков Vavilovia formosa (Stev.) Fed. Сельскохозяйственная биология, 2015, том 50, №5, стр 655-664.] doi: 10.15389/agrobiology.2015.5.655rus
  26. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Chizhevskaya E.P., Pukhaev A.R., Popov K.P., Willems A., Tikhonovich I.A. Bosea vaviloviae sp. nov., a new species of slow-growing rhizobia isolated from nodules of the relict species Vavilovia formosa (Stev.) Fed.// Antonie Van Leeuwenhoek, 2015 Apr; 107(4):911-20. doi: 10.1007/s10482-015-0383-9 http://link.springer.com/article/10.1007/s10482-015-0383-9
  27. Safronova V.I., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Akopian J.A., Willems A., Tikhonovich I.A. Extra-slow-growing Tardiphaga strains isolated from nodules of Vavilovia formosa (Stev.) Fed.// Arch. Microbiol, 2015 Sep;197(7):889-98. doi: 10.1007/s00203-015-1122-3 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26013968
  28. Andronov E.E., Igolkina A.A., Kimeklis A.K., Vorobyov N.I., Provorov N.A. Characteristics of natural selection in populations of nodule bacteria (Rhizobium leguminosarum) interacting with different host plants. Russian Journal of Genetics. 2015. Т. 51. № 10. С. 949-956. [Андронов Е.Е., Иголкина А.А., Кимеклис А.К., Воробьев Н.И., Проворов Н.А. Характеристика естественного отбора в популяциях клубеньковых бактерий (Rhizobium leguminosarum), взаимодействующих с различными видами растений-хозяев. Генетика. 2015. Т. 51. № 10. С. 1108.] doi: 10.1134/S1022795415100026
  29. Safronova V.I., Kimeklis A.K., Chizhevskaya E.P., Belimov A.A., Andronov E.E., Pinaev A.G., Pukhaev A.R., Popov K.P., Tikhonovich I.A. Genetic diversity of rhizobia isolated from nodules of the relic species Vavilovia formosa (Stev.) Fed.// Antonie van Leeuwenhoek, 2014, V.105, p.389–399. DOI 10.1007/s10482-013-0089-9 http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10482-013-0089-9
  30. Safronova V.I., Piluzza G., Zinovkina N.Y., Kimeklis A.K., Belimov A.A., Bullitta S. Relationships between pasture legumes, rhizobacteria an nodule bacteria in heavy metal polluted mine waste of SW Sardinia// Symbiosis, 2012, Volume 58, Issue 1-3, pp 149-159

   

  Тезисы

  31. Абакумов Е.В., Андронов Е.Е., Кимеклис А.К., Зверев А.О., Гладков Г.В. Микробиологические драйверы почвовообразования и проблемы онтогенеза почв. Сборник Тезисов Всероссийской Школы-Конференции «Сохранение И Преумножение Генетических Ресурсов Микроорганизмов», Санкт-Петербург, 2022, с. 19
  32. Кимеклис А.К., Гладков Г.В., Низамутдинов Т.И., Кичко А.А., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Абакумов Е.Е. Объединение подходов по секвенированию коротких и длинных фрагментов 16S рРНК для анализа микробиома заброшенных почв сельскохозяйственных криогенных экосистем ЯНАО. Сборник Тезисов Всероссийской Школы-Конференции «Сохранение И Преумножение Генетических Ресурсов Микроорганизмов», Санкт-Петербург, 2022, с. 55
  33. Гладков Г.В., Лисина Т.О.1, Кимеклиc А.К., Кичко А.А, Афонин А.М., Андронов Е.Е. Использование различных подходов высокопроизводительного секвенирования при анализе минимальных целлюлозолитических микробных сообществ. III Всероссийская конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике". Новосибирск, 2022, с. 62
  34. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Сазанова А.Л., Белимов А.А., Аксенова Т.С., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Дивергенция коровых и симбиотических компонентов генома Rhizobium leguminosarum: использование симбионтов реликтового бобового Vavilovia formosa для анализа микроэволюции и видообразования. Сборник тезисов, Третья Международная научная конференция PLAMIC2022 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего», c. 110.
  35. Gladkov, G., Kimeklis, A., Tembotov, R., Kichko, A., Andronov, E., and Abakumov, E.: Soil microbiome from postmining ecosystems from Kabardino-Balkaria, Russia, EGU General Assembly 2021, online, 19–30 Apr 2021, EGU21-2100, https://doi.org/10.5194/egusphere-egu21-2100, 2021.
  36. Gladkov G., Lisina T., Kimeklis A., Kichko A., Afonin A., Andronov E., Differences in the metagenome of microbial cellulolytic communities on various substrates, Biata 2021
  37. Ivanova E.A., Gladkov G.V., Kimeklis A.K., Kichko A.A., Karpova D.V., Andronov E.E., Abakumov E.V. The structure of the prokaryotic communities of the initial stages of soil formation in Antartic peninsula. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. Earth and Environmental Science. The VIII Congress of the Dokuchaev Soil Science Society. 2021. С. 012056.
  38. Ivanova, E., Gladkov, G., Kimeklis, A., Kichko, A., Andronov, E., Zverev, A., Tembotov, R., and Abakumov, E.: The structure and diversity of microbiomes of glacial cryoconites (North Caucasus Region), EGU General Assembly 2021, online, 19–30 Apr 2021, EGU21-8275, https://doi.org/10.5194/egusphere-egu21-8275, 2021.
  39. Kimeklis, A., Gladkov, G., Zverev, A., Kichko, A., Andronov, E., Ergina, E., Kostenko, I., and Abakumov, E.: Influence of soil factors on the microbiome of Rendzic Leptosols chronosequence in the Crimean Peninsula, EGU General Assembly 2021, online, 19–30 Apr 2021, EGU21-1767, https://doi.org/10.5194/egusphere-egu21-1767, 2021.
  40. Kichko A.A., Ivanova E.A., Chernov T.I., Kimeklis A.K., Karasev E.S., Orlova O.V., Kalmenov M.D., Provorov N.A., Andronov E.E., Sergaliev N.K. Microiome structure of the buried soil shifts to the structure of mineral horizons. Молекулярно-генетические и клеточные аспекты растительно-микробных взаимодействий. ПРОГРАММА и СБОРНИК ТЕЗИСОВ V Всероссийской школы-конференции с международным участием для молодых ученых. 2021. С. 72.
  41. Zverev, A., Kimeklis, A., Gladkov, G., Kichko, A., Andronov, E., and Abakumov, E.: Microbiological description of self-overgrowing spoil heaps and sand quarries in Nordwest Russia, EGU General Assembly 2021, online, 19–30 Apr 2021, EGU21-2086, https://doi.org/10.5194/egusphere-egu21-2086, 2021.
  42. Гладков Г.В., Кимеклис А.К., Зверев A.O., Кичко А.А., Андронов Е.Е., Абакумов Е.В. Микробиом гранитного отсева. V конференция молодых ученых «Почвоведение: Горизонты будущего» Почвенный институт им. В.В. Докучаева, Москва, 21-24 сентября 2021 года
  43. Кимеклис А.К., Гладков Г.В., Темботов Р.Х., Кичко А.А., Андронов Е.Е., Абакумов Е.В. Микробиомы восстанавливающихся почв глиняных карьеров. «Почвоведение. Горизонты будущего. 2021» Сборник тезисов докладов пятой конференции молодых ученых Почвенного института им. В.В. Докучаева, посвященной 175-летию со дня рождения В.В. Докучаева. Москва, 21-24 сентября 2021 г., - М.: Почвенный ин-т им. В.В. Докучаева, 2021, c. 24
  44. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Онищук О.П., Курчак О.Н., Аксенова Т.С., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Генетические особенности бактерий Rhizobium leguminosarum bv. viciae –симбионтов реликтового бобового Vavilovia fromosa. Молекулярно-генетические и клеточные аспекты растительно-микробных взаимодействий. ПРОГРАММА и СБОРНИК ТЕЗИСОВ V Всероссийской школы-конференции с международным участием для молодых ученых. 2021. С. 71.
  45. Кимеклис А.К., Аксёнова Т.С., Гладков Г.В., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Белимов А.А., Онищук О.П., Курчак О.Н., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Ризобиальные симбионты Vavilovia formosa принадлежат к виду Rhizobium leguminosarum bv. viciae, но образуют внутри него обособленную группу // Сборник Тезисов. Вторая Международная научная конференция PLAMIC2020 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего». 2020. С. 119
  46. Онищук О.П., Курчак О.Н., Андронов Е.Е., Кимеклис А.К., Аксенова Т.С., Дзюбенко Н.И., Дзюбенко Е.А., Проворов Н.А. Филогенетическое разнообразие быстрорастущих клубеньковых бактерий (Rhizobiaceae) Северо-Кавказского региона // Сборник Тезисов. Вторая Международная научная конференция PLAMIC2020 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего». 2020. С. 187
  47. Проворов Н.А., Кимеклис А.К., Чирак Е.Р., Онищук О.П., Курчак О.Н., Андронов Е.Е. Микросимбионты растений как модели эволюционной генетики // Сборник Тезисов. Вторая Международная научная конференция PLAMIC2020 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего». 2020. С. 200
  48. Kimeklis A., Gladkov G., Zverev A., Pershina E., Ivanova E., Kichko A., Andronov E., Abakumov E. Effect of mining on the initial soil microbiomes in polar ecosystems in surroundings of Nadym, Western Siberia, Russia. 4th Thünen Symposium on Soil Metagenomics. Abstracts. 2019, p. 31
  49. Kimeklis A., Pershina E., Ivanova E., Zverev A., Gladkov G., Kichko A., Dmitrakova Ya., Andronov E., Abakumov E. Microbiome Analysis of Kingisepp area recultivated soils after phosphorite mining. Geophysical Research Abstracts Vol. 21, EGU General Assembly 2019, EGU2019-49-1.
  50. Кимеклис А.К., Гладков Г.В., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Белимов А.А., Онищук О.П., Курчак О.Н., Аксёнова Т.С., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Особенности Симбиотической Активности И Фенотипических Признаков Ризобий Rhizobium Leguminosarum Bv. Viciae Реликтового Бобового Vavilovia Formosa. В книге: VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы. Сборник тезисов Международного Конгресса. 2019. С. 953.
  51. Kimeklis A.K., Kuznetsova I.G., Sazanova A.L., Safronova V.I., Belimov A.A., Onishchuk O.P., Kurchak O.N., Gladkov, G.V., Aksenova Т.S., Pinaev A.G., Andronov E.E., Provorov N.A. Genetic analysis of rhizobia from three populations of the relic legume Vavilovia formosa. International Scientific Conference PLAMIC2018 «Plants and microbes: the future of biotechnology», abstract book. Russia, Ufa, 2018, p. 121 [Кимеклис А.К., Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафронова В.И., Белимов А.А., Онищук О.П., Курчак О.Н., Гладков Г.В., Аксёнова Т.С., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Генетический анализ ризобий из трёх популяций реликтового бобового растения Vavilovia formosa. Международная научная конференция PLAMIC2018 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего», сборник тезисов, Уфа, 2018, стр. 121]
  52. Gladkov, G.V., Kimeklis A.K., Onishchuk O.P., Kurchak O.N., Puhalsky Ya.V., Safronova V.I., Belimov Andronov E.E., Provorov N.A. Host specificities of microsymbionts relic legumes Vavilovia formosa. International Scientific Conference PLAMIC2018 «Plants and microbes: the future of biotechnology», abstract book. Russia, Ufa, 2018, p. 121 [Гладков Г.В., Кимеклис А.К., Онищук О.П., Курчак О.Н., Пухальский Я.В., Сафронова В.И., Белимов А.А., Андронов Е.Е., Проворов Н.А. Хозяйская специфичность микросимбионтов реликтового бобового Vavilovia formosa. Международная научная конференция PLAMIC2018 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего», сборник тезисов, Уфа, 2018, стр. 121]
  53. А.К. Кимеклис*,**, Я.А. Дмитракова*, Е.А. Першина*,**, Е.А. Иванова*,**, А.О. Зверев*,**, Г.В. Гладков**, А.А. Кичко**, Е.Е. Андронов*,**,***, Е.В. Абакумов* СОСТОЯНИЕ МИКРОБИОМА НАРУШЕННЫХ ПОЧВ КИНГИСЕППСКОГО МЕСТОРОЖДЕНИЯ ФОСФОРИТОВ ПОСЛЕ ИХ РЕКУЛЬТИВАЦИИ. Сборник трудов Международной молодежной научной конференции «Генетическая и агрономическая оценка почв» /Российский государственный аграрный университет – МСХА им. К. А. Тимирязева. - Москва: РГАУ-МСХА им. К. А. Тимирязева. 2018. 229 с.
  54. A.K. Kimeklis, V. I. Safronova, A. A. Belimov, I. G. Kuznetsova, A. L. Sazanova, E. E. Andronov, N.A. Provorov. Divergence of nucleotide sequences of symbiotic genes indicates the early stages of speciation in Rhizobium leguminosarum bv. viciae isolated form relict legume Vavilovia formosa // Proceedings of the 20th International Congress on Nitrogen Fixation, Granada (Spain), 2017, p. 71
  55. Леонова М.А., Афонюшкин В.Н., Андронов Е.Е., Кимеклис А.К. Метагеномный анализ микробиоты кишечника сельскохозяйственной птицы в новосибирской области. // Сборник научных трудов Всероссийского научно-исследовательского института овцеводства и козоводства. 2015. Т. 1. № 8. С. 453-455.
  56. A.K. Kimeklis; V. I. Safronova; I. G. Kuznetsova; A. L. Sazanova; A. A. Belimov; E. E. Andronov; A. G. Pinaev; A. R. Pukhaev; K. P. Popov; J. A. Akopian; A. Willems. Relict Vavilovia formosa rhizobia-legume symbiosis: so unlike the others// VI International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology – BioMicroWorld2015, Barcelona (Spain), p.413, 2015
  57. Anastasiia K. Kimeklis, Vera I. Safronova, Elena P. Chizhevskaya, Andrey A. Belimov, Evgeny E. Andronov, Andrey R. Pukhaev, Konstantin P. Popov. Phylogenetic diversity among rhizobia isolated from the relict leguminous plant Vavilovia formosa (Stev.) Fed. growing in North Ossetia // Book of Abstracts, V International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology - BioMicroWorld2013, Madrid, Formatex, p. 54, 2013.
  58. Кимеклис А.К., Сулима А.С., Сафронова В.И., Белимов А.А., Чижевская Е.П., Пинаев А.Г., Пухаев А.Е., Попов К.П., Андронов Е.Е. Особенности симбиотических систем реликтового бобового растения Vavilovia formosa (Stev.) An. Fed. и его ризобий// 18-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология – наука XXI века», Сборник тезисов, Пущино, 2014, стр. 212-213. http://vk.com/doc3202157_292961307
  59. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Белимов А.А., Чижевская Е.П., Пинаев А.Г., Проворов Н.А., Пухаев А.Е., Попов К.П., Андронов Е.Е. Vavilovia formosa: новая генетическая модель для изучения эволюции бобово-ризобиального симбиоза// VI Съезд ВОГиС и ассоциированные генетические симпозиумы, Сборник тезисов, Ростов-на-Дону, 2014, стр. 202-203. http://conf.ict.nsc.ru/vogis2014/ru/proceedings
  60. Кимеклис А.К., Сафронова В.И., Чижевская Е.П., Белимов А.А., Пухаев А.Е., Попов К.П., Андронов Е.Е. Филогенетический анализ микросимбионтов vavilovia formosa в хромосомных и симбиотических участках генома// 17-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология – наука XXI века», Пущино, 2013.
  61. Кимеклис А.К., Петрова С.Н., Першина Е.В., Пинаев А.Г., Андронов Е.Е. Перспективы использования данных анализа ДНК почвенного микробиома в оценке агроэкологического состояния почв// VI Съезд общества почвоведов ИМ. в. в. Докучаева, Петрозаводск-Москва, 2011.

   

  Другое

  62. Кимеклис А.К., Кутовая О.В. Методы выделения и анализа почвенной ДНК. // В сборнике: Основные достижения и перспективы почвенной метагеномики Санкт-Петербург, 2017. С. 18-44.
  63. Проворов Н.А., Тихонович И.А., Андронов Е.Е., Воробьев Н.И., Онищук О.П., Курчак О.Н., Чижевская Е.П., Сафронова В.И., Белимов А.А., Кимеклис А.К., Чирак Е.Р., Жуков В.А., Долгих Е.А., Борисов А.Ю., Штарк О.Ю., Жернаков А.И., Сулима А.С., Копать В.В. Генетические основы эволюции ризобий – симбионтов растений. // Санкт-Петербург, 2016.